More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3724 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 372 aa  761    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  78.92 
 
 		 375 aa  618  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  73.57 
 
 		 378 aa  586  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  74.12 
 
 		 372 aa  576  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  68.73 
 
 		 378 aa  546  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  68.61 
 
 		 369 aa  514  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  67.86 
 
 		 367 aa  509  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  66.03 
 
 		 368 aa  507  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  66.21 
 
 		 369 aa  493  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  62.26 
 
 		 373 aa  479  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  62.26 
 
 		 373 aa  476  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  63.14 
 
 		 371 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  62.87 
 
 		 371 aa  474  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  66.48 
 
 		 368 aa  476  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  62.87 
 
 		 371 aa  474  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  60.99 
 
 		 367 aa  472  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  63.24 
 
 		 368 aa  472  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1233  peptide chain release factor 2  64.25 
 
 		 370 aa  464  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3456  peptide chain release factor 2  64.09 
 
 		 371 aa  465  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  62.4 
 
 		 374 aa  463  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  64.38 
 
 		 366 aa  464  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4451  peptide chain release factor 2  62.19 
 
 		 372 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0863  peptide chain release factor 2  60.76 
 
 		 369 aa  457  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25200  peptide chain release factor 2  59.89 
 
 		 372 aa  456  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0337024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2401  peptide chain release factor 2  60.22 
 
 		 371 aa  451  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0455309 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3025  peptide chain release factor 2  61.52 
 
 		 371 aa  453  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  59.13 
 
 		 371 aa  449  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2666  peptide chain release factor 2  60.22 
 
 		 371 aa  449  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  58.15 
 
 		 370 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20340  peptide chain release factor 2  59.39 
 
 		 371 aa  442  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13122  peptide chain release factor 2  61.19 
 
 		 378 aa  443  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.44652 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  57.73 
 
 		 378 aa  439  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1865  peptide chain release factor 2  63.36 
 
 		 376 aa  441  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00679931  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1034  peptide chain release factor 2  57.26 
 
 		 370 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1264  peptide chain release factor 2  61.77 
 
 		 375 aa  431  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111402  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5798  peptide chain release factor 2  62.3 
 
 		 386 aa  428  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07580  peptide chain release factor 2  57.46 
 
 		 373 aa  424  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.932102  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0942  peptide chain release factor 2  57.18 
 
 		 374 aa  424  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0440008  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  49.3 
 
 		 367 aa  356  5e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  49.04 
 
 		 383 aa  355  5.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  47.91 
 
 		 367 aa  341  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  50.14 
 
 		 366 aa  335  5e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  46.67 
 
 		 380 aa  334  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  46.78 
 
 		 372 aa  333  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  47.24 
 
 		 367 aa  332  5e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  46.39 
 
 		 380 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  46.89 
 
 		 366 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  48.45 
 
 		 375 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  48.45 
 
 		 365 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  46.39 
 
 		 380 aa  329  4e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  46.39 
 
 		 380 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  48.53 
 
 		 356 aa  329  6e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  46.44 
 
 		 362 aa  328  9e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  45.88 
 
 		 372 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  49.05 
 
 		 369 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  47.75 
 
 		 369 aa  326  3e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  45.82 
 
 		 373 aa  327  3e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  47.65 
 
 		 377 aa  325  8.000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  46.15 
 
 		 364 aa  325  9e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  43.75 
 
 		 372 aa  325  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  47.65 
 
 		 361 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  48.53 
 
 		 356 aa  323  2e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  46.57 
 
 		 371 aa  323  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  48.28 
 
 		 378 aa  323  4e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  43.6 
 
 		 367 aa  322  8e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  49.08 
 
 		 330 aa  321  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  46.59 
 
 		 357 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  46.97 
 
 		 364 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  43.6 
 
 		 367 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  46.58 
 
 		 365 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  46.07 
 
 		 368 aa  319  5e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  48.61 
 
 		 327 aa  318  1e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  46.33 
 
 		 367 aa  317  2e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  50.47 
 
 		 330 aa  317  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  46.01 
 
 		 364 aa  316  4e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  48.3 
 
 		 326 aa  315  6e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  45.3 
 
 		 362 aa  315  8e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  48.3 
 
 		 326 aa  315  9e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  48.3 
 
 		 326 aa  315  9e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  44.54 
 
 		 374 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  45.82 
 
 		 369 aa  314  9.999999999999999e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  45.99 
 
 		 356 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  47.15 
 
 		 341 aa  314  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  46.53 
 
 		 334 aa  313  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  46.72 
 
 		 365 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  47.11 
 
 		 329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  45.48 
 
 		 365 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  47.52 
 
 		 330 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  48.08 
 
 		 375 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05470  peptide chain release factor 2  44.75 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  45.48 
 
 		 364 aa  310  2e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  47.56 
 
 		 332 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  45.21 
 
 		 365 aa  311  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  47.04 
 
 		 376 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  46.63 
 
 		 360 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  42.51 
 
 		 366 aa  310  2.9999999999999997e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  46.37 
 
 		 367 aa  309  4e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  47.37 
 
 		 326 aa  309  5e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  45.95 
 
 		 349 aa  309  5.9999999999999995e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  48.77 
 
 		 325 aa  308  6.999999999999999e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>