More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1938 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1938  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  757    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374727  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0555  Peptide chain release factor 2  68.72 
 
 		 376 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000388438 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1805  peptide chain release factor 2  65.27 
 
 		 358 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.361195  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  61.79 
 
 		 371 aa  484  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  63.11 
 
 		 369 aa  481  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1302  peptide chain release factor 2  70.36 
 
 		 310 aa  448  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.240882  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  47.79 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  47.79 
 
 		 372 aa  363  3e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  47.25 
 
 		 380 aa  361  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  47.63 
 
 		 366 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  50 
 
 		 383 aa  359  3e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  50.14 
 
 		 377 aa  359  5e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  46.98 
 
 		 380 aa  358  9e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  46.98 
 
 		 380 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  46.98 
 
 		 380 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  47.79 
 
 		 367 aa  353  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  49.86 
 
 		 366 aa  350  3e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  50.94 
 
 		 332 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  50.78 
 
 		 327 aa  342  7e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  49.43 
 
 		 357 aa  341  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  47.11 
 
 		 369 aa  340  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  50.16 
 
 		 326 aa  339  5e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  50.16 
 
 		 326 aa  338  7e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  50.16 
 
 		 326 aa  338  7e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  50.74 
 
 		 343 aa  338  8e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  47.16 
 
 		 379 aa  338  8e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  50.16 
 
 		 326 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  48.17 
 
 		 372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  49.58 
 
 		 376 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  47.78 
 
 		 375 aa  334  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  43.43 
 
 		 367 aa  333  3e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  44.16 
 
 		 367 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  48.1 
 
 		 373 aa  332  9e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  51.7 
 
 		 331 aa  331  1e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  49.38 
 
 		 332 aa  331  1e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  56.23 
 
 		 312 aa  331  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  49.44 
 
 		 376 aa  330  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  48.6 
 
 		 371 aa  330  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  48.73 
 
 		 368 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  52.01 
 
 		 326 aa  326  3e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  47.51 
 
 		 375 aa  326  5e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  44.48 
 
 		 371 aa  325  6e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  46.37 
 
 		 375 aa  325  7e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  47.75 
 
 		 369 aa  325  7e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  50.31 
 
 		 331 aa  325  8.000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  47.22 
 
 		 367 aa  323  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  47.77 
 
 		 364 aa  323  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  44.54 
 
 		 365 aa  323  4e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  43.49 
 
 		 367 aa  323  4e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  50.8 
 
 		 334 aa  323  4e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  51.13 
 
 		 321 aa  322  5e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  44.54 
 
 		 365 aa  322  6e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  44.54 
 
 		 365 aa  322  6e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  44.54 
 
 		 365 aa  322  6e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2216  peptide chain release factor 2 (bRF-2)  50.89 
 
 		 344 aa  321  9.999999999999999e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00549966  hitchhiker  0.00000471368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  52.98 
 
 		 322 aa  321  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  49.7 
 
 		 330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  43.68 
 
 		 362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  45.56 
 
 		 374 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  47.8 
 
 		 375 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  43.26 
 
 		 366 aa  319  3.9999999999999996e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  44.26 
 
 		 365 aa  319  5e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  43.98 
 
 		 365 aa  319  5e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  48.63 
 
 		 364 aa  319  6e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  45 
 
 		 364 aa  318  7.999999999999999e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  47.56 
 
 		 330 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  44.75 
 
 		 375 aa  318  1e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  44.26 
 
 		 365 aa  317  1e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  43.98 
 
 		 365 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  47.16 
 
 		 349 aa  317  2e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  43.01 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  42.58 
 
 		 372 aa  317  2e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  45.07 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  46.22 
 
 		 371 aa  317  3e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  43.98 
 
 		 365 aa  317  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  51.78 
 
 		 317 aa  316  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  43.98 
 
 		 365 aa  316  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  48.65 
 
 		 376 aa  316  5e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  54.14 
 
 		 369 aa  315  7e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0500  peptide chain release factor 2  47.01 
 
 		 364 aa  315  9e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  46.87 
 
 		 349 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  47.01 
 
 		 329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 344 aa  313  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1767  peptide chain release factor 2  51.2 
 
 		 337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  47.95 
 
 		 325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  46.84 
 
 		 375 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  45.27 
 
 		 337 aa  313  3.9999999999999997e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  39.89 
 
 		 365 aa  312  4.999999999999999e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  44.6 
 
 		 371 aa  312  5.999999999999999e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  49.19 
 
 		 362 aa  312  5.999999999999999e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  47.08 
 
 		 361 aa  312  5.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  51.46 
 
 		 322 aa  312  6.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  42.7 
 
 		 372 aa  312  6.999999999999999e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  43.14 
 
 		 365 aa  312  7.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  44.26 
 
 		 365 aa  311  7.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  45.61 
 
 		 362 aa  310  2e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  50.16 
 
 		 323 aa  309  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  44.6 
 
 		 356 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  45.18 
 
 		 369 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2575  peptide chain release factor 2  46.65 
 
 		 367 aa  309  5.9999999999999995e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>