More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09020 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_09020  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 369 aa  753    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.140459  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1999  peptide chain release factor 2  70.79 
 
 		 364 aa  499  1e-140  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.285694  hitchhiker  0.0000104835 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05470  peptide chain release factor 2  66.01 
 
 		 364 aa  497  1e-139  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  55.77 
 
 		 369 aa  417  9.999999999999999e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 372 aa  329  5.0000000000000004e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  45.48 
 
 		 367 aa  328  7e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  48.49 
 
 		 378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  44.82 
 
 		 366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  45.18 
 
 		 367 aa  326  3e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  48.8 
 
 		 375 aa  325  7e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  45.63 
 
 		 372 aa  324  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  48.85 
 
 		 367 aa  323  4e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  45.38 
 
 		 366 aa  322  6e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  44.17 
 
 		 383 aa  322  6e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  45.79 
 
 		 369 aa  321  9.999999999999999e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  47.84 
 
 		 332 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  50.76 
 
 		 366 aa  318  6e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  47.11 
 
 		 366 aa  318  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  46.04 
 
 		 357 aa  317  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  44.82 
 
 		 373 aa  317  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  44.51 
 
 		 364 aa  316  4e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  47.26 
 
 		 364 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  48.64 
 
 		 378 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  44.75 
 
 		 371 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  46.69 
 
 		 372 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  42.02 
 
 		 367 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  45.09 
 
 		 369 aa  310  2e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3025  peptide chain release factor 2  49.4 
 
 		 371 aa  307  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  48.47 
 
 		 349 aa  306  3e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4451  peptide chain release factor 2  48.81 
 
 		 372 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  47.92 
 
 		 371 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  47.92 
 
 		 371 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  41.57 
 
 		 380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  48.47 
 
 		 349 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  41.57 
 
 		 380 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3456  peptide chain release factor 2  47.08 
 
 		 371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  48.11 
 
 		 325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  46.46 
 
 		 330 aa  303  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  41.57 
 
 		 380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  41.57 
 
 		 380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  43.18 
 
 		 377 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  47.62 
 
 		 371 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  42.98 
 
 		 372 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  44.63 
 
 		 367 aa  302  7.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  48.6 
 
 		 326 aa  301  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  42.86 
 
 		 369 aa  301  1e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  47.83 
 
 		 369 aa  301  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  42.13 
 
 		 367 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  43.3 
 
 		 372 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  41.74 
 
 		 365 aa  301  2e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  47.2 
 
 		 373 aa  300  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  43.14 
 
 		 375 aa  299  4e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  43.18 
 
 		 368 aa  299  6e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  43.7 
 
 		 376 aa  298  7e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  46.22 
 
 		 369 aa  298  7e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  45.59 
 
 		 332 aa  298  8e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  48.05 
 
 		 368 aa  298  8e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  43.71 
 
 		 375 aa  298  1e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1233  peptide chain release factor 2  46.55 
 
 		 370 aa  297  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  41.24 
 
 		 362 aa  296  4e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  45.76 
 
 		 368 aa  296  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  45.96 
 
 		 331 aa  296  5e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  43.58 
 
 		 374 aa  296  5e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  44.54 
 
 		 367 aa  296  5e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  44.18 
 
 		 369 aa  296  5e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  45.27 
 
 		 365 aa  295  6e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  45.27 
 
 		 365 aa  295  6e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  40.6 
 
 		 371 aa  296  6e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  45.27 
 
 		 365 aa  295  6e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  45.27 
 
 		 365 aa  295  6e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  46.31 
 
 		 373 aa  295  6e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  45.27 
 
 		 365 aa  295  6e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  40.96 
 
 		 364 aa  295  8e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  45.27 
 
 		 365 aa  295  9e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  45.97 
 
 		 340 aa  295  9e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  43.29 
 
 		 341 aa  295  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  43.9 
 
 		 337 aa  294  1e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  46.35 
 
 		 369 aa  294  1e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  40.73 
 
 		 362 aa  293  2e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  44.79 
 
 		 365 aa  293  2e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  48.77 
 
 		 330 aa  294  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  44.07 
 
 		 361 aa  294  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  45.17 
 
 		 330 aa  294  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  43.17 
 
 		 327 aa  293  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  44.58 
 
 		 343 aa  293  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  44.01 
 
 		 371 aa  293  4e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  44.7 
 
 		 365 aa  293  4e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  45.04 
 
 		 374 aa  292  5e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  49.82 
 
 		 317 aa  293  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  45.27 
 
 		 365 aa  293  5e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  48.78 
 
 		 368 aa  292  6e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  44.7 
 
 		 365 aa  292  6e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  43.84 
 
 		 367 aa  292  6e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  42.77 
 
 		 356 aa  292  8e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  46.35 
 
 		 364 aa  291  9e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  43.3 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  43.3 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5798  peptide chain release factor 2  49.55 
 
 		 386 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2666  peptide chain release factor 2  43.73 
 
 		 371 aa  291  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  47.24 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0233065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>