More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1369 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0584  peptide chain release factor 2  84.43 
 
 		 366 aa  635    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 369 aa  763    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0251  peptide chain release factor 2  84.11 
 
 		 372 aa  628  1e-179  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00360033  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0259  peptide chain release factor 2  79.95 
 
 		 366 aa  591  1e-168  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1628  peptide chain release factor 2  79.12 
 
 		 365 aa  589  1e-167  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1790  peptide chain release factor 2  79.12 
 
 		 365 aa  590  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.801319  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1448  peptide chain release factor 2  78.85 
 
 		 365 aa  588  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  74.1 
 
 		 364 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0500  peptide chain release factor 2  70.6 
 
 		 364 aa  550  1e-155  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  65.21 
 
 		 365 aa  494  1e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  51.92 
 
 		 375 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  54.24 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  54.88 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  52.54 
 
 		 357 aa  368  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  53.64 
 
 		 349 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  52.4 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  54.88 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  53.64 
 
 		 459 aa  368  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  50.85 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  54.88 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  51.01 
 
 		 375 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  54.57 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  54.24 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  54.88 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  52.73 
 
 		 379 aa  368  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  54.24 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  49.72 
 
 		 367 aa  368  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  52.54 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  51.56 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  51.27 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  49.17 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  52.41 
 
 		 364 aa  362  4e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  50.91 
 
 		 375 aa  361  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  54.85 
 
 		 354 aa  361  1e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  53.94 
 
 		 365 aa  360  3e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  49.03 
 
 		 372 aa  358  6e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  52.12 
 
 		 349 aa  358  7e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  51.52 
 
 		 354 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  53.05 
 
 		 359 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  53.33 
 
 		 365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  53.33 
 
 		 365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  50.97 
 
 		 367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  53.33 
 
 		 365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  53.33 
 
 		 365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  54.46 
 
 		 326 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  51.52 
 
 		 349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  49.18 
 
 		 376 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  53.33 
 
 		 365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  52.12 
 
 		 376 aa  357  2.9999999999999997e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  53.33 
 
 		 365 aa  355  5e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  48.2 
 
 		 369 aa  355  5.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  53.03 
 
 		 365 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  51.03 
 
 		 375 aa  355  8.999999999999999e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  53.03 
 
 		 365 aa  355  8.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  52.21 
 
 		 364 aa  353  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  52.01 
 
 		 330 aa  354  2e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  51.04 
 
 		 364 aa  354  2e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  53.33 
 
 		 365 aa  354  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2844  peptide chain release factor 2  52.66 
 
 		 325 aa  351  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  49.71 
 
 		 369 aa  351  1e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  53.17 
 
 		 340 aa  351  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  53.25 
 
 		 322 aa  351  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  47.65 
 
 		 367 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  49.44 
 
 		 383 aa  350  3e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  52.19 
 
 		 331 aa  349  5e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2274  peptide chain release factor 2  54.4 
 
 		 310 aa  349  6e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  50.6 
 
 		 365 aa  348  7e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  51.65 
 
 		 372 aa  348  7e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  50.16 
 
 		 375 aa  348  8e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  49.39 
 
 		 366 aa  348  8e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  54.37 
 
 		 317 aa  348  8e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  52.32 
 
 		 325 aa  347  1e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  50.73 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  50.61 
 
 		 344 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  49.15 
 
 		 376 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  49.06 
 
 		 369 aa  345  6e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  51.65 
 
 		 371 aa  343  2e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  46.93 
 
 		 377 aa  344  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  46.13 
 
 		 366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1030  peptide chain release factor 2 protein  55.56 
 
 		 300 aa  343  4e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  47.8 
 
 		 367 aa  342  5e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3791  hypothetical protein  48.01 
 
 		 367 aa  342  5.999999999999999e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5845  peptide chain release factor 2  52.13 
 
 		 321 aa  342  7e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0923  peptide chain release factor 2  55.05 
 
 		 310 aa  342  7e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  47.37 
 
 		 378 aa  341  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0725  peptide chain release factor 2  49.07 
 
 		 332 aa  341  1e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159955  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  49.09 
 
 		 332 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  48.18 
 
 		 376 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  50.61 
 
 		 374 aa  340  2e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  47.44 
 
 		 371 aa  340  2e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  51.27 
 
 		 364 aa  341  2e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  48.87 
 
 		 362 aa  339  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  45.38 
 
 		 365 aa  339  4e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2040  peptide chain release factor 2  52.6 
 
 		 322 aa  339  5e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  48.87 
 
 		 364 aa  339  5e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  49.4 
 
 		 373 aa  339  5.9999999999999996e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  49.55 
 
 		 349 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 349 aa  337  9.999999999999999e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  46.74 
 
 		 368 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  50.78 
 
 		 376 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>