More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3275 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 322 aa  652    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  74.53 
 
 		 344 aa  502  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2982  peptide chain release factor 2  74.14 
 
 		 321 aa  498  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.186364  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3208  peptide chain release factor 2  74.14 
 
 		 321 aa  498  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3166  peptide chain release factor 2  73.83 
 
 		 321 aa  496  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  74.92 
 
 		 322 aa  494  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  73.29 
 
 		 375 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5845  peptide chain release factor 2  73.21 
 
 		 321 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  72.05 
 
 		 375 aa  484  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5077  peptide chain release factor 2  73.83 
 
 		 321 aa  483  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30933  normal  0.0341665 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  71.03 
 
 		 321 aa  478  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  75.23 
 
 		 376 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0961  peptide chain release factor 2  74.69 
 
 		 342 aa  475  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  hitchhiker  0.00626958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  69.97 
 
 		 323 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2040  peptide chain release factor 2  70 
 
 		 322 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1305  peptide chain release factor 2  75.4 
 
 		 376 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  69.04 
 
 		 376 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  68.73 
 
 		 376 aa  456  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  68.94 
 
 		 376 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3006  peptide chain release factor 2  70.5 
 
 		 322 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.743846  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2445  peptide chain release factor 2  70.5 
 
 		 322 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.689282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  70.81 
 
 		 375 aa  451  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1715  peptide chain release factor 2  68.01 
 
 		 322 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.833664  normal  0.278616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  69.35 
 
 		 376 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  66.77 
 
 		 375 aa  446  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1825  peptide chain release factor 2  68.32 
 
 		 322 aa  444  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  69.25 
 
 		 375 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4671  peptide chain release factor 2  67.7 
 
 		 322 aa  443  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2851  peptide chain release factor 2  69.57 
 
 		 322 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2977  peptide chain release factor 2  68.69 
 
 		 375 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1623  peptide chain release factor 2  68.69 
 
 		 375 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622299  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  69.01 
 
 		 402 aa  437  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2575  peptide chain release factor 2  68.28 
 
 		 367 aa  431  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1856  peptide chain release factor 2  68.37 
 
 		 375 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  66.56 
 
 		 323 aa  433  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  66.77 
 
 		 375 aa  424  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1299  peptide chain release factor 2  68.67 
 
 		 321 aa  407  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0921443  normal  0.567483 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0868  peptide chain release factor 2  61.66 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2533  peptide chain release factor 2  64.54 
 
 		 375 aa  382  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  59.11 
 
 		 379 aa  378  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  59.28 
 
 		 372 aa  371  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  58.96 
 
 		 364 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  56.68 
 
 		 317 aa  364  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3371  peptide chain release factor 2  58.03 
 
 		 378 aa  363  3e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  57.65 
 
 		 349 aa  363  3e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  57.65 
 
 		 364 aa  362  6e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  57.38 
 
 		 382 aa  361  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  57.98 
 
 		 349 aa  361  8e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  57.65 
 
 		 365 aa  360  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0350  peptide chain release factor 2  52.88 
 
 		 335 aa  360  2e-98  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  54.75 
 
 		 417 aa  358  7e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  56.72 
 
 		 332 aa  358  8e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  57 
 
 		 367 aa  358  9e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  57 
 
 		 367 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  57 
 
 		 367 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0705  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  52.24 
 
 		 366 aa  357  9.999999999999999e-98  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  56.49 
 
 		 371 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  57.19 
 
 		 391 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  56.39 
 
 		 406 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  58.03 
 
 		 367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  57.7 
 
 		 367 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  56.07 
 
 		 357 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  55.37 
 
 		 325 aa  355  5e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  56.39 
 
 		 357 aa  355  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4122  peptide chain release factor 2  57.59 
 
 		 304 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  56.35 
 
 		 391 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  56.35 
 
 		 391 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  56.35 
 
 		 391 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  52.9 
 
 		 365 aa  353  2e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  54.75 
 
 		 354 aa  353  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4227  peptide chain release factor 2  58.28 
 
 		 304 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358427  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  53.25 
 
 		 369 aa  352  5e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  53.55 
 
 		 364 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  56.07 
 
 		 367 aa  351  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1310  peptide chain release factor 2  56.07 
 
 		 329 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.496606  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  56.03 
 
 		 459 aa  351  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  56.03 
 
 		 365 aa  350  2e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  56.68 
 
 		 326 aa  349  3e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  57.28 
 
 		 366 aa  350  3e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1030  peptide chain release factor 2 protein  57.93 
 
 		 300 aa  349  4e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  56.03 
 
 		 365 aa  348  6e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1100  peptide chain release factor 2  58.97 
 
 		 304 aa  348  6e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  54.72 
 
 		 365 aa  348  8e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1216  peptide chain release factor 2  57.84 
 
 		 347 aa  348  9e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000777998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  55.37 
 
 		 364 aa  347  1e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2844  peptide chain release factor 2  54.43 
 
 		 325 aa  347  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  56.03 
 
 		 365 aa  347  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  55.7 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  55.7 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  55.7 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  55.7 
 
 		 365 aa  346  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  54.46 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  55.7 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0923  peptide chain release factor 2  55.34 
 
 		 310 aa  346  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2274  peptide chain release factor 2  54.4 
 
 		 310 aa  346  3e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  56.8 
 
 		 367 aa  346  3e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  54.1 
 
 		 359 aa  345  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  55.37 
 
 		 365 aa  346  4e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  56.46 
 
 		 367 aa  345  4e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  55.37 
 
 		 365 aa  346  4e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>