More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1637 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 369 aa  756    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  75.41 
 
 		 367 aa  566  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  73.5 
 
 		 368 aa  547  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3025  peptide chain release factor 2  71.78 
 
 		 371 aa  538  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  71.51 
 
 		 371 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  71 
 
 		 368 aa  531  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  71.51 
 
 		 371 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  71.51 
 
 		 371 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  72.93 
 
 		 368 aa  534  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3456  peptide chain release factor 2  71.51 
 
 		 371 aa  534  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4451  peptide chain release factor 2  71.51 
 
 		 372 aa  530  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  71.11 
 
 		 373 aa  530  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1233  peptide chain release factor 2  71.89 
 
 		 370 aa  529  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  70.3 
 
 		 367 aa  528  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  70.56 
 
 		 373 aa  526  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  68.77 
 
 		 372 aa  521  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  68.94 
 
 		 378 aa  518  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  67.31 
 
 		 375 aa  511  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  68.22 
 
 		 378 aa  513  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  69.42 
 
 		 374 aa  506  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0863  peptide chain release factor 2  67.66 
 
 		 369 aa  501  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13122  peptide chain release factor 2  69.89 
 
 		 378 aa  495  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.44652 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2401  peptide chain release factor 2  67.87 
 
 		 371 aa  496  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0455309 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25200  peptide chain release factor 2  67.31 
 
 		 372 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0337024  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  66.76 
 
 		 371 aa  497  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1034  peptide chain release factor 2  66.3 
 
 		 370 aa  494  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  66.21 
 
 		 372 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20340  peptide chain release factor 2  65.65 
 
 		 371 aa  489  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  67.81 
 
 		 369 aa  490  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2666  peptide chain release factor 2  66.11 
 
 		 371 aa  484  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  62.87 
 
 		 370 aa  481  1e-135  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07580  peptide chain release factor 2  64.9 
 
 		 373 aa  478  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.932102  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1865  peptide chain release factor 2  67.93 
 
 		 376 aa  481  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00679931  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0942  peptide chain release factor 2  68.12 
 
 		 374 aa  471  1e-132  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0440008  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  62.4 
 
 		 378 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  65.68 
 
 		 366 aa  470  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1264  peptide chain release factor 2  63.64 
 
 		 375 aa  457  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111402  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5798  peptide chain release factor 2  64.32 
 
 		 386 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  51.56 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  53.56 
 
 		 369 aa  341  1e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  47.78 
 
 		 383 aa  338  8e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  51.66 
 
 		 367 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  50.46 
 
 		 362 aa  332  5e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  47.99 
 
 		 362 aa  330  2e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  47.4 
 
 		 372 aa  330  3e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  47.99 
 
 		 367 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  48.37 
 
 		 357 aa  329  4e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  48.52 
 
 		 356 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  47.7 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  47.81 
 
 		 372 aa  326  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  44.7 
 
 		 366 aa  326  3e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  47.63 
 
 		 357 aa  325  6e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  52.48 
 
 		 330 aa  325  7e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  47.28 
 
 		 369 aa  324  1e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  46.24 
 
 		 369 aa  323  2e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  47.86 
 
 		 368 aa  323  3e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  44.7 
 
 		 373 aa  323  3e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  47.9 
 
 		 371 aa  322  5e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  48 
 
 		 372 aa  321  9.999999999999999e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 356 aa  320  3e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  46.03 
 
 		 377 aa  320  3e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 356 aa  318  9e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  50.16 
 
 		 375 aa  318  1e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  45.71 
 
 		 376 aa  318  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  48.49 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  49.41 
 
 		 343 aa  316  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  43.13 
 
 		 367 aa  316  4e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  46.86 
 
 		 367 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  48.87 
 
 		 378 aa  313  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  48.12 
 
 		 364 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  47.26 
 
 		 330 aa  314  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  45.13 
 
 		 367 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  46 
 
 		 375 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  45.74 
 
 		 367 aa  311  7.999999999999999e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  45.13 
 
 		 372 aa  310  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  50.61 
 
 		 340 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  47.63 
 
 		 356 aa  308  8e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  44.86 
 
 		 380 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  47.26 
 
 		 364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  49.07 
 
 		 330 aa  306  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1904  peptide chain release factor 2  48.8 
 
 		 337 aa  306  4.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.430397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  46.13 
 
 		 380 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  46.43 
 
 		 380 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  46.42 
 
 		 334 aa  305  6e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  45.2 
 
 		 374 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  45.83 
 
 		 380 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  47.34 
 
 		 332 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  45.85 
 
 		 341 aa  301  9e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  52.7 
 
 		 317 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  43.4 
 
 		 376 aa  301  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  46.44 
 
 		 331 aa  301  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  46.89 
 
 		 326 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  46.89 
 
 		 326 aa  300  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  46.89 
 
 		 326 aa  300  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  47.55 
 
 		 332 aa  301  2e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  46.91 
 
 		 327 aa  300  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  44.07 
 
 		 375 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  45.93 
 
 		 372 aa  300  4e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  46.36 
 
 		 344 aa  300  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  44.07 
 
 		 365 aa  299  5e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>