More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4162 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4162  peptide chain release factor 2  100 
 
 
317 aa  640    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.155408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3345  peptide chain release factor 2  93.99 
 
 
317 aa  606  9.999999999999999e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.219994  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  77.64 
 
 
367 aa  496  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1904  peptide chain release factor 2  62.26 
 
 
337 aa  392  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.430397  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  54.93 
 
 
330 aa  342  2.9999999999999997e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  51.9 
 
 
356 aa  341  8e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  52.22 
 
 
362 aa  340  2e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  51.58 
 
 
357 aa  338  5.9999999999999996e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  50.16 
 
 
367 aa  335  5e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  56.69 
 
 
372 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  50.49 
 
 
367 aa  334  1e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  57.49 
 
 
377 aa  333  3e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  50.16 
 
 
367 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  51.13 
 
 
372 aa  331  8e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  53.4 
 
 
330 aa  331  1e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  50.79 
 
 
332 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  52.43 
 
 
364 aa  326  4.0000000000000003e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  49.84 
 
 
380 aa  324  9e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  49.84 
 
 
380 aa  324  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  49.84 
 
 
326 aa  324  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  49.84 
 
 
326 aa  324  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  54.22 
 
 
378 aa  323  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  50.16 
 
 
380 aa  323  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  51.32 
 
 
366 aa  324  2e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  49.84 
 
 
326 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  49.51 
 
 
380 aa  322  5e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  49.51 
 
 
327 aa  322  6e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  47.3 
 
 
373 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  52.76 
 
 
383 aa  319  3.9999999999999996e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  48.08 
 
 
357 aa  318  7e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  49.19 
 
 
326 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  48.71 
 
 
362 aa  318  9e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  50 
 
 
366 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  50.81 
 
 
367 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  52.43 
 
 
366 aa  315  8e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  55.81 
 
 
369 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  52.23 
 
 
375 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  48.06 
 
 
364 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  53.42 
 
 
368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  51.62 
 
 
368 aa  312  3.9999999999999997e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1409  peptide chain release factor 2  51.78 
 
 
330 aa  311  6.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0056831  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  53.44 
 
 
369 aa  311  1e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  51.27 
 
 
368 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  51.94 
 
 
371 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  51.94 
 
 
371 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  51.29 
 
 
323 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  48.88 
 
 
368 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  50.97 
 
 
372 aa  308  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  51.61 
 
 
371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4451  peptide chain release factor 2  52.26 
 
 
372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  50.65 
 
 
378 aa  306  3e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  50.64 
 
 
343 aa  305  6e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  50.32 
 
 
374 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  50 
 
 
370 aa  303  2.0000000000000002e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  55.45 
 
 
372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  50.16 
 
 
364 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  53.42 
 
 
366 aa  302  5.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  50.97 
 
 
374 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2401  peptide chain release factor 2  49.68 
 
 
371 aa  301  8.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0455309 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3025  peptide chain release factor 2  51.44 
 
 
371 aa  301  8.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  49.03 
 
 
367 aa  301  9e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  49.03 
 
 
369 aa  301  9e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  51.29 
 
 
371 aa  301  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  50 
 
 
332 aa  300  2e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1233  peptide chain release factor 2  53.25 
 
 
370 aa  300  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  51.78 
 
 
367 aa  300  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2271  peptide chain release factor 2  50.33 
 
 
310 aa  299  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2666  peptide chain release factor 2  49.84 
 
 
371 aa  300  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  49.68 
 
 
373 aa  300  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  46.3 
 
 
369 aa  299  5e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  46.3 
 
 
331 aa  298  7e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  50.81 
 
 
369 aa  297  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  49.52 
 
 
360 aa  297  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  48.81 
 
 
317 aa  297  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3456  peptide chain release factor 2  50.97 
 
 
371 aa  297  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  45.48 
 
 
334 aa  297  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0863  peptide chain release factor 2  49.68 
 
 
369 aa  296  2e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  48.41 
 
 
372 aa  296  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  49.68 
 
 
373 aa  296  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  48.69 
 
 
371 aa  296  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1034  peptide chain release factor 2  49.68 
 
 
370 aa  296  4e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  48.86 
 
 
365 aa  295  6e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  49.34 
 
 
312 aa  295  7e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0404  peptide chain release factor 2  50.34 
 
 
304 aa  295  8e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.660682  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  47.34 
 
 
349 aa  295  9e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  49.06 
 
 
369 aa  295  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  50.48 
 
 
371 aa  294  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  48.2 
 
 
372 aa  294  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1310  peptide chain release factor 2  49.67 
 
 
329 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.496606  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  47.34 
 
 
349 aa  294  2e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  50.49 
 
 
326 aa  293  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5798  peptide chain release factor 2  53.04 
 
 
386 aa  293  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  50.97 
 
 
369 aa  291  7e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13122  peptide chain release factor 2  55.6 
 
 
378 aa  291  9e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.44652 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  46.23 
 
 
341 aa  291  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  48.05 
 
 
378 aa  290  2e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07580  peptide chain release factor 2  48.23 
 
 
373 aa  290  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.932102  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  48.2 
 
 
382 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  49 
 
 
332 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3371  peptide chain release factor 2  48.68 
 
 
378 aa  290  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518428  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>