More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1299 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1299  peptide chain release factor 2  100 
 
 
321 aa  655    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0921443  normal  0.567483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2575  peptide chain release factor 2  67.92 
 
 
367 aa  431  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  65.51 
 
 
323 aa  428  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2040  peptide chain release factor 2  63.32 
 
 
322 aa  424  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  68.67 
 
 
322 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  64.47 
 
 
375 aa  418  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1715  peptide chain release factor 2  64.24 
 
 
322 aa  413  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.833664  normal  0.278616 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  63.21 
 
 
322 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  62.66 
 
 
376 aa  408  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  63.32 
 
 
344 aa  411  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3006  peptide chain release factor 2  65.82 
 
 
322 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.743846  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2445  peptide chain release factor 2  65.51 
 
 
322 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.689282  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1825  peptide chain release factor 2  62.66 
 
 
322 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0961  peptide chain release factor 2  65.42 
 
 
342 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  hitchhiker  0.00626958 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  64.87 
 
 
376 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3208  peptide chain release factor 2  60.87 
 
 
321 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3166  peptide chain release factor 2  61.25 
 
 
321 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  65.94 
 
 
375 aa  403  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  61.71 
 
 
321 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2982  peptide chain release factor 2  60.87 
 
 
321 aa  402  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.186364  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  60.12 
 
 
323 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  60.82 
 
 
375 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2851  peptide chain release factor 2  63.29 
 
 
322 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205155  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  61.71 
 
 
376 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5845  peptide chain release factor 2  60.19 
 
 
321 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  64.58 
 
 
376 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  62.15 
 
 
375 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5077  peptide chain release factor 2  61.44 
 
 
321 aa  391  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30933  normal  0.0341665 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  61.08 
 
 
375 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1305  peptide chain release factor 2  63.61 
 
 
376 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  60.38 
 
 
376 aa  382  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4671  peptide chain release factor 2  60.76 
 
 
322 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2977  peptide chain release factor 2  59.62 
 
 
375 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  58.04 
 
 
375 aa  375  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1856  peptide chain release factor 2  59.31 
 
 
375 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1623  peptide chain release factor 2  59.31 
 
 
375 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622299  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  58.04 
 
 
402 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0868  peptide chain release factor 2  56.78 
 
 
374 aa  366  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395021  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  56.6 
 
 
379 aa  365  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  55.02 
 
 
367 aa  351  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  54.66 
 
 
365 aa  349  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  54.66 
 
 
365 aa  349  3e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  54.66 
 
 
365 aa  349  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  54.66 
 
 
365 aa  349  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  54.34 
 
 
365 aa  348  9e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0725  peptide chain release factor 2  52.72 
 
 
332 aa  346  3e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159955  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  54.02 
 
 
365 aa  345  8e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1216  peptide chain release factor 2  56.13 
 
 
347 aa  344  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000777998  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  51.6 
 
 
365 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0705  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  50.48 
 
 
366 aa  341  8e-93  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0350  peptide chain release factor 2  50.16 
 
 
335 aa  340  1e-92  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  54.05 
 
 
391 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  53.05 
 
 
365 aa  340  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0923  peptide chain release factor 2  53.38 
 
 
310 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  53.38 
 
 
365 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  53.05 
 
 
365 aa  339  4e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  54.05 
 
 
367 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  54.05 
 
 
367 aa  338  9e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  53.05 
 
 
349 aa  338  9e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  54.05 
 
 
367 aa  338  9e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  53.05 
 
 
365 aa  337  9.999999999999999e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  54.02 
 
 
365 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  53.4 
 
 
459 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2274  peptide chain release factor 2  52.43 
 
 
310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  53.72 
 
 
391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  53.05 
 
 
349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  53.72 
 
 
391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  53.72 
 
 
391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  53.05 
 
 
325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  52.41 
 
 
365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  51.59 
 
 
364 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  53.4 
 
 
406 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  52.1 
 
 
364 aa  334  1e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2844  peptide chain release factor 2  52.75 
 
 
325 aa  333  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  52.43 
 
 
354 aa  333  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2533  peptide chain release factor 2  55.84 
 
 
375 aa  332  7.000000000000001e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  52.73 
 
 
364 aa  329  4e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0049  peptide chain release factor 2  56.01 
 
 
291 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  50.64 
 
 
369 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2271  peptide chain release factor 2  51.46 
 
 
310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  54.19 
 
 
372 aa  326  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0793  peptide chain release factor 2  50.16 
 
 
331 aa  325  5e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3429  peptide chain release factor 2  51.77 
 
 
329 aa  325  6e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883546 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  52.88 
 
 
367 aa  325  7e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0584  peptide chain release factor 2  52.24 
 
 
366 aa  325  7e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1310  peptide chain release factor 2  51.46 
 
 
329 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.496606  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  52.56 
 
 
367 aa  324  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  51.46 
 
 
332 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3371  peptide chain release factor 2  51.78 
 
 
378 aa  323  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518428  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  50.81 
 
 
417 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0456  peptide chain release factor 2  51.45 
 
 
338 aa  323  4e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.454858  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4122  peptide chain release factor 2  53.63 
 
 
304 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  52.56 
 
 
357 aa  322  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  51.28 
 
 
359 aa  322  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00072  peptide chain release factor 2  51.77 
 
 
329 aa  322  7e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4227  peptide chain release factor 2  53.98 
 
 
304 aa  321  8e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358427  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  52.9 
 
 
326 aa  321  9.000000000000001e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  50.81 
 
 
357 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  52.56 
 
 
317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  50.49 
 
 
349 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>