More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0328 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 362 aa  732    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  56.9 
 
 		 372 aa  402  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  54.67 
 
 		 380 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  53.85 
 
 		 380 aa  394  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  54.4 
 
 		 380 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  54.4 
 
 		 380 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  53.74 
 
 		 367 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  57.72 
 
 		 327 aa  389  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  58.88 
 
 		 326 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  58.88 
 
 		 326 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  58.88 
 
 		 326 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  58.26 
 
 		 326 aa  388  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  50.14 
 
 		 366 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  52.01 
 
 		 373 aa  384  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  55 
 
 		 357 aa  381  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  54.66 
 
 		 332 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  52.51 
 
 		 367 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  50.7 
 
 		 383 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  49.58 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  52.54 
 
 		 364 aa  373  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  49.3 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  50.69 
 
 		 368 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  49.86 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  57.94 
 
 		 330 aa  371  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  52.48 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  57.94 
 
 		 331 aa  362  4e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  47.67 
 
 		 377 aa  362  8e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  50.41 
 
 		 371 aa  360  2e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  49.72 
 
 		 366 aa  358  5e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2216  peptide chain release factor 2 (bRF-2)  55.19 
 
 		 344 aa  358  7e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00549966  hitchhiker  0.00000471368 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  52.65 
 
 		 369 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  49.72 
 
 		 362 aa  356  2.9999999999999997e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  49.17 
 
 		 367 aa  355  7.999999999999999e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  49.44 
 
 		 364 aa  355  1e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  48.75 
 
 		 366 aa  353  2e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  52.65 
 
 		 330 aa  352  5e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 		 364 aa  352  8e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  49.13 
 
 		 376 aa  350  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  51.69 
 
 		 331 aa  350  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  50.28 
 
 		 369 aa  349  4e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  49.13 
 
 		 374 aa  348  8e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  50.43 
 
 		 375 aa  348  1e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  53.14 
 
 		 326 aa  348  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  48.61 
 
 		 375 aa  347  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  49.53 
 
 		 334 aa  345  8e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  48.1 
 
 		 371 aa  342  7e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  47.83 
 
 		 376 aa  341  1e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  47.83 
 
 		 379 aa  340  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  52.44 
 
 		 317 aa  339  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  54.23 
 
 		 330 aa  339  5e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  48.06 
 
 		 375 aa  338  9e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  48.58 
 
 		 369 aa  333  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  44.75 
 
 		 365 aa  334  2e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  47.94 
 
 		 372 aa  333  2e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  48.22 
 
 		 372 aa  333  4e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  46.96 
 
 		 371 aa  332  5e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  47.65 
 
 		 362 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  47.79 
 
 		 361 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  46.39 
 
 		 376 aa  328  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  45.71 
 
 		 364 aa  328  9e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  46.7 
 
 		 356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5845  peptide chain release factor 2  50.95 
 
 		 321 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  45.83 
 
 		 375 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  50.78 
 
 		 337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  45.51 
 
 		 372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  48.52 
 
 		 378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  47.98 
 
 		 341 aa  327  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  49.03 
 
 		 376 aa  325  7e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  48.28 
 
 		 329 aa  325  7e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  47.31 
 
 		 375 aa  325  1e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  48.48 
 
 		 340 aa  324  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3166  peptide chain release factor 2  52.75 
 
 		 321 aa  324  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1938  hypothetical protein  44.82 
 
 		 370 aa  323  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374727  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  50.62 
 
 		 332 aa  324  2e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  45.69 
 
 		 357 aa  323  3e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  51.46 
 
 		 321 aa  322  4e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2982  peptide chain release factor 2  52.43 
 
 		 321 aa  323  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.186364  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3208  peptide chain release factor 2  52.43 
 
 		 321 aa  323  4e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1899  peptide chain release factor 2  43.27 
 
 		 367 aa  322  5e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0199155  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  50.31 
 
 		 332 aa  321  9.999999999999999e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  53.55 
 
 		 312 aa  321  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1305  peptide chain release factor 2  45.28 
 
 		 376 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5077  peptide chain release factor 2  53.07 
 
 		 321 aa  319  5e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30933  normal  0.0341665 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  48.18 
 
 		 372 aa  318  9e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1805  peptide chain release factor 2  46.75 
 
 		 358 aa  318  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.361195  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  51.61 
 
 		 322 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2538  peptide chain release factor 2  47.94 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  48.18 
 
 		 343 aa  316  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  44.51 
 
 		 378 aa  317  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  44.22 
 
 		 367 aa  315  6e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2031  peptide chain release factor 2  48.22 
 
 		 363 aa  315  7e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0138456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  46.31 
 
 		 356 aa  315  7e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0238  peptide chain release factor 2  47.65 
 
 		 363 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000385966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  44.25 
 
 		 356 aa  313  2.9999999999999996e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  44.9 
 
 		 365 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  48.29 
 
 		 344 aa  313  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  45.22 
 
 		 368 aa  313  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  43.06 
 
 		 372 aa  312  6.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  46.41 
 
 		 371 aa  311  7.999999999999999e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>