More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2715 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  100 
 
 
360 aa  736    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  82.37 
 
 
375 aa  571  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  82.37 
 
 
365 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  76.06 
 
 
361 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  71.59 
 
 
356 aa  508  1e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  69.57 
 
 
356 aa  504  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  69.59 
 
 
356 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2784  peptide chain release factor 2  80.43 
 
 
292 aa  473  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0404  peptide chain release factor 2  76.09 
 
 
304 aa  472  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.660682  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01981  peptide chain release factor 2  63.85 
 
 
354 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0513147  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1548  peptide chain release factor 2  70.55 
 
 
313 aa  455  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475132  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02001  peptide chain release factor 2  62.39 
 
 
354 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0182  peptide chain release factor 2  62.68 
 
 
354 aa  455  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02561  peptide chain release factor 2  69.26 
 
 
313 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.686331  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27381  peptide chain release factor 2  71.84 
 
 
319 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2120  peptide chain release factor 2  78.45 
 
 
288 aa  437  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02091  peptide chain release factor 2  61.22 
 
 
354 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  51 
 
 
368 aa  368  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  52.77 
 
 
367 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  50.59 
 
 
383 aa  366  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  48.87 
 
 
367 aa  363  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  50 
 
 
372 aa  363  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  48.43 
 
 
357 aa  362  5.0000000000000005e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  48.31 
 
 
367 aa  355  5e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  48.25 
 
 
373 aa  355  5e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  48.38 
 
 
362 aa  355  1e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  48.02 
 
 
380 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  48.08 
 
 
364 aa  352  5.9999999999999994e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  47.54 
 
 
369 aa  350  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  48.02 
 
 
380 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  52.02 
 
 
329 aa  350  2e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  47.74 
 
 
380 aa  349  4e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  47.46 
 
 
380 aa  349  4e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  49.71 
 
 
366 aa  349  5e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  50.73 
 
 
366 aa  347  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  47.23 
 
 
365 aa  346  3e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  49.57 
 
 
378 aa  347  3e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  48.92 
 
 
331 aa  344  1e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  48.53 
 
 
377 aa  343  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  48.82 
 
 
378 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  50.47 
 
 
327 aa  343  4e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 
367 aa  341  1e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  47.38 
 
 
371 aa  340  2e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  50.78 
 
 
326 aa  340  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  50.78 
 
 
326 aa  340  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  50.78 
 
 
326 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  49.1 
 
 
367 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  50.71 
 
 
369 aa  339  5e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  46.69 
 
 
367 aa  338  7e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21873  predicted protein  50 
 
 
406 aa  338  9.999999999999999e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  48.27 
 
 
364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  50.29 
 
 
372 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  49.84 
 
 
326 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  47.55 
 
 
378 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  46.06 
 
 
372 aa  334  1e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  47.95 
 
 
356 aa  333  2e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  47.66 
 
 
362 aa  332  4e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  46.42 
 
 
372 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  48.09 
 
 
368 aa  331  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  47.26 
 
 
372 aa  331  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 
375 aa  331  1e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  46.75 
 
 
369 aa  331  1e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  47.37 
 
 
357 aa  331  2e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  48.7 
 
 
371 aa  330  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0942  peptide chain release factor 2  48.24 
 
 
374 aa  328  6e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0440008  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  50.46 
 
 
330 aa  328  7e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15725  predicted protein  57.93 
 
 
278 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0450714 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  48.45 
 
 
332 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  47.54 
 
 
364 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  50 
 
 
330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  46.63 
 
 
372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  46.67 
 
 
361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  46.63 
 
 
375 aa  325  7e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2031  peptide chain release factor 2  45.79 
 
 
363 aa  325  9e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0138456  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 
332 aa  325  1e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  48.55 
 
 
367 aa  323  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  45.91 
 
 
371 aa  324  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  46.78 
 
 
366 aa  323  4e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  45.06 
 
 
372 aa  323  4e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  54.78 
 
 
369 aa  322  6e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  45.45 
 
 
374 aa  322  7e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  43.52 
 
 
372 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2784  peptide chain release factor 2  47.69 
 
 
363 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.785261  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  44.67 
 
 
366 aa  320  3.9999999999999996e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1409  peptide chain release factor 2  50.79 
 
 
330 aa  319  5e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0056831  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  42.98 
 
 
371 aa  319  6e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  48.17 
 
 
337 aa  318  7e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  46.8 
 
 
373 aa  318  7e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  49.25 
 
 
371 aa  318  1e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  44.61 
 
 
370 aa  317  2e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  47.51 
 
 
368 aa  317  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20340  peptide chain release factor 2  44.57 
 
 
371 aa  316  3e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0209  peptide chain release factor 2  47.97 
 
 
381 aa  316  4e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  48.54 
 
 
372 aa  316  4e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  46.89 
 
 
326 aa  315  7e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1899  peptide chain release factor 2  45.22 
 
 
367 aa  315  7e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0199155  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  45.93 
 
 
373 aa  315  8e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  46.49 
 
 
368 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  44.09 
 
 
367 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  47.26 
 
 
376 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>