More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1549 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 369 aa  756    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  76.6 
 
 		 364 aa  574  1.0000000000000001e-163  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  65.38 
 
 		 367 aa  528  1e-149  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  65.38 
 
 		 367 aa  528  1e-149  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  59.02 
 
 		 366 aa  464  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  56.56 
 
 		 367 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  57.58 
 
 		 367 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  56.95 
 
 		 369 aa  424  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  55.31 
 
 		 383 aa  416  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  54.06 
 
 		 380 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  54.06 
 
 		 380 aa  411  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  53.78 
 
 		 380 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  53.78 
 
 		 380 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  57.02 
 
 		 375 aa  408  1.0000000000000001e-112  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  53.35 
 
 		 369 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  53.35 
 
 		 371 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  57.19 
 
 		 327 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  56.97 
 
 		 326 aa  396  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  56.97 
 
 		 326 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  58.39 
 
 		 330 aa  396  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  52 
 
 		 362 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  52 
 
 		 364 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  56.66 
 
 		 326 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  52.78 
 
 		 372 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  56.17 
 
 		 331 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  51.96 
 
 		 373 aa  391  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  56.71 
 
 		 326 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  54.84 
 
 		 357 aa  391  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  51.54 
 
 		 377 aa  385  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  57.1 
 
 		 330 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  50.83 
 
 		 366 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  57.83 
 
 		 331 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  54.12 
 
 		 364 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  50.85 
 
 		 372 aa  378  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  52.5 
 
 		 367 aa  377  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  50.41 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  53.7 
 
 		 332 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  54.52 
 
 		 332 aa  372  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  51.57 
 
 		 366 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  50.41 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  50.56 
 
 		 367 aa  369  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  53.03 
 
 		 374 aa  367  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  54.49 
 
 		 326 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  49.01 
 
 		 362 aa  363  2e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  49.46 
 
 		 369 aa  363  3e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  51.64 
 
 		 379 aa  362  5.0000000000000005e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  50.82 
 
 		 371 aa  361  1e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  50 
 
 		 371 aa  360  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  52.65 
 
 		 362 aa  360  2e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  47.34 
 
 		 367 aa  360  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1409  peptide chain release factor 2  56.04 
 
 		 330 aa  359  3e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0056831  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  52.94 
 
 		 329 aa  359  3e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  60.81 
 
 		 317 aa  359  5e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  50.45 
 
 		 365 aa  358  8e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  51.33 
 
 		 349 aa  358  8e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  51.33 
 
 		 349 aa  358  9e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  47.88 
 
 		 371 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  47.35 
 
 		 368 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  53.8 
 
 		 330 aa  356  3.9999999999999996e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  49 
 
 		 372 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  53.64 
 
 		 332 aa  356  3.9999999999999996e-97  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  49.4 
 
 		 365 aa  355  5.999999999999999e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2216  peptide chain release factor 2 (bRF-2)  55.42 
 
 		 344 aa  355  5.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00549966  hitchhiker  0.00000471368 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  54.58 
 
 		 312 aa  354  1e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  49.86 
 
 		 365 aa  353  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  49.11 
 
 		 356 aa  354  2e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  49.16 
 
 		 365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  49.16 
 
 		 365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  49.16 
 
 		 365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  51.23 
 
 		 337 aa  353  2.9999999999999997e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  49.16 
 
 		 365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  48.81 
 
 		 357 aa  352  5e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  49.58 
 
 		 365 aa  352  5e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  47.75 
 
 		 364 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  48.88 
 
 		 365 aa  351  8.999999999999999e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  49.3 
 
 		 365 aa  350  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05470  peptide chain release factor 2  46.82 
 
 		 364 aa  350  2e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1904  peptide chain release factor 2  52.85 
 
 		 337 aa  348  9e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.430397  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  52.31 
 
 		 341 aa  348  9e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  49.02 
 
 		 365 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  46.63 
 
 		 364 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  49.02 
 
 		 365 aa  345  5e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 361 aa  345  6e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0584  peptide chain release factor 2  48.62 
 
 		 366 aa  344  2e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2031  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 		 363 aa  343  2e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0138456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  50.31 
 
 		 325 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 		 349 aa  342  4e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  45.68 
 
 		 375 aa  342  5e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  48.97 
 
 		 354 aa  342  7e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  44.78 
 
 		 372 aa  342  7e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  48.63 
 
 		 343 aa  342  8e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  46.71 
 
 		 334 aa  340  2.9999999999999998e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 		 372 aa  340  2.9999999999999998e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  51.23 
 
 		 340 aa  339  4e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  48.18 
 
 		 375 aa  339  5e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0251  peptide chain release factor 2  49.03 
 
 		 372 aa  339  5e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00360033  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  48.97 
 
 		 354 aa  339  5.9999999999999996e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0725  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 332 aa  338  7e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159955  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  47.9 
 
 		 375 aa  338  9e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0259  peptide chain release factor 2  50.14 
 
 		 366 aa  337  9.999999999999999e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>