More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2206 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  769    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  81.16 
 
 		 357 aa  598  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  62.71 
 
 		 372 aa  486  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  68.22 
 
 		 330 aa  462  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  57.58 
 
 		 368 aa  454  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  59.39 
 
 		 362 aa  451  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  59.23 
 
 		 364 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  57.18 
 
 		 367 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  57.14 
 
 		 366 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  57.14 
 
 		 380 aa  425  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  56.87 
 
 		 380 aa  422  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  56.11 
 
 		 383 aa  422  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  57.14 
 
 		 380 aa  421  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  56.87 
 
 		 380 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  56.63 
 
 		 367 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  54.04 
 
 		 377 aa  420  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  56.63 
 
 		 371 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  61.2 
 
 		 332 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  58.62 
 
 		 330 aa  411  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  52.08 
 
 		 365 aa  411  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  54.37 
 
 		 367 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  54.14 
 
 		 369 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  60 
 
 		 326 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  60 
 
 		 326 aa  402  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  58.44 
 
 		 327 aa  402  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  60.75 
 
 		 332 aa  403  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  59.69 
 
 		 326 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  50.28 
 
 		 372 aa  399  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  58.68 
 
 		 326 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  60.82 
 
 		 330 aa  397  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  53.54 
 
 		 366 aa  394  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  57.14 
 
 		 331 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  51.82 
 
 		 367 aa  389  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  51.82 
 
 		 367 aa  390  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  51.93 
 
 		 372 aa  390  1e-107  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  52.86 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  56.42 
 
 		 337 aa  385  1e-106  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  51.42 
 
 		 372 aa  381  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  51.53 
 
 		 374 aa  380  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  57.85 
 
 		 331 aa  376  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  53.87 
 
 		 364 aa  377  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  53.99 
 
 		 334 aa  378  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  52.69 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0257  peptide chain release factor 2  60 
 
 		 333 aa  375  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000258105  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  50.83 
 
 		 367 aa  375  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  54.06 
 
 		 369 aa  372  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  53.43 
 
 		 375 aa  374  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  50.7 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  54.85 
 
 		 340 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  53.25 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  49.58 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  47.91 
 
 		 367 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  54.86 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  53.85 
 
 		 326 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2216  peptide chain release factor 2 (bRF-2)  55.88 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00549966  hitchhiker  0.00000471368 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  50.74 
 
 		 343 aa  363  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  54.83 
 
 		 332 aa  363  2e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  49.01 
 
 		 372 aa  363  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  49.45 
 
 		 371 aa  359  4e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  48.58 
 
 		 362 aa  358  7e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  50.43 
 
 		 378 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 		 356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  47.35 
 
 		 366 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  53.82 
 
 		 323 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  48.68 
 
 		 361 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  49.11 
 
 		 357 aa  354  1e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  55.07 
 
 		 312 aa  353  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  51.4 
 
 		 329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  49.58 
 
 		 372 aa  350  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  49.44 
 
 		 367 aa  350  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  48.57 
 
 		 375 aa  349  4e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  51.07 
 
 		 344 aa  349  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  49 
 
 		 375 aa  348  6e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  48.45 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  48.45 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  47.83 
 
 		 365 aa  345  5e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  47.22 
 
 		 375 aa  345  5e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 		 361 aa  345  5e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  51.79 
 
 		 317 aa  345  6e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  47.03 
 
 		 365 aa  345  1e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  48.6 
 
 		 459 aa  345  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  48.17 
 
 		 367 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  47.29 
 
 		 372 aa  344  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  47.83 
 
 		 365 aa  344  1e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  44.66 
 
 		 365 aa  344  2e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  49.29 
 
 		 365 aa  343  2.9999999999999997e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  47.52 
 
 		 375 aa  343  2.9999999999999997e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  47.01 
 
 		 368 aa  343  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  47.11 
 
 		 375 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  46.43 
 
 		 364 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  47.24 
 
 		 365 aa  342  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  47.67 
 
 		 356 aa  342  5.999999999999999e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  47.4 
 
 		 365 aa  342  5.999999999999999e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  46.13 
 
 		 369 aa  342  7e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  45.45 
 
 		 364 aa  341  1e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2040  peptide chain release factor 2  53.53 
 
 		 322 aa  341  1e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  46.94 
 
 		 369 aa  341  1e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  47.28 
 
 		 365 aa  340  2e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  49.41 
 
 		 391 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  48.25 
 
 		 360 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>