More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1264 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1264  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 375 aa  764    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111402  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  67.21 
 
 		 370 aa  533  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2401  peptide chain release factor 2  67.65 
 
 		 371 aa  525  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0455309 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  69.44 
 
 		 374 aa  525  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  67.95 
 
 		 367 aa  525  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  69.72 
 
 		 368 aa  521  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0863  peptide chain release factor 2  69.53 
 
 		 369 aa  523  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  66.85 
 
 		 371 aa  519  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  69.15 
 
 		 371 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  66.03 
 
 		 368 aa  512  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  69.15 
 
 		 371 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1034  peptide chain release factor 2  65.94 
 
 		 370 aa  511  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  69.15 
 
 		 371 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  66.94 
 
 		 367 aa  513  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20340  peptide chain release factor 2  65.84 
 
 		 371 aa  510  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2666  peptide chain release factor 2  65.41 
 
 		 371 aa  509  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25200  peptide chain release factor 2  65.94 
 
 		 372 aa  506  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0337024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  64.4 
 
 		 373 aa  503  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07580  peptide chain release factor 2  64.59 
 
 		 373 aa  501  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.932102  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4451  peptide chain release factor 2  66.94 
 
 		 372 aa  501  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  64.67 
 
 		 373 aa  503  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  64.85 
 
 		 378 aa  500  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  65.18 
 
 		 378 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  64.46 
 
 		 369 aa  492  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  64.62 
 
 		 372 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1233  peptide chain release factor 2  65.22 
 
 		 370 aa  484  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  61.11 
 
 		 378 aa  479  1e-134  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13122  peptide chain release factor 2  67.22 
 
 		 378 aa  477  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.44652 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  64.75 
 
 		 368 aa  477  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3025  peptide chain release factor 2  65.01 
 
 		 371 aa  478  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  61.77 
 
 		 372 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3456  peptide chain release factor 2  65.01 
 
 		 371 aa  473  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  61.67 
 
 		 375 aa  474  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  61.52 
 
 		 369 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0942  peptide chain release factor 2  59.84 
 
 		 374 aa  458  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0440008  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1865  peptide chain release factor 2  61.83 
 
 		 376 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00679931  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  61.52 
 
 		 366 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5798  peptide chain release factor 2  60.49 
 
 		 386 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  46.99 
 
 		 383 aa  344  2e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  48.63 
 
 		 366 aa  342  7e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  45.51 
 
 		 366 aa  340  2e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  47.3 
 
 		 377 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  48.31 
 
 		 367 aa  334  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  49 
 
 		 356 aa  333  3e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  47.46 
 
 		 367 aa  333  3e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  48.21 
 
 		 366 aa  332  5e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  46.13 
 
 		 372 aa  330  3e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  48.24 
 
 		 356 aa  329  6e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  45.24 
 
 		 373 aa  327  3e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  47.35 
 
 		 361 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  45.1 
 
 		 369 aa  324  1e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  45.99 
 
 		 357 aa  324  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  47.66 
 
 		 372 aa  323  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  48.17 
 
 		 375 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  48.17 
 
 		 365 aa  322  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  44.99 
 
 		 372 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  45.07 
 
 		 367 aa  320  3e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  47.18 
 
 		 367 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  50.31 
 
 		 330 aa  318  7e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  47.18 
 
 		 356 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  44 
 
 		 362 aa  317  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  44.57 
 
 		 372 aa  317  2e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  46.98 
 
 		 374 aa  316  3e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  49.24 
 
 		 375 aa  317  3e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  46.67 
 
 		 332 aa  315  9e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  45.79 
 
 		 334 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  49.54 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  43.75 
 
 		 364 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  43.22 
 
 		 376 aa  313  3.9999999999999997e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  45.48 
 
 		 364 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  44.1 
 
 		 372 aa  312  6.999999999999999e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  44.86 
 
 		 371 aa  311  9e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  43.47 
 
 		 376 aa  311  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  44.66 
 
 		 380 aa  310  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  46.77 
 
 		 329 aa  311  2e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  44.97 
 
 		 357 aa  308  6.999999999999999e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  47.53 
 
 		 330 aa  308  6.999999999999999e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1904  peptide chain release factor 2  48.21 
 
 		 337 aa  309  6.999999999999999e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.430397  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  46.24 
 
 		 362 aa  308  8e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  49.07 
 
 		 330 aa  308  8e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  48.12 
 
 		 369 aa  308  8e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  47.08 
 
 		 332 aa  308  8e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  44.38 
 
 		 380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  49.84 
 
 		 322 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  44.66 
 
 		 380 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  44.1 
 
 		 380 aa  306  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  46.15 
 
 		 372 aa  306  3e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  47.55 
 
 		 341 aa  306  4.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  44.51 
 
 		 371 aa  306  5.0000000000000004e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  45.11 
 
 		 361 aa  305  8.000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  44.26 
 
 		 369 aa  305  9.000000000000001e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01981  peptide chain release factor 2  44.71 
 
 		 354 aa  305  9.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0513147  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  46.24 
 
 		 349 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  43.73 
 
 		 375 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  48.31 
 
 		 325 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  45.22 
 
 		 356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  46.8 
 
 		 360 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  45.95 
 
 		 349 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  45.35 
 
 		 402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  49.01 
 
 		 323 aa  302  7.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>