More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3456 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3456  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 371 aa  759    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3025  peptide chain release factor 2  84.43 
 
 		 371 aa  624  1e-178  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  79.73 
 
 		 371 aa  600  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  80 
 
 		 371 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  80 
 
 		 371 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4451  peptide chain release factor 2  78.65 
 
 		 372 aa  596  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  79.18 
 
 		 368 aa  590  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13122  peptide chain release factor 2  80.17 
 
 		 378 aa  557  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.44652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  72.33 
 
 		 367 aa  541  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  71.51 
 
 		 369 aa  540  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  71.43 
 
 		 368 aa  526  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  70.72 
 
 		 373 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  67.87 
 
 		 372 aa  511  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  69.61 
 
 		 373 aa  511  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1233  peptide chain release factor 2  69.04 
 
 		 370 aa  509  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  66.29 
 
 		 378 aa  501  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  66.48 
 
 		 378 aa  503  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  65.37 
 
 		 375 aa  495  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  66.3 
 
 		 367 aa  497  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  64.93 
 
 		 368 aa  492  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  65.66 
 
 		 369 aa  485  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  64.36 
 
 		 372 aa  474  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  64.38 
 
 		 374 aa  475  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20340  peptide chain release factor 2  62.71 
 
 		 371 aa  472  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2401  peptide chain release factor 2  63.04 
 
 		 371 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0455309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  64.29 
 
 		 371 aa  474  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25200  peptide chain release factor 2  62.98 
 
 		 372 aa  472  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0337024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0863  peptide chain release factor 2  62.53 
 
 		 369 aa  469  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07580  peptide chain release factor 2  62.71 
 
 		 373 aa  471  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.932102  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2666  peptide chain release factor 2  61.14 
 
 		 371 aa  464  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1034  peptide chain release factor 2  62.15 
 
 		 370 aa  461  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  64.48 
 
 		 366 aa  460  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1865  peptide chain release factor 2  65.47 
 
 		 376 aa  455  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00679931  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  59.73 
 
 		 370 aa  453  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1264  peptide chain release factor 2  64.74 
 
 		 375 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111402  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  58.29 
 
 		 378 aa  439  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0942  peptide chain release factor 2  59.12 
 
 		 374 aa  431  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0440008  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5798  peptide chain release factor 2  61.96 
 
 		 386 aa  425  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  49.45 
 
 		 366 aa  353  4e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  48.63 
 
 		 367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  48.08 
 
 		 367 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  48.9 
 
 		 377 aa  342  7e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  46.98 
 
 		 383 aa  339  5.9999999999999996e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  47.75 
 
 		 372 aa  336  5e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  46.32 
 
 		 366 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  46.43 
 
 		 369 aa  331  1e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  48.61 
 
 		 341 aa  331  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  47.61 
 
 		 368 aa  330  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  51.22 
 
 		 369 aa  330  2e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  45.18 
 
 		 376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  46.76 
 
 		 357 aa  326  4.0000000000000003e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  46.15 
 
 		 367 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  44.79 
 
 		 362 aa  323  3e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  49.54 
 
 		 330 aa  322  8e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  47.61 
 
 		 375 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  44.29 
 
 		 376 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  44.23 
 
 		 364 aa  319  3.9999999999999996e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  44.23 
 
 		 372 aa  319  5e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  46.79 
 
 		 374 aa  319  6e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  46.39 
 
 		 371 aa  318  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  48.31 
 
 		 364 aa  318  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  42.74 
 
 		 369 aa  317  2e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  44.32 
 
 		 367 aa  317  2e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  46.61 
 
 		 375 aa  316  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  43.75 
 
 		 366 aa  316  3e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  43.47 
 
 		 373 aa  316  5e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  43.73 
 
 		 372 aa  315  6e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  47.23 
 
 		 356 aa  315  6e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  46.51 
 
 		 372 aa  315  9e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  48.14 
 
 		 362 aa  315  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  44.07 
 
 		 367 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  47.7 
 
 		 402 aa  314  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  49.13 
 
 		 344 aa  314  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  44.35 
 
 		 367 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  44.44 
 
 		 375 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  48.21 
 
 		 356 aa  312  4.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  48.01 
 
 		 378 aa  312  6.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  43.55 
 
 		 375 aa  310  2e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  46.2 
 
 		 356 aa  310  2e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  43.32 
 
 		 376 aa  311  2e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09020  peptide chain release factor 2  47.77 
 
 		 369 aa  310  2.9999999999999997e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.140459  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  44.44 
 
 		 375 aa  309  5.9999999999999995e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2977  peptide chain release factor 2  46.03 
 
 		 375 aa  308  8e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  47.34 
 
 		 376 aa  308  9e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  44.07 
 
 		 364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1623  peptide chain release factor 2  46.03 
 
 		 375 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622299  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  47.62 
 
 		 357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1305  peptide chain release factor 2  45.68 
 
 		 376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  42.31 
 
 		 380 aa  306  3e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  47.43 
 
 		 349 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  46.7 
 
 		 349 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1856  peptide chain release factor 2  45.65 
 
 		 375 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  46.46 
 
 		 331 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  46.77 
 
 		 330 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4162  peptide chain release factor 2  50.97 
 
 		 317 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.155408 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  45.09 
 
 		 356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  48.94 
 
 		 340 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  44.32 
 
 		 375 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  42.03 
 
 		 380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  48.92 
 
 		 330 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>