More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0544 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  89.27 
 
 		 362 aa  660    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  95.51 
 
 		 357 aa  708    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 356 aa  733    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  54.12 
 
 		 372 aa  383  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  51.17 
 
 		 367 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  51.18 
 
 		 357 aa  362  4e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  51.46 
 
 		 367 aa  362  6e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  52.44 
 
 		 367 aa  362  6e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  52.31 
 
 		 383 aa  360  1e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  54.18 
 
 		 330 aa  361  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  51.32 
 
 		 367 aa  360  1e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  50.3 
 
 		 373 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  49.71 
 
 		 368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  50.99 
 
 		 372 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  50.6 
 
 		 364 aa  352  5.9999999999999994e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 		 366 aa  349  5e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  49.71 
 
 		 380 aa  346  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  49.57 
 
 		 380 aa  346  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  49.29 
 
 		 380 aa  346  4e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  49 
 
 		 380 aa  345  5e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 332 aa  344  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  51.17 
 
 		 367 aa  342  4e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 		 366 aa  342  5e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4162  peptide chain release factor 2  51.9 
 
 		 317 aa  341  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.155408 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  50.32 
 
 		 369 aa  340  2e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  47.65 
 
 		 372 aa  340  2e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  47.11 
 
 		 369 aa  340  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  51.61 
 
 		 372 aa  338  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  51.51 
 
 		 337 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  47.16 
 
 		 367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1904  peptide chain release factor 2  49.24 
 
 		 337 aa  336  2.9999999999999997e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.430397  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  50.78 
 
 		 326 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  50.78 
 
 		 326 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  50.16 
 
 		 327 aa  336  5e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  47.18 
 
 		 362 aa  335  7e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  47.48 
 
 		 364 aa  335  7e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  50.78 
 
 		 326 aa  335  7.999999999999999e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  47.01 
 
 		 374 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  49.84 
 
 		 330 aa  335  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  50.47 
 
 		 326 aa  333  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  48.67 
 
 		 366 aa  333  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  49.12 
 
 		 372 aa  332  4e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3345  peptide chain release factor 2  50.79 
 
 		 317 aa  332  5e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.219994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  47.09 
 
 		 343 aa  331  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  48.01 
 
 		 331 aa  331  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  50.31 
 
 		 375 aa  329  4e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  51.25 
 
 		 330 aa  329  4e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  48.65 
 
 		 369 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  47.79 
 
 		 377 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  48.52 
 
 		 369 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  49.53 
 
 		 326 aa  328  9e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  48.97 
 
 		 378 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  46.75 
 
 		 372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  45.88 
 
 		 367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  47.04 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  46.65 
 
 		 371 aa  326  3e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  50.62 
 
 		 332 aa  327  3e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  48.37 
 
 		 366 aa  327  3e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  46.2 
 
 		 365 aa  327  3e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1409  peptide chain release factor 2  52.23 
 
 		 330 aa  325  6e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0056831  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  48.98 
 
 		 356 aa  325  7e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  44.73 
 
 		 371 aa  324  1e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  48.12 
 
 		 356 aa  323  3e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  49.38 
 
 		 332 aa  323  3e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2031  peptide chain release factor 2  48.22 
 
 		 363 aa  322  6e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0138456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  46.25 
 
 		 379 aa  322  8e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  47.95 
 
 		 360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  50.31 
 
 		 368 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3025  peptide chain release factor 2  48.66 
 
 		 371 aa  320  3e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2538  peptide chain release factor 2  47.63 
 
 		 363 aa  320  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  49.11 
 
 		 378 aa  319  6e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  46.96 
 
 		 371 aa  318  9e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  46.96 
 
 		 371 aa  318  9e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2784  peptide chain release factor 2  47.2 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.785261  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  48.48 
 
 		 331 aa  318  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  48.39 
 
 		 374 aa  318  1e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  46.96 
 
 		 371 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  47.35 
 
 		 361 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  47.09 
 
 		 362 aa  317  2e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1034  peptide chain release factor 2  47.63 
 
 		 370 aa  317  2e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  45.75 
 
 		 371 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  45.43 
 
 		 378 aa  317  3e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  47.18 
 
 		 370 aa  316  3e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  47.67 
 
 		 372 aa  316  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20340  peptide chain release factor 2  46.45 
 
 		 371 aa  316  5e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0863  peptide chain release factor 2  46.61 
 
 		 369 aa  315  8e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  44.51 
 
 		 365 aa  314  9.999999999999999e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0209  peptide chain release factor 2  48.15 
 
 		 381 aa  314  9.999999999999999e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0238  peptide chain release factor 2  48.39 
 
 		 363 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000385966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  47.35 
 
 		 375 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  46.05 
 
 		 364 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  46.59 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5751  hypothetical protein  47.32 
 
 		 358 aa  313  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  49.24 
 
 		 373 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  46.31 
 
 		 378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  48.55 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  47.08 
 
 		 375 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  48.94 
 
 		 373 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1899  peptide chain release factor 2  43.45 
 
 		 367 aa  312  4.999999999999999e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0199155  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  47.08 
 
 		 365 aa  312  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>