More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0653 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 369 aa  761    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  62.94 
 
 		 371 aa  496  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1938  hypothetical protein  63.11 
 
 		 370 aa  481  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374727  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1805  peptide chain release factor 2  65.79 
 
 		 358 aa  456  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.361195  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0555  Peptide chain release factor 2  61.39 
 
 		 376 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000388438 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1302  peptide chain release factor 2  65.36 
 
 		 310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.240882  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  52.17 
 
 		 379 aa  360  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  50 
 
 		 367 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  48.62 
 
 		 369 aa  352  5.9999999999999994e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  48.48 
 
 		 380 aa  351  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  49.19 
 
 		 383 aa  350  2e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  49.32 
 
 		 372 aa  350  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  51.85 
 
 		 332 aa  349  6e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  48.2 
 
 		 380 aa  348  7e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  46.32 
 
 		 367 aa  348  1e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  48.48 
 
 		 380 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  48.2 
 
 		 380 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  46.05 
 
 		 367 aa  346  3e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  50 
 
 		 367 aa  344  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  52.83 
 
 		 327 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  49.01 
 
 		 374 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  49.18 
 
 		 371 aa  339  4e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  51.7 
 
 		 331 aa  338  5.9999999999999996e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  45.98 
 
 		 366 aa  338  7e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  48.31 
 
 		 375 aa  338  8e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  46.41 
 
 		 372 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  47.93 
 
 		 373 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  52.52 
 
 		 326 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  52.52 
 
 		 326 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  52.52 
 
 		 326 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  49.02 
 
 		 366 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  47.79 
 
 		 371 aa  336  3.9999999999999995e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 364 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  46.32 
 
 		 366 aa  336  5e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  46.54 
 
 		 367 aa  333  2e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  52.32 
 
 		 331 aa  332  6e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  48.53 
 
 		 361 aa  332  7.000000000000001e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  47.21 
 
 		 377 aa  332  8e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  50.29 
 
 		 375 aa  331  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  46.32 
 
 		 371 aa  331  1e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  46.58 
 
 		 368 aa  331  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  47.37 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  49.4 
 
 		 365 aa  330  2e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  48.8 
 
 		 375 aa  330  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  51.26 
 
 		 326 aa  330  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  46.13 
 
 		 365 aa  330  3e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2216  peptide chain release factor 2 (bRF-2)  51.81 
 
 		 344 aa  329  4e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00549966  hitchhiker  0.00000471368 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  48.94 
 
 		 369 aa  328  8e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  44.32 
 
 		 365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  46.41 
 
 		 365 aa  326  3e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  46.41 
 
 		 365 aa  326  3e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  46.13 
 
 		 365 aa  326  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  46.41 
 
 		 365 aa  326  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  46.93 
 
 		 367 aa  327  3e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  48.51 
 
 		 343 aa  327  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  46.41 
 
 		 365 aa  326  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  52.67 
 
 		 312 aa  326  3e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  45.96 
 
 		 375 aa  326  4.0000000000000003e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  46.91 
 
 		 365 aa  325  5e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  47.75 
 
 		 334 aa  325  7e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  55.31 
 
 		 369 aa  324  1e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  44.6 
 
 		 372 aa  324  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  45.86 
 
 		 365 aa  323  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  49.11 
 
 		 375 aa  323  3e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  50.32 
 
 		 317 aa  323  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  45.58 
 
 		 365 aa  323  4e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 326 aa  322  5e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  47.65 
 
 		 376 aa  322  7e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  44.72 
 
 		 369 aa  322  7e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 330 aa  321  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  51.2 
 
 		 340 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  46.22 
 
 		 371 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3429  peptide chain release factor 2  48.77 
 
 		 329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883546 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  46.2 
 
 		 375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  47.5 
 
 		 364 aa  320  3e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  51.63 
 
 		 322 aa  319  6e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  47.29 
 
 		 364 aa  318  7.999999999999999e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0500  peptide chain release factor 2  48.04 
 
 		 364 aa  318  9e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2878  peptide chain release factor 2  49.7 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  45.3 
 
 		 365 aa  316  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0251  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 		 372 aa  317  3e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00360033  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  52.81 
 
 		 322 aa  317  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  47.04 
 
 		 364 aa  316  4e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  46.76 
 
 		 376 aa  316  4e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  50.81 
 
 		 362 aa  315  5e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2977  peptide chain release factor 2  47.13 
 
 		 375 aa  315  9e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  47.13 
 
 		 344 aa  314  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  46.78 
 
 		 378 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1623  peptide chain release factor 2  47.13 
 
 		 375 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622299  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  47.95 
 
 		 376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  47.32 
 
 		 376 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  46.97 
 
 		 359 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1856  peptide chain release factor 2  47.06 
 
 		 375 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  48.7 
 
 		 321 aa  312  4.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  46.27 
 
 		 329 aa  312  6.999999999999999e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0584  peptide chain release factor 2  48.95 
 
 		 366 aa  312  6.999999999999999e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  46.44 
 
 		 367 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3166  peptide chain release factor 2  51.96 
 
 		 321 aa  311  9e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  43.21 
 
 		 362 aa  311  9e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1790  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 365 aa  311  1e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.801319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>