More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3007 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  93.19 
 
 		 367 aa  717    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  100 
 
 		 367 aa  756    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  80.55 
 
 		 380 aa  627  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  80.27 
 
 		 380 aa  624  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  80.55 
 
 		 380 aa  624  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  80.27 
 
 		 380 aa  624  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  82.52 
 
 		 327 aa  578  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  81.9 
 
 		 326 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  81.9 
 
 		 326 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  81.6 
 
 		 326 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  80.67 
 
 		 326 aa  568  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  69.61 
 
 		 383 aa  522  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  66.12 
 
 		 369 aa  517  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  66.67 
 
 		 371 aa  508  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  68.2 
 
 		 331 aa  482  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  60.61 
 
 		 372 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  57.98 
 
 		 366 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  57.78 
 
 		 377 aa  444  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  64.62 
 
 		 330 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  57.89 
 
 		 368 aa  437  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  55.62 
 
 		 365 aa  435  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  62.11 
 
 		 330 aa  428  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  56.9 
 
 		 362 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  56.04 
 
 		 364 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  60.68 
 
 		 332 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  61.96 
 
 		 332 aa  427  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  57.02 
 
 		 373 aa  427  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  58.82 
 
 		 357 aa  422  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  58.15 
 
 		 364 aa  422  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  55.65 
 
 		 367 aa  420  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  54.82 
 
 		 367 aa  418  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  53.83 
 
 		 372 aa  420  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  57.58 
 
 		 369 aa  414  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  54.1 
 
 		 372 aa  416  9.999999999999999e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  58.82 
 
 		 332 aa  413  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  55.03 
 
 		 366 aa  405  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  53.69 
 
 		 372 aa  401  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  51.65 
 
 		 367 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  53.06 
 
 		 374 aa  403  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  61.23 
 
 		 331 aa  395  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  54.42 
 
 		 369 aa  395  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  53.02 
 
 		 375 aa  394  1e-108  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  57.58 
 
 		 337 aa  393  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  55.25 
 
 		 329 aa  389  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  53.26 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  50.68 
 
 		 367 aa  385  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  51.39 
 
 		 379 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  52.12 
 
 		 372 aa  386  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  54.12 
 
 		 364 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  55.38 
 
 		 334 aa  383  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  58.97 
 
 		 330 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  50.82 
 
 		 367 aa  378  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2216  peptide chain release factor 2 (bRF-2)  58.81 
 
 		 344 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00549966  hitchhiker  0.00000471368 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  48.9 
 
 		 371 aa  380  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  56.92 
 
 		 362 aa  376  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0257  peptide chain release factor 2  59.44 
 
 		 333 aa  376  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000258105  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  52.63 
 
 		 362 aa  373  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  50.27 
 
 		 365 aa  374  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  50.69 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  54.01 
 
 		 326 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  52.6 
 
 		 341 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  53.37 
 
 		 361 aa  368  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  49.72 
 
 		 376 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  51.25 
 
 		 375 aa  366  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  48.6 
 
 		 376 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  50.14 
 
 		 371 aa  367  1e-100  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  48.06 
 
 		 367 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  48.06 
 
 		 459 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1938  hypothetical protein  47.79 
 
 		 370 aa  364  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374727  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  48.06 
 
 		 367 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  52.05 
 
 		 357 aa  363  3e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  50.58 
 
 		 361 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 369 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  47.96 
 
 		 371 aa  361  9e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  51.17 
 
 		 356 aa  361  1e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 368 aa  360  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  47.78 
 
 		 367 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  52.29 
 
 		 343 aa  360  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  49.72 
 
 		 366 aa  360  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  49.86 
 
 		 375 aa  360  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  49.45 
 
 		 375 aa  358  6e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1805  peptide chain release factor 2  49.71 
 
 		 358 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.361195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1409  peptide chain release factor 2  53.54 
 
 		 330 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0056831  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  54.24 
 
 		 340 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  49.44 
 
 		 378 aa  355  5e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  48.77 
 
 		 375 aa  355  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  48.9 
 
 		 365 aa  355  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  47.24 
 
 		 375 aa  354  1e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  46.99 
 
 		 365 aa  353  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  46.99 
 
 		 365 aa  353  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  47.8 
 
 		 369 aa  353  2e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  55.56 
 
 		 312 aa  352  4e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  48.18 
 
 		 367 aa  352  5e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  46.45 
 
 		 365 aa  352  8e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1904  peptide chain release factor 2  51.05 
 
 		 337 aa  352  8e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.430397  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  51.69 
 
 		 375 aa  352  8e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  50.42 
 
 		 402 aa  352  8e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  49.58 
 
 		 372 aa  352  8.999999999999999e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  49.15 
 
 		 369 aa  351  1e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  47.47 
 
 		 406 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>