More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0791 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 366 aa  735    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5798  peptide chain release factor 2  89.32 
 
 		 386 aa  609  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  65.4 
 
 		 378 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  65.48 
 
 		 378 aa  491  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  65.57 
 
 		 372 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  65.68 
 
 		 369 aa  485  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  65.21 
 
 		 375 aa  485  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  67.79 
 
 		 369 aa  484  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  65.38 
 
 		 367 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  64.38 
 
 		 372 aa  476  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  64.67 
 
 		 368 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  64.19 
 
 		 368 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3456  peptide chain release factor 2  64.48 
 
 		 371 aa  462  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4451  peptide chain release factor 2  63.11 
 
 		 372 aa  462  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  63.39 
 
 		 371 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  63.99 
 
 		 373 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  63.39 
 
 		 371 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  63.11 
 
 		 371 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  63.71 
 
 		 373 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3025  peptide chain release factor 2  60.66 
 
 		 371 aa  448  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1233  peptide chain release factor 2  63.86 
 
 		 370 aa  450  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0863  peptide chain release factor 2  60.27 
 
 		 369 aa  444  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  60.33 
 
 		 367 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  61.48 
 
 		 368 aa  441  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  61.54 
 
 		 374 aa  444  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2401  peptide chain release factor 2  60.66 
 
 		 371 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0455309 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  56.76 
 
 		 370 aa  440  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25200  peptide chain release factor 2  59.73 
 
 		 372 aa  434  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0337024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13122  peptide chain release factor 2  64.66 
 
 		 378 aa  436  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.44652 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1034  peptide chain release factor 2  58.47 
 
 		 370 aa  434  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20340  peptide chain release factor 2  59.12 
 
 		 371 aa  432  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  59.94 
 
 		 371 aa  433  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2666  peptide chain release factor 2  58.97 
 
 		 371 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  56.63 
 
 		 378 aa  423  1e-117  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07580  peptide chain release factor 2  56.67 
 
 		 373 aa  409  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.932102  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1865  peptide chain release factor 2  60.93 
 
 		 376 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00679931  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1264  peptide chain release factor 2  60.98 
 
 		 375 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111402  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0942  peptide chain release factor 2  57.06 
 
 		 374 aa  402  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0440008  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  51.52 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  49.59 
 
 		 383 aa  354  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  50.42 
 
 		 377 aa  346  3e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  52.2 
 
 		 356 aa  343  4e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  51.61 
 
 		 356 aa  341  1e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  51.68 
 
 		 366 aa  341  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  45.58 
 
 		 366 aa  341  2e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  46.26 
 
 		 367 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  50.14 
 
 		 369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  47.31 
 
 		 362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  46.83 
 
 		 366 aa  335  7e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  49.01 
 
 		 369 aa  335  9e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  46.74 
 
 		 364 aa  333  3e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  52.32 
 
 		 330 aa  331  1e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  47.06 
 
 		 357 aa  331  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  48.37 
 
 		 356 aa  331  1e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  47.85 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  44.85 
 
 		 367 aa  328  6e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  48.96 
 
 		 362 aa  328  9e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  48.68 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  45.43 
 
 		 367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  46.47 
 
 		 368 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  46.98 
 
 		 367 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09020  peptide chain release factor 2  50.76 
 
 		 369 aa  326  5e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.140459  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  54.04 
 
 		 330 aa  324  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3345  peptide chain release factor 2  53.23 
 
 		 317 aa  324  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.219994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  45.94 
 
 		 369 aa  323  2e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  47.43 
 
 		 371 aa  322  8e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  44.38 
 
 		 373 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 372 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4162  peptide chain release factor 2  52.43 
 
 		 317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.155408 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  46.96 
 
 		 375 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  47.35 
 
 		 356 aa  320  3e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  48.82 
 
 		 349 aa  319  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  46.96 
 
 		 365 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  45.25 
 
 		 364 aa  319  6e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05470  peptide chain release factor 2  45.81 
 
 		 364 aa  318  7e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  47.46 
 
 		 372 aa  318  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  42.16 
 
 		 372 aa  318  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  49.14 
 
 		 378 aa  317  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  48.24 
 
 		 349 aa  315  7e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  50.91 
 
 		 343 aa  315  7e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  48.2 
 
 		 372 aa  315  7e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  44.08 
 
 		 380 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  48.96 
 
 		 364 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  47.37 
 
 		 375 aa  314  9.999999999999999e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  48.38 
 
 		 365 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  46.8 
 
 		 364 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  47.79 
 
 		 365 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  44.41 
 
 		 367 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1904  peptide chain release factor 2  48.8 
 
 		 337 aa  312  4.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.430397  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  47.69 
 
 		 341 aa  312  4.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0257  peptide chain release factor 2  49.54 
 
 		 333 aa  312  4.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000258105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  43.8 
 
 		 380 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  46.9 
 
 		 365 aa  311  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  46.56 
 
 		 329 aa  311  1e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  46.67 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  46.9 
 
 		 365 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  43.8 
 
 		 380 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  46.9 
 
 		 365 aa  311  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  46.9 
 
 		 365 aa  311  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  48.19 
 
 		 372 aa  310  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>