More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1767 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1767  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 337 aa  686    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  52.85 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  58.9 
 
 		 312 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  56.72 
 
 		 366 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  52.25 
 
 		 364 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  53.17 
 
 		 383 aa  363  3e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  54.52 
 
 		 379 aa  360  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  50.61 
 
 		 380 aa  358  8e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  50.61 
 
 		 380 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 		 380 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 		 380 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  51.84 
 
 		 326 aa  354  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  51.21 
 
 		 366 aa  353  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  50.3 
 
 		 367 aa  352  7e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  51.26 
 
 		 326 aa  351  8e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  51.26 
 
 		 326 aa  351  8e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  50.94 
 
 		 327 aa  351  1e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  51.26 
 
 		 326 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  49.85 
 
 		 372 aa  350  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  51.79 
 
 		 372 aa  349  4e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  48.66 
 
 		 373 aa  348  8e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  52.38 
 
 		 364 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  51.65 
 
 		 375 aa  345  6e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  50.45 
 
 		 372 aa  344  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  50.6 
 
 		 364 aa  343  2e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  53.11 
 
 		 331 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  52.98 
 
 		 375 aa  342  4e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  51.81 
 
 		 376 aa  342  5e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 326 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  52.77 
 
 		 323 aa  342  7e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  49.85 
 
 		 367 aa  341  1e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  49.1 
 
 		 367 aa  341  1e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  49.7 
 
 		 367 aa  340  2e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 332 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  49.1 
 
 		 371 aa  340  2e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  49.11 
 
 		 368 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 		 369 aa  339  4e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  49.7 
 
 		 367 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  51.25 
 
 		 334 aa  338  7e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  50.9 
 
 		 376 aa  337  9.999999999999999e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0500  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2040  peptide chain release factor 2  53.27 
 
 		 322 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  49.55 
 
 		 343 aa  336  3.9999999999999995e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1938  hypothetical protein  51.2 
 
 		 370 aa  335  5e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374727  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  47.73 
 
 		 369 aa  335  5e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  51.04 
 
 		 365 aa  335  9e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  51.8 
 
 		 365 aa  334  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  49.55 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  51.94 
 
 		 349 aa  334  1e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 369 aa  334  1e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  51.34 
 
 		 361 aa  333  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  47.27 
 
 		 357 aa  333  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  50.63 
 
 		 375 aa  333  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  51.64 
 
 		 349 aa  333  3e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  49.09 
 
 		 375 aa  333  3e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  50.75 
 
 		 365 aa  332  5e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  49.25 
 
 		 417 aa  332  5e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  49.26 
 
 		 371 aa  332  6e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  51.77 
 
 		 317 aa  332  6e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  48.15 
 
 		 331 aa  332  7.000000000000001e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0793  peptide chain release factor 2  51.52 
 
 		 331 aa  332  7.000000000000001e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  50.45 
 
 		 365 aa  331  9e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 		 365 aa  331  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 		 365 aa  331  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  51.05 
 
 		 364 aa  331  1e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 		 365 aa  331  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 		 365 aa  331  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  48.65 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  49.85 
 
 		 365 aa  330  3e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  49.85 
 
 		 365 aa  329  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1805  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 358 aa  329  3e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.361195  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0584  peptide chain release factor 2  50.59 
 
 		 366 aa  329  3e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  47.31 
 
 		 365 aa  329  4e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  53.31 
 
 		 330 aa  329  4e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1216  peptide chain release factor 2  51.64 
 
 		 347 aa  329  4e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000777998  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 378 aa  329  4e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  50.95 
 
 		 376 aa  329  4e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  50.31 
 
 		 332 aa  328  6e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  47.75 
 
 		 371 aa  328  7e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  49.7 
 
 		 364 aa  328  7e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  48.18 
 
 		 402 aa  328  7e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  48.65 
 
 		 357 aa  328  8e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  51.27 
 
 		 330 aa  328  9e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  50.31 
 
 		 330 aa  327  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  50.63 
 
 		 344 aa  327  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  51.36 
 
 		 377 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2216  peptide chain release factor 2 (bRF-2)  51.5 
 
 		 344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00549966  hitchhiker  0.00000471368 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  49.55 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  50.45 
 
 		 378 aa  326  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  46.69 
 
 		 375 aa  326  3e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  48.6 
 
 		 369 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  48.94 
 
 		 367 aa  325  8.000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  48.35 
 
 		 349 aa  325  8.000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 365 aa  324  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  52.44 
 
 		 322 aa  324  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2982  peptide chain release factor 2  51.62 
 
 		 321 aa  324  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.186364  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  48.96 
 
 		 349 aa  324  1e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  51.04 
 
 		 354 aa  324  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3208  peptide chain release factor 2  51.62 
 
 		 321 aa  324  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3166  peptide chain release factor 2  51.95 
 
 		 321 aa  325  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>