More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_509 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  90.99 
 
 		 362 aa  658    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  95.51 
 
 		 356 aa  708    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 357 aa  735    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  53.53 
 
 		 372 aa  382  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  49.44 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  51.75 
 
 		 367 aa  363  3e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  51.83 
 
 		 372 aa  363  3e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  52.74 
 
 		 367 aa  361  1e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  53.87 
 
 		 330 aa  360  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 357 aa  359  4e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  52.13 
 
 		 367 aa  359  4e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  51.01 
 
 		 383 aa  356  2.9999999999999997e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  49.11 
 
 		 373 aa  354  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 		 364 aa  350  2e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  48.55 
 
 		 368 aa  348  9e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  49.25 
 
 		 366 aa  347  2e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  52.05 
 
 		 367 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  49.56 
 
 		 380 aa  343  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  49.43 
 
 		 380 aa  342  4e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  49.15 
 
 		 380 aa  343  4e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  49.15 
 
 		 380 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 369 aa  339  4e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4162  peptide chain release factor 2  51.58 
 
 		 317 aa  338  7e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.155408 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  49.11 
 
 		 366 aa  338  8e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  48.92 
 
 		 332 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  46.76 
 
 		 372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1904  peptide chain release factor 2  48.63 
 
 		 337 aa  336  2.9999999999999997e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.430397  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  49.86 
 
 		 372 aa  336  3.9999999999999995e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  46.57 
 
 		 367 aa  335  7e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  46.53 
 
 		 369 aa  334  1e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 		 337 aa  333  3e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  50.62 
 
 		 326 aa  332  4e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  50.62 
 
 		 326 aa  332  4e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  46.44 
 
 		 374 aa  332  6e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 327 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  50.31 
 
 		 326 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  47.71 
 
 		 343 aa  330  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  48.08 
 
 		 366 aa  330  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  47.79 
 
 		 377 aa  331  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  47.94 
 
 		 372 aa  330  2e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  49.38 
 
 		 330 aa  330  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  49.26 
 
 		 378 aa  329  4e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  49.53 
 
 		 326 aa  328  6e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3345  peptide chain release factor 2  50.47 
 
 		 317 aa  328  6e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.219994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  47.18 
 
 		 364 aa  328  9e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  44.6 
 
 		 367 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  46.88 
 
 		 362 aa  327  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  46.49 
 
 		 365 aa  328  1.0000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  48.95 
 
 		 369 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  47.34 
 
 		 364 aa  327  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  50.94 
 
 		 330 aa  326  3e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  46.75 
 
 		 372 aa  325  5e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  47.63 
 
 		 369 aa  325  5e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  47.99 
 
 		 366 aa  326  5e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1409  peptide chain release factor 2  51.91 
 
 		 330 aa  326  5e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0056831  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  44.73 
 
 		 371 aa  326  5e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  47.11 
 
 		 331 aa  325  7e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  51.24 
 
 		 368 aa  324  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  49.07 
 
 		 375 aa  324  2e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  49.22 
 
 		 326 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  48.4 
 
 		 356 aa  323  3e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  49.69 
 
 		 332 aa  323  4e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2538  peptide chain release factor 2  48.22 
 
 		 363 aa  322  6e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2031  peptide chain release factor 2  48.22 
 
 		 363 aa  322  7e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0138456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  47.54 
 
 		 356 aa  322  9.000000000000001e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  49.38 
 
 		 332 aa  321  9.999999999999999e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  47.94 
 
 		 361 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  47.31 
 
 		 374 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  46.36 
 
 		 371 aa  319  5e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2784  peptide chain release factor 2  46.9 
 
 		 363 aa  318  7e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.785261  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  48.48 
 
 		 331 aa  318  7e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  47.37 
 
 		 360 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  44.16 
 
 		 378 aa  318  1e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  45.65 
 
 		 379 aa  317  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3025  peptide chain release factor 2  48.37 
 
 		 371 aa  316  3e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  47.52 
 
 		 372 aa  316  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  46.15 
 
 		 370 aa  316  5e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0209  peptide chain release factor 2  48.39 
 
 		 381 aa  316  5e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20340  peptide chain release factor 2  44.44 
 
 		 371 aa  315  6e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0863  peptide chain release factor 2  45.76 
 
 		 369 aa  315  8e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  46.38 
 
 		 371 aa  315  8e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  46.38 
 
 		 371 aa  315  8e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  46.38 
 
 		 371 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  46.89 
 
 		 367 aa  314  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  45.43 
 
 		 371 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1034  peptide chain release factor 2  45.14 
 
 		 370 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  46.24 
 
 		 368 aa  312  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  47.2 
 
 		 329 aa  312  3.9999999999999997e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  46.88 
 
 		 369 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  43.66 
 
 		 365 aa  312  5.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  47.06 
 
 		 375 aa  311  6.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  46.18 
 
 		 362 aa  311  7.999999999999999e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0238  peptide chain release factor 2  47.8 
 
 		 363 aa  311  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000385966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  48.64 
 
 		 373 aa  311  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1899  peptide chain release factor 2  43.45 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0199155  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  48.22 
 
 		 378 aa  311  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5751  hypothetical protein  45.98 
 
 		 358 aa  310  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  45.48 
 
 		 371 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  46.31 
 
 		 378 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  46.48 
 
 		 373 aa  310  4e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>