More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5555 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  761    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  54.62 
 
 		 372 aa  391  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  54.97 
 
 		 364 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  54.83 
 
 		 326 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  50.99 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  53.93 
 
 		 366 aa  368  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  49.86 
 
 		 372 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  53.35 
 
 		 361 aa  366  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  51.54 
 
 		 383 aa  362  6e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  54.4 
 
 		 317 aa  360  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  50 
 
 		 372 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  48.75 
 
 		 367 aa  353  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  50.57 
 
 		 375 aa  352  5e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  48.46 
 
 		 364 aa  351  1e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  51.32 
 
 		 357 aa  349  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  51.66 
 
 		 340 aa  349  5e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  47.51 
 
 		 369 aa  348  6e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  48.31 
 
 		 367 aa  347  1e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  51.03 
 
 		 417 aa  346  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  48.16 
 
 		 367 aa  346  4e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  48.02 
 
 		 362 aa  345  5e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  49.16 
 
 		 379 aa  345  5e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  51.02 
 
 		 357 aa  345  8.999999999999999e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  47.74 
 
 		 364 aa  343  2e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2538  peptide chain release factor 2  50.44 
 
 		 363 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  50.58 
 
 		 391 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  47.81 
 
 		 357 aa  342  4e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  50.29 
 
 		 406 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  50.58 
 
 		 391 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  50.58 
 
 		 391 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  50.74 
 
 		 354 aa  342  5e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  47.25 
 
 		 367 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2808  LigA  54.13 
 
 		 372 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.999954  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 391 aa  339  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  52.34 
 
 		 354 aa  339  4e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 364 aa  339  4e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  47.38 
 
 		 349 aa  339  5e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  51.15 
 
 		 378 aa  339  5e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5492  peptide chain release factor 2  47.18 
 
 		 362 aa  338  8e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0496262 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  45.79 
 
 		 367 aa  338  9e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0500  peptide chain release factor 2  46.76 
 
 		 364 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  50.44 
 
 		 349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 343 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  47.09 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  45.28 
 
 		 371 aa  336  2.9999999999999997e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  47.4 
 
 		 369 aa  336  2.9999999999999997e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  48.6 
 
 		 367 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  51.59 
 
 		 374 aa  337  2.9999999999999997e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  48.6 
 
 		 367 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  47.08 
 
 		 349 aa  336  2.9999999999999997e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  50.57 
 
 		 372 aa  336  3.9999999999999995e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  49.14 
 
 		 378 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  47.47 
 
 		 365 aa  335  5.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  47.19 
 
 		 365 aa  335  5.999999999999999e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  44.7 
 
 		 373 aa  335  9e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  49.15 
 
 		 364 aa  335  9e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  46.8 
 
 		 376 aa  334  1e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  49.42 
 
 		 365 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  49.42 
 
 		 365 aa  334  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  48.32 
 
 		 367 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  49.42 
 
 		 365 aa  334  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  47.93 
 
 		 367 aa  334  2e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  49.14 
 
 		 369 aa  334  2e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5751  hypothetical protein  46.74 
 
 		 358 aa  333  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  50.29 
 
 		 367 aa  333  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  47.78 
 
 		 367 aa  333  4e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2031  peptide chain release factor 2  48.68 
 
 		 363 aa  333  4e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0138456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  46.15 
 
 		 366 aa  333  4e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  47.77 
 
 		 459 aa  333  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  49.12 
 
 		 365 aa  332  5e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  46.63 
 
 		 365 aa  332  5e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  53.73 
 
 		 331 aa  332  5e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  51.26 
 
 		 332 aa  332  5e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  47.5 
 
 		 367 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  48.28 
 
 		 372 aa  332  9e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  47.95 
 
 		 365 aa  331  1e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2784  peptide chain release factor 2  49.56 
 
 		 363 aa  331  1e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.785261  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  49.12 
 
 		 365 aa  330  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  49.71 
 
 		 349 aa  330  2e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  46.22 
 
 		 371 aa  330  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  48.58 
 
 		 369 aa  330  2e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  48.41 
 
 		 367 aa  330  3e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  47.95 
 
 		 365 aa  329  6e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0725  peptide chain release factor 2  51.7 
 
 		 332 aa  328  7e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159955  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  44.54 
 
 		 365 aa  328  8e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  44.59 
 
 		 380 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0584  peptide chain release factor 2  46.39 
 
 		 366 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  44.86 
 
 		 380 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  49.53 
 
 		 330 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  46.56 
 
 		 369 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  47.28 
 
 		 375 aa  328  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  47.29 
 
 		 364 aa  327  1.0000000000000001e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  47.51 
 
 		 359 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  51.84 
 
 		 312 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  45.81 
 
 		 380 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  49.12 
 
 		 349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  49.11 
 
 		 356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1216  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000777998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1069  peptide chain release factor 2  48.39 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  49.41 
 
 		 362 aa  326  3e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>