More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1451 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  82.61 
 
 		 378 aa  642    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 372 aa  756    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  75.54 
 
 		 378 aa  590  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  74.12 
 
 		 372 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  73.84 
 
 		 375 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  73.03 
 
 		 369 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  69.4 
 
 		 367 aa  524  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  68.41 
 
 		 368 aa  522  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  68.77 
 
 		 369 aa  521  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  69.06 
 
 		 371 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  68.78 
 
 		 371 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  68.78 
 
 		 371 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  66.49 
 
 		 373 aa  504  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  66.03 
 
 		 367 aa  507  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  66.49 
 
 		 373 aa  502  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  67.22 
 
 		 368 aa  502  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  65.76 
 
 		 374 aa  498  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3456  peptide chain release factor 2  67.87 
 
 		 371 aa  497  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1233  peptide chain release factor 2  68.8 
 
 		 370 aa  494  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4451  peptide chain release factor 2  66.76 
 
 		 372 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3025  peptide chain release factor 2  64.84 
 
 		 371 aa  486  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  66.95 
 
 		 368 aa  483  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0863  peptide chain release factor 2  63.29 
 
 		 369 aa  476  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25200  peptide chain release factor 2  61.83 
 
 		 372 aa  474  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0337024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  65.57 
 
 		 366 aa  474  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  61.41 
 
 		 370 aa  473  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20340  peptide chain release factor 2  62.06 
 
 		 371 aa  471  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  62.4 
 
 		 371 aa  473  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13122  peptide chain release factor 2  65.5 
 
 		 378 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.44652 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1034  peptide chain release factor 2  62.64 
 
 		 370 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2401  peptide chain release factor 2  61.88 
 
 		 371 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0455309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1865  peptide chain release factor 2  65.93 
 
 		 376 aa  461  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00679931  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07580  peptide chain release factor 2  61.2 
 
 		 373 aa  459  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.932102  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  59.84 
 
 		 378 aa  456  1e-127  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1264  peptide chain release factor 2  64.62 
 
 		 375 aa  457  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111402  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2666  peptide chain release factor 2  60.77 
 
 		 371 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0942  peptide chain release factor 2  59.29 
 
 		 374 aa  435  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0440008  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5798  peptide chain release factor 2  63.29 
 
 		 386 aa  434  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  48.06 
 
 		 367 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  50.56 
 
 		 372 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  49.44 
 
 		 371 aa  351  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 		 357 aa  350  2e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  51.38 
 
 		 330 aa  349  5e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  49.16 
 
 		 372 aa  345  6e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  52 
 
 		 366 aa  345  6e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  47.9 
 
 		 383 aa  345  7e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  47.04 
 
 		 366 aa  344  1e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  47.55 
 
 		 373 aa  343  4e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  47.5 
 
 		 367 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 364 aa  340  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  46.5 
 
 		 362 aa  340  2e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  46.31 
 
 		 372 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  46.81 
 
 		 367 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  48.75 
 
 		 377 aa  339  4e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  49.59 
 
 		 365 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  49.59 
 
 		 375 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  46.93 
 
 		 366 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  47.59 
 
 		 369 aa  337  9.999999999999999e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  45.45 
 
 		 369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  46.22 
 
 		 364 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  48.06 
 
 		 367 aa  335  9e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  51.79 
 
 		 340 aa  335  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  49.27 
 
 		 356 aa  334  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  50.42 
 
 		 369 aa  333  2e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  50.62 
 
 		 368 aa  333  4e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  44.75 
 
 		 380 aa  333  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  46.26 
 
 		 367 aa  333  4e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  49.32 
 
 		 365 aa  332  7.000000000000001e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  50.46 
 
 		 341 aa  331  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  48.56 
 
 		 376 aa  331  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  44.48 
 
 		 380 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  46.46 
 
 		 367 aa  330  3e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  44.75 
 
 		 380 aa  329  4e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  44.75 
 
 		 380 aa  329  4e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  49.71 
 
 		 361 aa  330  4e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09020  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 369 aa  329  6e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.140459  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  48.02 
 
 		 364 aa  328  6e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  50.29 
 
 		 378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  49.71 
 
 		 356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  51.54 
 
 		 330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  47.95 
 
 		 365 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  48.85 
 
 		 362 aa  325  5e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  49.12 
 
 		 375 aa  326  5e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  47.66 
 
 		 365 aa  325  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  53.38 
 
 		 317 aa  324  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  46.45 
 
 		 374 aa  325  1e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  47.67 
 
 		 365 aa  324  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  47.67 
 
 		 365 aa  324  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  47.67 
 
 		 365 aa  324  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  47.67 
 
 		 365 aa  324  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  48.53 
 
 		 356 aa  323  3e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  47.35 
 
 		 361 aa  322  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 349 aa  322  5e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  47.93 
 
 		 376 aa  322  5e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  47.47 
 
 		 365 aa  322  6e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  49.71 
 
 		 349 aa  322  8e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  49.56 
 
 		 372 aa  322  9.000000000000001e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2354  hypothetical protein  47.63 
 
 		 372 aa  321  9.999999999999999e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  47.12 
 
 		 365 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  47.4 
 
 		 365 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>