More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0721 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  766    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  86.7 
 
 		 376 aa  688    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  72.87 
 
 		 375 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  71.28 
 
 		 376 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1305  peptide chain release factor 2  70.49 
 
 		 376 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  65.96 
 
 		 376 aa  509  1e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  67.82 
 
 		 375 aa  508  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  65.16 
 
 		 375 aa  510  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  71.35 
 
 		 344 aa  503  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  66.49 
 
 		 376 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5845  peptide chain release factor 2  73.6 
 
 		 321 aa  499  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0961  peptide chain release factor 2  71.26 
 
 		 342 aa  492  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  hitchhiker  0.00626958 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3166  peptide chain release factor 2  72.67 
 
 		 321 aa  489  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2982  peptide chain release factor 2  72.05 
 
 		 321 aa  487  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.186364  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3208  peptide chain release factor 2  72.05 
 
 		 321 aa  487  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  65.69 
 
 		 375 aa  481  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  61.7 
 
 		 375 aa  481  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  70.5 
 
 		 322 aa  472  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5077  peptide chain release factor 2  71.74 
 
 		 321 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30933  normal  0.0341665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2575  peptide chain release factor 2  64.33 
 
 		 367 aa  460  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4671  peptide chain release factor 2  69.57 
 
 		 322 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  66.77 
 
 		 321 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  65.63 
 
 		 323 aa  447  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  69.04 
 
 		 322 aa  449  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1623  peptide chain release factor 2  59.29 
 
 		 375 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622299  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2977  peptide chain release factor 2  59.29 
 
 		 375 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1856  peptide chain release factor 2  59.56 
 
 		 375 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1715  peptide chain release factor 2  65.53 
 
 		 322 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.833664  normal  0.278616 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1825  peptide chain release factor 2  65.53 
 
 		 322 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  57.65 
 
 		 375 aa  435  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3006  peptide chain release factor 2  65.84 
 
 		 322 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.743846  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2445  peptide chain release factor 2  65.84 
 
 		 322 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.689282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  57.38 
 
 		 402 aa  426  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2040  peptide chain release factor 2  63.14 
 
 		 322 aa  424  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2851  peptide chain release factor 2  65.22 
 
 		 322 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0868  peptide chain release factor 2  57.38 
 
 		 374 aa  423  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  62.38 
 
 		 323 aa  414  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2533  peptide chain release factor 2  56.28 
 
 		 375 aa  411  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  53.89 
 
 		 372 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  53.63 
 
 		 379 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0604  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  51.38 
 
 		 365 aa  379  1e-104  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1299  peptide chain release factor 2  62.66 
 
 		 321 aa  377  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0921443  normal  0.567483 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  51.6 
 
 		 367 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  52.05 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0705  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  49.3 
 
 		 366 aa  373  1e-102  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  51.6 
 
 		 367 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  53.85 
 
 		 364 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  51.34 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  52.02 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  53.85 
 
 		 349 aa  367  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  52.65 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  53.25 
 
 		 349 aa  366  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  52.1 
 
 		 371 aa  368  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  53.31 
 
 		 382 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  50.28 
 
 		 365 aa  363  3e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  54.44 
 
 		 406 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  49.43 
 
 		 364 aa  363  4e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  54.41 
 
 		 391 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  54.41 
 
 		 391 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  54.41 
 
 		 391 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  48.86 
 
 		 367 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  57 
 
 		 317 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  50.28 
 
 		 365 aa  362  7.0000000000000005e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  54.14 
 
 		 391 aa  362  8e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  51.43 
 
 		 374 aa  360  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  49.58 
 
 		 365 aa  360  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  49.72 
 
 		 364 aa  360  2e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  51.66 
 
 		 364 aa  360  2e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  52.27 
 
 		 332 aa  359  4e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  51.5 
 
 		 417 aa  359  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  49.15 
 
 		 365 aa  358  6e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  46.96 
 
 		 367 aa  358  8e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  49.15 
 
 		 365 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  49.15 
 
 		 365 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  48.31 
 
 		 380 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  49.15 
 
 		 365 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  49.15 
 
 		 365 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  51.45 
 
 		 367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  48.31 
 
 		 380 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  49.18 
 
 		 369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  48.6 
 
 		 367 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  51.16 
 
 		 367 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  48.03 
 
 		 380 aa  355  5e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  55.17 
 
 		 326 aa  355  7.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  49.15 
 
 		 365 aa  355  7.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  51.2 
 
 		 359 aa  355  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  48.44 
 
 		 375 aa  355  1e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  48.03 
 
 		 380 aa  354  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  48.86 
 
 		 365 aa  354  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  51.56 
 
 		 383 aa  354  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  50.14 
 
 		 349 aa  354  2e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  49.42 
 
 		 349 aa  353  2e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  50.9 
 
 		 357 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  51.98 
 
 		 361 aa  353  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  53.29 
 
 		 325 aa  354  2e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  48.32 
 
 		 369 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1310  peptide chain release factor 2  51.52 
 
 		 329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.496606  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  51.27 
 
 		 366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  48.58 
 
 		 365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  50.58 
 
 		 349 aa  352  5e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>