More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2644 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 367 aa  758    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  93 
 
 		 391 aa  668    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  99.73 
 
 		 367 aa  754    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  93 
 
 		 391 aa  670    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  98.09 
 
 		 459 aa  744    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  93 
 
 		 391 aa  670    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  93.29 
 
 		 406 aa  671    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  93 
 
 		 391 aa  670    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 367 aa  758    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  85.13 
 
 		 417 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  84.55 
 
 		 359 aa  619  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  80.38 
 
 		 367 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  80.11 
 
 		 367 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  74.66 
 
 		 367 aa  579  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  80.47 
 
 		 357 aa  579  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  79.3 
 
 		 357 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  77.26 
 
 		 349 aa  566  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  75.51 
 
 		 349 aa  560  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  75.22 
 
 		 349 aa  560  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2248  hypothetical protein  72.21 
 
 		 367 aa  554  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2758  peptide chain release factor 2  72.21 
 
 		 367 aa  554  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3791  hypothetical protein  71.12 
 
 		 367 aa  550  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2773  peptide chain release factor 2  74.64 
 
 		 355 aa  550  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  71.14 
 
 		 354 aa  532  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1562  peptide chain release factor 2  88.57 
 
 		 280 aa  534  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271557  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1030  peptide chain release factor 2 protein  81.33 
 
 		 300 aa  525  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3265  peptide chain release factor 2  71.14 
 
 		 386 aa  522  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  hitchhiker  0.000000190914 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1153  peptide chain release factor 2  99.6 
 
 		 248 aa  522  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449488  normal  0.0907567 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2722  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  100 
 
 		 248 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2206  peptide chain release factor 2, programmed  100 
 
 		 248 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3112  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 248 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826864  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1479  peptide chain release factor 2, programmed  100 
 
 		 248 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2027  peptide chain release factor 2  97.18 
 
 		 248 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1069  peptide chain release factor 2  71.14 
 
 		 347 aa  513  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2844  peptide chain release factor 2  71.69 
 
 		 325 aa  509  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1151  peptide chain release factor 2  70.26 
 
 		 381 aa  507  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  63.81 
 
 		 365 aa  499  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  63.54 
 
 		 365 aa  498  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  64.64 
 
 		 364 aa  500  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  63.26 
 
 		 365 aa  494  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  64.36 
 
 		 365 aa  497  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  63.26 
 
 		 365 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  62.98 
 
 		 365 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  62.71 
 
 		 365 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2274  peptide chain release factor 2  72.9 
 
 		 310 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  63.26 
 
 		 365 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  63.26 
 
 		 365 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  63.99 
 
 		 365 aa  489  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  62.98 
 
 		 365 aa  490  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  62.43 
 
 		 365 aa  483  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0302  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  64.09 
 
 		 365 aa  473  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  60.77 
 
 		 364 aa  474  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  61.05 
 
 		 374 aa  471  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  62.61 
 
 		 365 aa  473  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  66.09 
 
 		 354 aa  474  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3420  hypothetical protein  62.98 
 
 		 365 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3050  peptide chain release factor 2  65.22 
 
 		 352 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3615  peptide chain release factor 2  64.93 
 
 		 352 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0939  hypothetical protein  62.15 
 
 		 365 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1847  peptide chain release factor 2  73 
 
 		 300 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3492  peptide chain release factor 2  64.64 
 
 		 352 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0872  peptide chain release factor 2  64.64 
 
 		 352 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1216  peptide chain release factor 2  64.64 
 
 		 347 aa  464  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000777998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0826  peptide chain release factor 2  64.93 
 
 		 352 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0335049 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3197  peptide chain release factor 2  64.93 
 
 		 352 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.710234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1766  peptide chain release factor 2  70.67 
 
 		 300 aa  461  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.015531 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  62.1 
 
 		 349 aa  458  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  62.1 
 
 		 382 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2878  peptide chain release factor 2  62.94 
 
 		 364 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  61.81 
 
 		 349 aa  457  1e-127  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0725  peptide chain release factor 2  62.95 
 
 		 332 aa  455  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159955  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3297  peptide chain release factor 2  64.35 
 
 		 352 aa  457  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3371  peptide chain release factor 2  60.69 
 
 		 378 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0840  peptide chain release factor 2  63.85 
 
 		 352 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0793  peptide chain release factor 2  61.7 
 
 		 331 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1360  peptide chain release factor 2  65.89 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  62.46 
 
 		 325 aa  442  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  61.75 
 
 		 332 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0923  peptide chain release factor 2  64.84 
 
 		 310 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3128  peptide chain release factor 2  62.03 
 
 		 352 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0150596  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1742  hypothetical protein  64.16 
 
 		 335 aa  433  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1742  hypothetical protein  64.46 
 
 		 335 aa  432  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1310  peptide chain release factor 2  60.18 
 
 		 329 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.496606  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0456  peptide chain release factor 2  60.49 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.454858  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3429  peptide chain release factor 2  60.86 
 
 		 329 aa  427  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883546 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0811  peptide chain release factor 2  66.89 
 
 		 293 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00072  peptide chain release factor 2  61.25 
 
 		 329 aa  422  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0582  peptide chain release factor 2  63.44 
 
 		 320 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  56.18 
 
 		 379 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2271  peptide chain release factor 2  63.23 
 
 		 310 aa  423  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0756  peptide chain release factor 2  64.85 
 
 		 293 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.393199  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0049  peptide chain release factor 2  64.83 
 
 		 291 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0194  peptide chain release factor 2  62.96 
 
 		 299 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.109294  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4122  peptide chain release factor 2  61.06 
 
 		 304 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4227  peptide chain release factor 2  61.39 
 
 		 304 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358427  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  53.72 
 
 		 375 aa  400  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02770  Protein chain release factor B, RF-2  68.44 
 
 		 282 aa  401  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0501014  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0397  peptide chain release factor 2  63.57 
 
 		 302 aa  397  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1100  peptide chain release factor 2  62.38 
 
 		 304 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  54.08 
 
 		 371 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>