More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1869 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  761    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  62.94 
 
 		 369 aa  496  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1938  hypothetical protein  61.79 
 
 		 370 aa  484  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374727  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1805  peptide chain release factor 2  65.87 
 
 		 358 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.361195  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0555  Peptide chain release factor 2  61.02 
 
 		 376 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000388438 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1302  peptide chain release factor 2  64.59 
 
 		 310 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.240882  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  48.62 
 
 		 367 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  50.28 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  50.7 
 
 		 377 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  49.44 
 
 		 383 aa  366  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  50.14 
 
 		 369 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  48.9 
 
 		 367 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  50.56 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  56.86 
 
 		 312 aa  362  6e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  47.65 
 
 		 380 aa  362  8e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  47.65 
 
 		 380 aa  360  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  47.37 
 
 		 380 aa  360  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  47.37 
 
 		 380 aa  358  6e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  47.88 
 
 		 367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  47.88 
 
 		 367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  53.7 
 
 		 331 aa  356  3.9999999999999996e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  50.14 
 
 		 373 aa  355  5.999999999999999e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  48.01 
 
 		 371 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  48.07 
 
 		 371 aa  354  1e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  53.52 
 
 		 343 aa  355  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  49.58 
 
 		 366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  52.1 
 
 		 332 aa  353  4e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  51.58 
 
 		 327 aa  352  7e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  47.41 
 
 		 372 aa  351  1e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  51.58 
 
 		 326 aa  350  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  51.58 
 
 		 326 aa  350  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  48.03 
 
 		 368 aa  350  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  52.32 
 
 		 326 aa  349  4e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  45.83 
 
 		 366 aa  349  5e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  50.29 
 
 		 357 aa  349  6e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  51.27 
 
 		 326 aa  347  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  50.28 
 
 		 364 aa  346  3e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  50.63 
 
 		 326 aa  344  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  57.04 
 
 		 369 aa  343  2e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  47.58 
 
 		 374 aa  342  9e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  47.85 
 
 		 329 aa  341  1e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  44.6 
 
 		 365 aa  340  2e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  47.44 
 
 		 369 aa  340  2e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  47.34 
 
 		 371 aa  340  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  46.26 
 
 		 367 aa  338  9.999999999999999e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  52.16 
 
 		 330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  51.08 
 
 		 330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  48.64 
 
 		 340 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  46.61 
 
 		 364 aa  335  5e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  45.92 
 
 		 362 aa  336  5e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  47.35 
 
 		 361 aa  335  5.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3791  hypothetical protein  45.83 
 
 		 367 aa  335  7e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  45.92 
 
 		 364 aa  335  7.999999999999999e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  49.68 
 
 		 317 aa  334  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 334 aa  335  1e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  52.65 
 
 		 330 aa  333  3e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  46.81 
 
 		 364 aa  333  4e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  44.6 
 
 		 372 aa  332  4e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  45.96 
 
 		 367 aa  332  6e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  45.96 
 
 		 367 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  46.56 
 
 		 367 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  51.39 
 
 		 331 aa  332  8e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  46.28 
 
 		 367 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  44.51 
 
 		 371 aa  331  1e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  48.31 
 
 		 332 aa  330  2e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  44.48 
 
 		 372 aa  330  2e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  45.68 
 
 		 367 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2031  peptide chain release factor 2  48.22 
 
 		 363 aa  328  6e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0138456  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  45.45 
 
 		 365 aa  328  9e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  45.45 
 
 		 365 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  46.31 
 
 		 362 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  45.45 
 
 		 365 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  47.34 
 
 		 391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  45.45 
 
 		 365 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  49.39 
 
 		 337 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  46.13 
 
 		 374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  50.49 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2538  peptide chain release factor 2  48.82 
 
 		 363 aa  327  3e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0500  peptide chain release factor 2  47.43 
 
 		 364 aa  327  3e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  46.75 
 
 		 359 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  44.73 
 
 		 357 aa  326  5e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1409  peptide chain release factor 2  50.79 
 
 		 330 aa  325  6e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0056831  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  48.04 
 
 		 364 aa  325  7e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  47.04 
 
 		 391 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  47.04 
 
 		 391 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  47.04 
 
 		 391 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  45.13 
 
 		 459 aa  325  9e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  44.73 
 
 		 356 aa  324  1e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0238  peptide chain release factor 2  50.63 
 
 		 363 aa  325  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000385966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  45.18 
 
 		 365 aa  324  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  52.12 
 
 		 323 aa  324  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  44.6 
 
 		 375 aa  324  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  45.86 
 
 		 365 aa  323  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  44.75 
 
 		 365 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  43.58 
 
 		 366 aa  323  2e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  47.04 
 
 		 406 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  47.58 
 
 		 417 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  45.63 
 
 		 367 aa  323  3e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1790  peptide chain release factor 2  50.45 
 
 		 365 aa  323  3e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.801319  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1048  hypothetical protein  49.69 
 
 		 332 aa  323  3e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>