More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0257 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0257  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 333 aa  692    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000258105  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  59.7 
 
 		 357 aa  419  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  60 
 
 		 373 aa  408  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  58.82 
 
 		 367 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  57.28 
 
 		 327 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  58.18 
 
 		 380 aa  396  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  57.59 
 
 		 326 aa  395  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  57.59 
 
 		 326 aa  395  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  58.49 
 
 		 380 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  59.44 
 
 		 367 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  57.59 
 
 		 380 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  58.18 
 
 		 380 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  57.28 
 
 		 326 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  56.62 
 
 		 383 aa  392  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  57.23 
 
 		 326 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  58.2 
 
 		 330 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  55.66 
 
 		 372 aa  384  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  56.21 
 
 		 362 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  56.21 
 
 		 364 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  55.56 
 
 		 368 aa  375  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  54.63 
 
 		 330 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  55.86 
 
 		 331 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  55.86 
 
 		 369 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  55.97 
 
 		 366 aa  366  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  51.08 
 
 		 377 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  52.47 
 
 		 366 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  54.01 
 
 		 330 aa  363  3e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  57.05 
 
 		 367 aa  362  5.0000000000000005e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  52.74 
 
 		 332 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  51.07 
 
 		 332 aa  355  5e-97  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  50.46 
 
 		 367 aa  353  2e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 		 367 aa  353  2e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  55.25 
 
 		 371 aa  352  5e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  55.31 
 
 		 364 aa  352  5.9999999999999994e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  52.78 
 
 		 332 aa  349  5e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  50.77 
 
 		 329 aa  348  9e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  55.35 
 
 		 369 aa  348  1e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 		 372 aa  347  2e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  52.28 
 
 		 369 aa  345  4e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  50.77 
 
 		 334 aa  343  2.9999999999999997e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  53.25 
 
 		 375 aa  342  5.999999999999999e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2216  peptide chain release factor 2 (bRF-2)  54.94 
 
 		 344 aa  340  2e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00549966  hitchhiker  0.00000471368 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  49.69 
 
 		 341 aa  340  2.9999999999999998e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  48.92 
 
 		 372 aa  338  7e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  51.25 
 
 		 362 aa  338  9e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  49.7 
 
 		 369 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  50.46 
 
 		 343 aa  335  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  50.62 
 
 		 372 aa  334  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  47.66 
 
 		 367 aa  334  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  50.47 
 
 		 356 aa  333  3e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  52.86 
 
 		 312 aa  333  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1938  hypothetical protein  50.46 
 
 		 370 aa  332  5e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374727  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  49.38 
 
 		 326 aa  331  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 378 aa  330  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 374 aa  331  1e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  50.77 
 
 		 367 aa  331  1e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  50.62 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1805  peptide chain release factor 2  48.77 
 
 		 358 aa  330  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.361195  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  52.6 
 
 		 331 aa  330  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  50.62 
 
 		 337 aa  330  2e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  50.16 
 
 		 379 aa  329  3e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  50.47 
 
 		 364 aa  329  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1302  peptide chain release factor 2  52.33 
 
 		 310 aa  329  4e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.240882  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  48.9 
 
 		 372 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  48.18 
 
 		 378 aa  328  5.0000000000000004e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  47.22 
 
 		 365 aa  328  7e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  51.54 
 
 		 375 aa  328  7e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  49.07 
 
 		 375 aa  328  8e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  50.31 
 
 		 378 aa  327  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  49.54 
 
 		 366 aa  327  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  46.65 
 
 		 371 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 375 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 		 375 aa  326  3e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  49.23 
 
 		 349 aa  326  3e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  49.69 
 
 		 372 aa  326  4.0000000000000003e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  50.16 
 
 		 364 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  49.69 
 
 		 356 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  52.02 
 
 		 362 aa  325  5e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 375 aa  325  9e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  50.31 
 
 		 365 aa  324  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  50.31 
 
 		 365 aa  324  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  50.31 
 
 		 365 aa  324  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  50.31 
 
 		 365 aa  324  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  49.54 
 
 		 372 aa  324  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  50.31 
 
 		 365 aa  323  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  48.29 
 
 		 356 aa  323  2e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  50 
 
 		 371 aa  323  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  50.94 
 
 		 365 aa  323  3e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  53.4 
 
 		 322 aa  323  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  50.46 
 
 		 365 aa  323  3e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2040  peptide chain release factor 2  52.75 
 
 		 322 aa  322  5e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 365 aa  322  6e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  48.31 
 
 		 372 aa  322  7e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  50.46 
 
 		 365 aa  321  9.000000000000001e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  47.68 
 
 		 349 aa  321  9.000000000000001e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2533  peptide chain release factor 2  51.86 
 
 		 375 aa  319  3.9999999999999996e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  49.54 
 
 		 365 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  48.45 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  50.62 
 
 		 344 aa  319  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  47.66 
 
 		 361 aa  317  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>