More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2678 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  763    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  55.46 
 
 
369 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  51.66 
 
 
375 aa  385  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  50.56 
 
 
365 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  50.28 
 
 
365 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  50.28 
 
 
365 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  50.56 
 
 
365 aa  384  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  50.56 
 
 
365 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  52.22 
 
 
379 aa  383  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  51.14 
 
 
372 aa  378  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  49.17 
 
 
375 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  50.28 
 
 
365 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  50.83 
 
 
365 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  50.42 
 
 
371 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  50.71 
 
 
365 aa  377  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  50.56 
 
 
365 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  50.28 
 
 
365 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  50.55 
 
 
367 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  51.71 
 
 
373 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  52.35 
 
 
364 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  49.44 
 
 
365 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  48.9 
 
 
366 aa  371  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  49.59 
 
 
372 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  52.45 
 
 
354 aa  371  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  54.52 
 
 
332 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  51.94 
 
 
362 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  51.94 
 
 
364 aa  368  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  54.49 
 
 
368 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  50 
 
 
369 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  54.05 
 
 
367 aa  365  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  52.51 
 
 
357 aa  365  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  49.45 
 
 
364 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  49.86 
 
 
367 aa  367  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  53.35 
 
 
364 aa  366  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  48.89 
 
 
367 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  48.63 
 
 
376 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  48.76 
 
 
367 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  48.48 
 
 
367 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  48.76 
 
 
367 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  48.48 
 
 
459 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  52.22 
 
 
369 aa  364  2e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  48.21 
 
 
367 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  49.32 
 
 
380 aa  362  4e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  47.55 
 
 
372 aa  362  5.0000000000000005e-99  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  53.66 
 
 
332 aa  362  5.0000000000000005e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  50.82 
 
 
367 aa  362  8e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  50.42 
 
 
366 aa  361  1e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  49.31 
 
 
375 aa  361  1e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  48.33 
 
 
367 aa  361  1e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  49.44 
 
 
365 aa  360  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  48.48 
 
 
367 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  49.32 
 
 
380 aa  359  4e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  48.77 
 
 
380 aa  359  5e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  47.53 
 
 
366 aa  359  5e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  49.04 
 
 
380 aa  358  6e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  50.27 
 
 
371 aa  358  7e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  46.96 
 
 
376 aa  358  8e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  54.21 
 
 
326 aa  358  8e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2977  peptide chain release factor 2  48.62 
 
 
375 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1623  peptide chain release factor 2  48.62 
 
 
375 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622299  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1856  peptide chain release factor 2  48.62 
 
 
375 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  53.09 
 
 
317 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  49.86 
 
 
349 aa  356  3.9999999999999996e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  51.52 
 
 
340 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  49.71 
 
 
357 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  50.7 
 
 
365 aa  355  5e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  50 
 
 
382 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  49.43 
 
 
357 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  49.31 
 
 
376 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  52.17 
 
 
325 aa  353  2e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  53.44 
 
 
330 aa  353  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  50.58 
 
 
349 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  52.04 
 
 
329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0868  peptide chain release factor 2  47.24 
 
 
374 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395021  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  50 
 
 
383 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  47.21 
 
 
402 aa  353  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2248  hypothetical protein  48.06 
 
 
367 aa  352  5e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2758  peptide chain release factor 2  48.06 
 
 
367 aa  352  5e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3791  hypothetical protein  46.83 
 
 
367 aa  352  5e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  52.96 
 
 
327 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  51.45 
 
 
417 aa  352  7e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  48.07 
 
 
375 aa  352  8e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  49.71 
 
 
391 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  50 
 
 
359 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  49.71 
 
 
391 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  49.71 
 
 
391 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  47.79 
 
 
376 aa  351  1e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  49 
 
 
349 aa  351  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  57.86 
 
 
312 aa  351  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  49.71 
 
 
391 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  51.55 
 
 
332 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0725  peptide chain release factor 2  53.12 
 
 
332 aa  350  3e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159955  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0302  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  48.89 
 
 
365 aa  349  4e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  48.07 
 
 
364 aa  349  4e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3371  peptide chain release factor 2  47.79 
 
 
378 aa  349  5e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518428  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  49.42 
 
 
406 aa  349  5e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  51.39 
 
 
330 aa  348  7e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  50.58 
 
 
354 aa  348  7e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  46.85 
 
 
365 aa  348  7e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  52.65 
 
 
326 aa  348  9e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>