More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_25200 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0863  peptide chain release factor 2  86.03 
 
 		 369 aa  640    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25200  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 372 aa  754    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0337024  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  79.4 
 
 		 371 aa  607  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  80.6 
 
 		 374 aa  606  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1034  peptide chain release factor 2  77.72 
 
 		 370 aa  590  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2401  peptide chain release factor 2  78.96 
 
 		 371 aa  585  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0455309 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2666  peptide chain release factor 2  77.32 
 
 		 371 aa  575  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  73.7 
 
 		 370 aa  556  1e-157  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20340  peptide chain release factor 2  73.5 
 
 		 371 aa  556  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07580  peptide chain release factor 2  74.32 
 
 		 373 aa  552  1e-156  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.932102  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  68.6 
 
 		 367 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  64.77 
 
 		 378 aa  503  1e-141  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4451  peptide chain release factor 2  65.4 
 
 		 372 aa  497  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  67.31 
 
 		 369 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  63.96 
 
 		 373 aa  495  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  63.69 
 
 		 373 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  65.21 
 
 		 371 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  65.21 
 
 		 371 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  65.21 
 
 		 371 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  64.48 
 
 		 368 aa  490  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  66.39 
 
 		 367 aa  490  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1233  peptide chain release factor 2  66.85 
 
 		 370 aa  487  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  65.48 
 
 		 368 aa  487  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0942  peptide chain release factor 2  63.69 
 
 		 374 aa  479  1e-134  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0440008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  61.83 
 
 		 372 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3025  peptide chain release factor 2  63.26 
 
 		 371 aa  466  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1264  peptide chain release factor 2  65.4 
 
 		 375 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111402  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  60.43 
 
 		 375 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3456  peptide chain release factor 2  62.98 
 
 		 371 aa  460  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  61.19 
 
 		 368 aa  459  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  59.89 
 
 		 372 aa  456  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  60.43 
 
 		 378 aa  457  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13122  peptide chain release factor 2  63.22 
 
 		 378 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.44652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  58.92 
 
 		 378 aa  448  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1865  peptide chain release factor 2  63.41 
 
 		 376 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00679931  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  59.5 
 
 		 369 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  59.73 
 
 		 366 aa  426  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5798  peptide chain release factor 2  60.27 
 
 		 386 aa  398  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  46.4 
 
 		 383 aa  335  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  46.99 
 
 		 367 aa  322  9.000000000000001e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  49.03 
 
 		 366 aa  321  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  44.63 
 
 		 367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  47.95 
 
 		 372 aa  318  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  43.66 
 
 		 362 aa  315  7e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  43.6 
 
 		 369 aa  315  7e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  45.88 
 
 		 377 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  44.69 
 
 		 366 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  43.38 
 
 		 364 aa  312  6.999999999999999e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  44.9 
 
 		 368 aa  311  9e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  44.6 
 
 		 375 aa  310  2e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  44.13 
 
 		 367 aa  310  2e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  42.78 
 
 		 372 aa  310  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  42.37 
 
 		 366 aa  310  2.9999999999999997e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  43.63 
 
 		 357 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  46.94 
 
 		 356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  44.48 
 
 		 356 aa  307  3e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  46.94 
 
 		 356 aa  306  5.0000000000000004e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  43.85 
 
 		 362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  44.75 
 
 		 367 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  47.41 
 
 		 378 aa  302  7.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  46.76 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  41.02 
 
 		 367 aa  301  1e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  44.32 
 
 		 374 aa  301  1e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  41.88 
 
 		 373 aa  301  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  44.02 
 
 		 369 aa  300  2e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  47.42 
 
 		 330 aa  300  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  46.25 
 
 		 330 aa  300  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  42.53 
 
 		 357 aa  300  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  45.56 
 
 		 372 aa  300  4e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  47.8 
 
 		 364 aa  299  5e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  43.79 
 
 		 364 aa  296  3e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  44.54 
 
 		 372 aa  296  4e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  44.51 
 
 		 402 aa  296  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  44.02 
 
 		 356 aa  296  5e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  45.51 
 
 		 375 aa  296  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  44.38 
 
 		 349 aa  295  7e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  45.27 
 
 		 376 aa  294  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  44.81 
 
 		 365 aa  294  2e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  44.38 
 
 		 332 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05470  peptide chain release factor 2  44.67 
 
 		 364 aa  293  2e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1904  peptide chain release factor 2  44.9 
 
 		 337 aa  293  3e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.430397  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  42.62 
 
 		 376 aa  293  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  46.34 
 
 		 369 aa  293  4e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  44.92 
 
 		 334 aa  293  5e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  42.77 
 
 		 329 aa  292  6e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  42.27 
 
 		 361 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  43.8 
 
 		 349 aa  291  1e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3345  peptide chain release factor 2  49.06 
 
 		 317 aa  291  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.219994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  40.76 
 
 		 372 aa  291  1e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  41.1 
 
 		 369 aa  291  1e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  44.54 
 
 		 371 aa  290  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  40.16 
 
 		 367 aa  290  2e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  42.08 
 
 		 375 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  42.08 
 
 		 365 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1938  hypothetical protein  43.18 
 
 		 370 aa  290  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374727  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  43.23 
 
 		 360 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0868  peptide chain release factor 2  46.18 
 
 		 374 aa  290  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  45.13 
 
 		 361 aa  290  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  45.59 
 
 		 332 aa  290  4e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  41.13 
 
 		 367 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>