More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2366 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  86.29 
 
 		 372 aa  646    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 364 aa  751    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  75.77 
 
 		 361 aa  570  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  82.97 
 
 		 317 aa  559  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  73.28 
 
 		 372 aa  556  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  72.86 
 
 		 371 aa  531  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  73.75 
 
 		 340 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  64.42 
 
 		 326 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  55.88 
 
 		 379 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  55.16 
 
 		 375 aa  388  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  55.98 
 
 		 349 aa  387  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  55.88 
 
 		 364 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  55.59 
 
 		 365 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  55 
 
 		 365 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  55.1 
 
 		 349 aa  383  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  55.23 
 
 		 349 aa  383  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  53.76 
 
 		 354 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  55.92 
 
 		 376 aa  382  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  54.41 
 
 		 365 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  54.41 
 
 		 365 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  58.07 
 
 		 325 aa  381  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  55.01 
 
 		 382 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  53.24 
 
 		 367 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  55.29 
 
 		 365 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  55.75 
 
 		 375 aa  380  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  54.41 
 
 		 365 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  56.69 
 
 		 374 aa  379  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  54.41 
 
 		 365 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  55.29 
 
 		 365 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  54.41 
 
 		 365 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  55.29 
 
 		 367 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  54.12 
 
 		 365 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  54.91 
 
 		 391 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  55.29 
 
 		 367 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  54.62 
 
 		 406 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  54.41 
 
 		 365 aa  371  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  53.85 
 
 		 375 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  54.12 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  54.62 
 
 		 391 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  54.41 
 
 		 459 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  55 
 
 		 367 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1216  peptide chain release factor 2  54.84 
 
 		 347 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000777998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  54.97 
 
 		 378 aa  373  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  52.35 
 
 		 367 aa  374  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  54.91 
 
 		 391 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  54.41 
 
 		 366 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  54.89 
 
 		 354 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  54.91 
 
 		 391 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  54.15 
 
 		 364 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3371  peptide chain release factor 2  54.78 
 
 		 378 aa  371  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  53.13 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  52.74 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  53.85 
 
 		 376 aa  371  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  52.16 
 
 		 372 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  53.25 
 
 		 373 aa  369  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  53.51 
 
 		 383 aa  371  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  54.9 
 
 		 343 aa  368  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  52.31 
 
 		 359 aa  368  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  54.23 
 
 		 375 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2878  peptide chain release factor 2  55.11 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  52.06 
 
 		 367 aa  371  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3429  peptide chain release factor 2  55.21 
 
 		 329 aa  368  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883546 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2844  peptide chain release factor 2  56.43 
 
 		 325 aa  366  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  51.91 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  56.11 
 
 		 344 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  58.5 
 
 		 322 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  52.2 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  51.91 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2808  LigA  55.94 
 
 		 372 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.999954  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  53.55 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  52.2 
 
 		 357 aa  364  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  51.33 
 
 		 366 aa  364  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  51.61 
 
 		 369 aa  363  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  55.66 
 
 		 332 aa  363  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  56.35 
 
 		 323 aa  363  2e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  54.55 
 
 		 375 aa  363  3e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0793  peptide chain release factor 2  55.35 
 
 		 331 aa  363  3e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  53.49 
 
 		 378 aa  363  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2773  peptide chain release factor 2  51.7 
 
 		 355 aa  362  4e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  52.49 
 
 		 371 aa  362  6e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  53.82 
 
 		 364 aa  362  6e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  55.66 
 
 		 369 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  51.47 
 
 		 380 aa  362  8e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  58.96 
 
 		 322 aa  360  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0725  peptide chain release factor 2  55.05 
 
 		 332 aa  360  2e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  51.47 
 
 		 380 aa  360  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0961  peptide chain release factor 2  57.05 
 
 		 342 aa  359  5e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  hitchhiker  0.00626958 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  51.47 
 
 		 380 aa  359  5e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  52.66 
 
 		 367 aa  358  6e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  52.01 
 
 		 349 aa  358  8e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  52.37 
 
 		 367 aa  358  8e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  51.18 
 
 		 380 aa  358  8e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  50.88 
 
 		 365 aa  358  9e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1310  peptide chain release factor 2  53.07 
 
 		 329 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.496606  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  53.73 
 
 		 330 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  52.65 
 
 		 365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4671  peptide chain release factor 2  59.48 
 
 		 322 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2982  peptide chain release factor 2  55.8 
 
 		 321 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.186364  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  50.15 
 
 		 368 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3208  peptide chain release factor 2  55.8 
 
 		 321 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.760596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>