More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1409 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1409  peptide chain release factor 2  100 
 
 
330 aa  671    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0056831  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  63.92 
 
 
372 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  58.6 
 
 
367 aa  387  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  58.6 
 
 
367 aa  385  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  55.69 
 
 
367 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  53.99 
 
 
377 aa  371  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  54.32 
 
 
330 aa  373  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  55.24 
 
 
362 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  55.24 
 
 
364 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  59.31 
 
 
331 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  55.59 
 
 
366 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  57.01 
 
 
364 aa  369  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  56.04 
 
 
369 aa  370  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  60.44 
 
 
330 aa  368  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  53.94 
 
 
383 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  57.68 
 
 
330 aa  365  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  57.14 
 
 
366 aa  365  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  54.11 
 
 
380 aa  365  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  54.43 
 
 
380 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  56.65 
 
 
373 aa  364  1e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  54.89 
 
 
368 aa  364  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  53.48 
 
 
327 aa  363  3e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  53.8 
 
 
380 aa  362  4e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  53.8 
 
 
380 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  52.45 
 
 
332 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  53.8 
 
 
326 aa  361  9e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  53.8 
 
 
326 aa  361  9e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  53.48 
 
 
326 aa  361  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  54.98 
 
 
357 aa  360  2e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  54.75 
 
 
367 aa  359  4e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  53.48 
 
 
326 aa  358  5e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  54.07 
 
 
374 aa  358  9e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  52.68 
 
 
369 aa  358  9.999999999999999e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  52.68 
 
 
331 aa  357  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  52.92 
 
 
367 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  57.78 
 
 
375 aa  353  2e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  50.76 
 
 
371 aa  351  8.999999999999999e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  55.7 
 
 
312 aa  351  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  57.28 
 
 
369 aa  348  8e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  52.23 
 
 
356 aa  344  1e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  51.91 
 
 
357 aa  344  1e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  53.5 
 
 
366 aa  343  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  51.59 
 
 
362 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  50 
 
 
334 aa  343  2.9999999999999997e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  52.16 
 
 
332 aa  341  8e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  50.79 
 
 
371 aa  340  2e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  51.89 
 
 
326 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  49.68 
 
 
329 aa  338  7e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  50 
 
 
337 aa  335  9e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4162  peptide chain release factor 2  51.78 
 
 
317 aa  332  4e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.155408 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  49.69 
 
 
372 aa  332  5e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  53.8 
 
 
372 aa  330  1e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  51.58 
 
 
371 aa  327  1.0000000000000001e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  49.37 
 
 
367 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  47.48 
 
 
365 aa  326  3e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3345  peptide chain release factor 2  51.13 
 
 
317 aa  325  5e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.219994  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  50.31 
 
 
369 aa  324  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2216  peptide chain release factor 2 (bRF-2)  50.93 
 
 
344 aa  324  1e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00549966  hitchhiker  0.00000471368 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  49.69 
 
 
364 aa  323  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  50.78 
 
 
379 aa  322  7e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  50 
 
 
367 aa  322  7e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  52.37 
 
 
375 aa  321  9.000000000000001e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  52.37 
 
 
365 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1904  peptide chain release factor 2  48.58 
 
 
337 aa  321  9.999999999999999e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.430397  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0404  peptide chain release factor 2  53.95 
 
 
304 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.660682  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  48.15 
 
 
371 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  50.79 
 
 
360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  49.53 
 
 
378 aa  320  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  50.16 
 
 
361 aa  319  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  51.13 
 
 
356 aa  318  6e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  49.37 
 
 
372 aa  318  7.999999999999999e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1805  peptide chain release factor 2  47.68 
 
 
358 aa  318  9e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.361195  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  49.21 
 
 
317 aa  318  9e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  45.71 
 
 
343 aa  318  9e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  58.82 
 
 
362 aa  317  2e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1938  hypothetical protein  47.68 
 
 
370 aa  317  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374727  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  47.84 
 
 
340 aa  316  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  46.77 
 
 
372 aa  315  7e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1767  peptide chain release factor 2  55.64 
 
 
337 aa  315  8e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  51.27 
 
 
375 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  47.69 
 
 
372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  48.3 
 
 
356 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  52.12 
 
 
323 aa  311  1e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  47.78 
 
 
332 aa  310  2e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  46.71 
 
 
341 aa  310  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  47.81 
 
 
361 aa  310  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  49.84 
 
 
356 aa  310  2.9999999999999997e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  46.32 
 
 
371 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5845  peptide chain release factor 2  52.98 
 
 
321 aa  308  8e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  47.02 
 
 
365 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  48.74 
 
 
354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  47.35 
 
 
375 aa  306  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  46.67 
 
 
369 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  49.37 
 
 
375 aa  305  5.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  48.44 
 
 
364 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0555  Peptide chain release factor 2  48.45 
 
 
376 aa  305  6e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000388438 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2274  peptide chain release factor 2  50.85 
 
 
310 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  47.34 
 
 
365 aa  305  9.000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2784  peptide chain release factor 2  53.07 
 
 
292 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01981  peptide chain release factor 2  49.68 
 
 
354 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0513147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>