More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1904 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1904  peptide chain release factor 2  100 
 
 
337 aa  689    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.430397  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  59.76 
 
 
367 aa  417  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4162  peptide chain release factor 2  62.26 
 
 
317 aa  392  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.155408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3345  peptide chain release factor 2  61.09 
 
 
317 aa  391  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.219994  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  51.35 
 
 
367 aa  353  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  50.75 
 
 
367 aa  347  2e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  50.45 
 
 
367 aa  346  3e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  50.15 
 
 
362 aa  342  4e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  50 
 
 
366 aa  338  9.999999999999999e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  51.05 
 
 
367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  50 
 
 
330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  53.11 
 
 
369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  48.63 
 
 
357 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  49.24 
 
 
356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  50 
 
 
366 aa  335  7e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  48.8 
 
 
364 aa  335  9e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  50.75 
 
 
364 aa  334  1e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  49.4 
 
 
380 aa  334  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  49.1 
 
 
380 aa  334  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  49.1 
 
 
380 aa  333  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  48.8 
 
 
380 aa  333  3e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  50.3 
 
 
383 aa  332  6e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  50 
 
 
326 aa  330  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  50 
 
 
326 aa  330  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  47.45 
 
 
372 aa  330  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  49.38 
 
 
332 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 
327 aa  328  6e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  49.69 
 
 
326 aa  328  8e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  47.73 
 
 
373 aa  328  9e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  49.7 
 
 
377 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  50.59 
 
 
367 aa  325  5e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 
378 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  48.19 
 
 
365 aa  324  1e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  50.15 
 
 
368 aa  324  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  50.77 
 
 
330 aa  323  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  47.29 
 
 
364 aa  323  3e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  50 
 
 
372 aa  322  5e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  46.85 
 
 
357 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  48.45 
 
 
349 aa  320  3e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  48.77 
 
 
326 aa  320  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  48.15 
 
 
325 aa  319  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  46.08 
 
 
365 aa  318  7e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  46.69 
 
 
365 aa  318  7.999999999999999e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  48.3 
 
 
367 aa  318  9e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  47.83 
 
 
349 aa  317  1e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  46.08 
 
 
365 aa  317  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  47.31 
 
 
367 aa  317  1e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  46.08 
 
 
365 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  46.08 
 
 
365 aa  317  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  47.79 
 
 
369 aa  317  2e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  46.08 
 
 
365 aa  317  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  46.08 
 
 
365 aa  317  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  46.08 
 
 
332 aa  316  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  51.83 
 
 
369 aa  316  3e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2271  peptide chain release factor 2  52.51 
 
 
310 aa  316  4e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  45.78 
 
 
365 aa  315  5e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  45.78 
 
 
365 aa  315  5e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  46.22 
 
 
362 aa  315  5e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  46.75 
 
 
382 aa  315  7e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  46.22 
 
 
364 aa  315  7e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  48.97 
 
 
368 aa  315  9e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  46.08 
 
 
365 aa  314  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1216  peptide chain release factor 2  47.29 
 
 
347 aa  315  9.999999999999999e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000777998  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  47.45 
 
 
372 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  47.04 
 
 
379 aa  314  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2401  peptide chain release factor 2  48.66 
 
 
371 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0455309 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  47.22 
 
 
375 aa  313  1.9999999999999998e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  49.1 
 
 
375 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  48.8 
 
 
364 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  49.1 
 
 
366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3429  peptide chain release factor 2  46.27 
 
 
329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883546 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  45.82 
 
 
349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  52.11 
 
 
372 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  47.68 
 
 
357 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3371  peptide chain release factor 2  47.37 
 
 
378 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518428  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1310  peptide chain release factor 2  47.37 
 
 
329 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.496606  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  47.29 
 
 
354 aa  312  4.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  47.68 
 
 
357 aa  311  6.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  47.06 
 
 
359 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  48.05 
 
 
361 aa  311  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0793  peptide chain release factor 2  46.36 
 
 
331 aa  310  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  49.7 
 
 
378 aa  310  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  44.88 
 
 
365 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  44.21 
 
 
334 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  44.72 
 
 
365 aa  309  4e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0725  peptide chain release factor 2  45.18 
 
 
332 aa  309  4e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159955  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2666  peptide chain release factor 2  48.37 
 
 
371 aa  309  4e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  49.26 
 
 
374 aa  309  5e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  45.51 
 
 
349 aa  308  8e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  50.45 
 
 
368 aa  308  8e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  46.69 
 
 
367 aa  308  8e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0863  peptide chain release factor 2  48.06 
 
 
369 aa  308  8e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  46.69 
 
 
367 aa  308  9e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  48.5 
 
 
372 aa  308  9e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  46.58 
 
 
349 aa  308  9e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  46.69 
 
 
367 aa  308  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  48.77 
 
 
341 aa  308  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5751  hypothetical protein  45.29 
 
 
358 aa  308  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  50.65 
 
 
317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  49.4 
 
 
373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>