More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1057 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 365 aa  753    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  67.06 
 
 		 337 aa  474  1e-133  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  62.57 
 
 		 372 aa  467  9.999999999999999e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  59.84 
 
 		 372 aa  457  1e-127  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  56.08 
 
 		 380 aa  431  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  56.63 
 
 		 380 aa  434  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  56.08 
 
 		 380 aa  431  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  55.34 
 
 		 367 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  56.35 
 
 		 380 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  55.62 
 
 		 367 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  55.1 
 
 		 371 aa  412  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  52.42 
 
 		 373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  52.34 
 
 		 369 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  58.18 
 
 		 326 aa  403  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  58.18 
 
 		 326 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  53.02 
 
 		 383 aa  404  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  56.97 
 
 		 327 aa  404  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  57.86 
 
 		 326 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  56.92 
 
 		 326 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  58.59 
 
 		 332 aa  397  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  50.68 
 
 		 366 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  49.17 
 
 		 372 aa  385  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  54.01 
 
 		 331 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  50.42 
 
 		 368 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  54.32 
 
 		 332 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  51.18 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  50.56 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  53.37 
 
 		 332 aa  367  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  49.56 
 
 		 366 aa  364  1e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  46.11 
 
 		 377 aa  363  2e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  52.78 
 
 		 330 aa  362  8e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  47.93 
 
 		 371 aa  360  2e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  48.91 
 
 		 369 aa  360  3e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  51.08 
 
 		 329 aa  358  6e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  47.34 
 
 		 367 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  52.32 
 
 		 330 aa  354  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  49.12 
 
 		 361 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  46.5 
 
 		 367 aa  352  5e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  51.23 
 
 		 331 aa  350  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 		 364 aa  350  2e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  48.31 
 
 		 371 aa  349  5e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  46.85 
 
 		 367 aa  348  7e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  46.41 
 
 		 367 aa  344  1e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  45.83 
 
 		 362 aa  343  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  45.83 
 
 		 364 aa  342  5e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  44.6 
 
 		 371 aa  340  2e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  49.23 
 
 		 375 aa  339  5e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  45.38 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  48.45 
 
 		 369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  46.69 
 
 		 375 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  45.11 
 
 		 374 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  44.6 
 
 		 372 aa  336  5e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  45.98 
 
 		 364 aa  334  1e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  48.62 
 
 		 356 aa  334  1e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  46.07 
 
 		 365 aa  333  3e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  44.19 
 
 		 371 aa  332  8e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  45.48 
 
 		 365 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  46.03 
 
 		 365 aa  330  3e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  46.49 
 
 		 356 aa  330  3e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  45.48 
 
 		 375 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  43.79 
 
 		 372 aa  329  4e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  45.48 
 
 		 365 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  45.48 
 
 		 365 aa  329  6e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  43.61 
 
 		 366 aa  329  6e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  45.48 
 
 		 365 aa  329  6e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  45.48 
 
 		 365 aa  329  6e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  45.26 
 
 		 365 aa  328  7e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  45.28 
 
 		 367 aa  328  8e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  45.28 
 
 		 367 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  44.32 
 
 		 369 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  46.49 
 
 		 357 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  47.23 
 
 		 360 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1899  peptide chain release factor 2  45.95 
 
 		 367 aa  328  1.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0199155  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  45.61 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5751  hypothetical protein  47.98 
 
 		 358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  44.97 
 
 		 376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1216  peptide chain release factor 2  48.51 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000777998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  46.2 
 
 		 356 aa  327  3e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  44.97 
 
 		 375 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  43.9 
 
 		 365 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  45.21 
 
 		 365 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  45 
 
 		 367 aa  325  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  45 
 
 		 459 aa  324  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  49.54 
 
 		 330 aa  325  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  46.49 
 
 		 375 aa  324  1e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  44.2 
 
 		 376 aa  324  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  46.61 
 
 		 391 aa  324  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  44.17 
 
 		 365 aa  323  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  46.31 
 
 		 359 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2844  peptide chain release factor 2  48.61 
 
 		 325 aa  323  3e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  44.72 
 
 		 365 aa  323  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  44.88 
 
 		 369 aa  322  5e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0282  hypothetical protein  46.11 
 
 		 357 aa  322  7e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1805  peptide chain release factor 2  44.01 
 
 		 358 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.361195  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  43.3 
 
 		 375 aa  321  9.999999999999999e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  46.02 
 
 		 391 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  46.61 
 
 		 406 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  46.02 
 
 		 391 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  42.42 
 
 		 367 aa  321  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  46.02 
 
 		 391 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>