More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0241 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 334 aa  691    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  55.59 
 
 		 366 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  55.52 
 
 		 330 aa  398  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  56.5 
 
 		 357 aa  392  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  54.38 
 
 		 377 aa  383  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  56.44 
 
 		 330 aa  381  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  53.99 
 
 		 373 aa  378  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  52.28 
 
 		 332 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  55.11 
 
 		 367 aa  378  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  52.76 
 
 		 372 aa  381  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  57.59 
 
 		 368 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  53.37 
 
 		 380 aa  374  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  55.28 
 
 		 330 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  53.37 
 
 		 380 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  54.04 
 
 		 383 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  55.38 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  53.68 
 
 		 380 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  53.37 
 
 		 380 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  53.58 
 
 		 327 aa  371  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  54.26 
 
 		 326 aa  368  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  54.57 
 
 		 326 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  54.57 
 
 		 326 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  52.4 
 
 		 366 aa  368  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  54.26 
 
 		 326 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  52.96 
 
 		 369 aa  362  5.0000000000000005e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  52.96 
 
 		 331 aa  361  9e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  60 
 
 		 312 aa  356  2.9999999999999997e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  47.72 
 
 		 362 aa  355  5.999999999999999e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  47.72 
 
 		 364 aa  354  1e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  52.98 
 
 		 371 aa  353  2e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 374 aa  353  2e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  53.68 
 
 		 331 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  52.15 
 
 		 369 aa  352  5e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  51.08 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2216  peptide chain release factor 2 (bRF-2)  54.8 
 
 		 344 aa  349  4e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00549966  hitchhiker  0.00000471368 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  48.93 
 
 		 371 aa  345  6e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  52.04 
 
 		 372 aa  345  7e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  52.19 
 
 		 326 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  49.53 
 
 		 364 aa  342  4e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  49.39 
 
 		 367 aa  340  2e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  51.07 
 
 		 364 aa  339  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  48.65 
 
 		 364 aa  339  4e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  48.48 
 
 		 367 aa  339  4e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  51.57 
 
 		 379 aa  339  4e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 375 aa  338  8e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  48.17 
 
 		 367 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  50.46 
 
 		 332 aa  336  2.9999999999999997e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  48.47 
 
 		 367 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  50 
 
 		 371 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  49.53 
 
 		 332 aa  335  7.999999999999999e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  49.52 
 
 		 362 aa  333  2e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  48.93 
 
 		 340 aa  333  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  47.72 
 
 		 367 aa  332  6e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  46.65 
 
 		 369 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  51.14 
 
 		 317 aa  330  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  47.98 
 
 		 329 aa  328  7e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  49.68 
 
 		 365 aa  326  3e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  47.75 
 
 		 369 aa  325  6e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1805  peptide chain release factor 2  48.45 
 
 		 358 aa  324  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.361195  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1938  hypothetical protein  50.8 
 
 		 370 aa  323  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374727  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1409  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 330 aa  323  3e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0056831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  49.54 
 
 		 459 aa  322  5e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  48.44 
 
 		 365 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  48.44 
 
 		 365 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  48.44 
 
 		 365 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  50.47 
 
 		 365 aa  321  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  48.44 
 
 		 365 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  46.08 
 
 		 337 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  48.44 
 
 		 365 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  48.75 
 
 		 365 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  48.42 
 
 		 367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0500  peptide chain release factor 2  48.24 
 
 		 364 aa  320  3e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  49.53 
 
 		 325 aa  319  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0793  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 331 aa  319  5e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  50.78 
 
 		 365 aa  318  6e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  46.83 
 
 		 368 aa  318  6e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  49.24 
 
 		 367 aa  318  7e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  49.24 
 
 		 367 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  49.24 
 
 		 367 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2031  peptide chain release factor 2  46.89 
 
 		 363 aa  317  1e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0138456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  49.37 
 
 		 354 aa  318  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  49.69 
 
 		 372 aa  317  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  45.73 
 
 		 375 aa  317  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  50.16 
 
 		 359 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  46.56 
 
 		 369 aa  317  2e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  43.29 
 
 		 365 aa  316  3e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1302  peptide chain release factor 2  53.38 
 
 		 310 aa  317  3e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.240882  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  47.81 
 
 		 365 aa  316  4e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  50.47 
 
 		 391 aa  316  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  50.47 
 
 		 391 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  50.47 
 
 		 391 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  50.47 
 
 		 391 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  48.12 
 
 		 365 aa  315  6e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  49.53 
 
 		 349 aa  315  6e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  45.73 
 
 		 378 aa  315  6e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  49.84 
 
 		 349 aa  315  7e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  49.84 
 
 		 364 aa  315  8e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  45.51 
 
 		 371 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  49.84 
 
 		 417 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  45.51 
 
 		 371 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>