More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1248 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 367 aa  753    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  54.72 
 
 		 373 aa  402  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  55.07 
 
 		 357 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  51.36 
 
 		 367 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  56.75 
 
 		 330 aa  378  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  52.73 
 
 		 383 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  52.22 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  51.69 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  51.69 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  51.93 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  50.28 
 
 		 366 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  51.24 
 
 		 368 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  49.86 
 
 		 380 aa  368  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  50.68 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  48.48 
 
 		 377 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  56.66 
 
 		 332 aa  366  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  49.58 
 
 		 367 aa  366  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  49.86 
 
 		 380 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  49.59 
 
 		 380 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  49.86 
 
 		 380 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  49.31 
 
 		 367 aa  366  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  49.73 
 
 		 375 aa  363  2e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  55.49 
 
 		 332 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  50.7 
 
 		 364 aa  362  4e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  50.41 
 
 		 369 aa  361  1e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  48.33 
 
 		 367 aa  361  1e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  49.58 
 
 		 366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  54.6 
 
 		 330 aa  354  1e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  49.86 
 
 		 371 aa  354  2e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  52.33 
 
 		 364 aa  352  7e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  46.13 
 
 		 375 aa  350  2e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  49.3 
 
 		 372 aa  350  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  48.47 
 
 		 366 aa  348  7e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  48.31 
 
 		 371 aa  347  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  52.17 
 
 		 330 aa  347  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 369 aa  346  5e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  52.02 
 
 		 326 aa  344  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  51.86 
 
 		 327 aa  345  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  46.41 
 
 		 365 aa  344  1e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  55.08 
 
 		 331 aa  344  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  52.47 
 
 		 331 aa  344  2e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  52.17 
 
 		 326 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  52.17 
 
 		 326 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  52.63 
 
 		 326 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  48.58 
 
 		 378 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1856  peptide chain release factor 2  46.11 
 
 		 375 aa  342  9e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2977  peptide chain release factor 2  46.39 
 
 		 375 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  46.69 
 
 		 364 aa  341  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  47.12 
 
 		 375 aa  340  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  51.86 
 
 		 326 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  47.44 
 
 		 374 aa  340  2e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1623  peptide chain release factor 2  46.39 
 
 		 375 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622299  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  45.88 
 
 		 365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  46.39 
 
 		 402 aa  336  5e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  48.61 
 
 		 376 aa  335  7.999999999999999e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  47.49 
 
 		 379 aa  335  9e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  47.61 
 
 		 372 aa  334  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  51.08 
 
 		 332 aa  334  1e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2216  peptide chain release factor 2 (bRF-2)  53.24 
 
 		 344 aa  333  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00549966  hitchhiker  0.00000471368 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2533  peptide chain release factor 2  46.11 
 
 		 375 aa  333  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  50.75 
 
 		 340 aa  334  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  43.92 
 
 		 367 aa  334  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  46.96 
 
 		 376 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  47.06 
 
 		 362 aa  333  4e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  46.22 
 
 		 376 aa  333  4e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  51.1 
 
 		 362 aa  332  5e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  47.72 
 
 		 334 aa  332  7.000000000000001e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0868  peptide chain release factor 2  46.13 
 
 		 374 aa  332  8e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  47.93 
 
 		 378 aa  330  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  49.11 
 
 		 337 aa  330  2e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  46.46 
 
 		 372 aa  330  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  45.3 
 
 		 364 aa  328  8e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  47.44 
 
 		 378 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  45.88 
 
 		 361 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  44.6 
 
 		 357 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  45.88 
 
 		 356 aa  327  3e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  47.29 
 
 		 344 aa  327  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  45.61 
 
 		 368 aa  326  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  46.94 
 
 		 372 aa  326  5e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  44.97 
 
 		 378 aa  326  5e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  47.16 
 
 		 375 aa  325  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  45.63 
 
 		 371 aa  325  1e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  49.1 
 
 		 361 aa  324  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  45.21 
 
 		 365 aa  323  3e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  44.2 
 
 		 376 aa  322  6e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0942  peptide chain release factor 2  46.8 
 
 		 374 aa  322  7e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0440008  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  45.4 
 
 		 371 aa  322  7e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  45.4 
 
 		 371 aa  322  7e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  45.3 
 
 		 375 aa  322  9.000000000000001e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  47.32 
 
 		 369 aa  322  9.000000000000001e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  45.4 
 
 		 371 aa  322  9.000000000000001e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  44.69 
 
 		 367 aa  321  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  45.18 
 
 		 371 aa  321  9.999999999999999e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  46.33 
 
 		 372 aa  321  9.999999999999999e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  49.38 
 
 		 369 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  44.9 
 
 		 372 aa  321  9.999999999999999e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  43.92 
 
 		 375 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  45.48 
 
 		 374 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  45.6 
 
 		 365 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  47.65 
 
 		 356 aa  319  3.9999999999999996e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>