More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1356 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 369 aa  749    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  62.33 
 
 		 375 aa  464  9.999999999999999e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  55.46 
 
 		 367 aa  419  1e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  56.56 
 
 		 366 aa  415  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  56.68 
 
 		 369 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  55.52 
 
 		 367 aa  411  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  53.8 
 
 		 367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  53.8 
 
 		 367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  56.71 
 
 		 364 aa  403  1e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  53.59 
 
 		 366 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  59.45 
 
 		 330 aa  392  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  54.42 
 
 		 367 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  53.07 
 
 		 380 aa  388  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  53.07 
 
 		 380 aa  388  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  53.35 
 
 		 380 aa  388  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  53.07 
 
 		 380 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  51.93 
 
 		 367 aa  386  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  55.69 
 
 		 332 aa  383  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  54.17 
 
 		 383 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  52.34 
 
 		 364 aa  381  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  56.35 
 
 		 327 aa  383  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  56.35 
 
 		 326 aa  378  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  56.66 
 
 		 326 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  56.66 
 
 		 326 aa  381  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  52.78 
 
 		 362 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  57.49 
 
 		 330 aa  375  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  51.29 
 
 		 373 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  53.52 
 
 		 330 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  50.82 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  56.04 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  50.14 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  53.87 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  52.62 
 
 		 372 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  50 
 
 		 371 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  51.79 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  50.14 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  57.14 
 
 		 331 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  50.55 
 
 		 366 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  48.91 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  53.47 
 
 		 364 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  48.22 
 
 		 372 aa  365  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  51.58 
 
 		 375 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  48.9 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  47.03 
 
 		 374 aa  363  2e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  47.12 
 
 		 367 aa  363  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  52.76 
 
 		 332 aa  363  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  48.32 
 
 		 376 aa  363  3e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  49.73 
 
 		 376 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  52.07 
 
 		 375 aa  363  3e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  52.15 
 
 		 334 aa  363  3e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  53.54 
 
 		 331 aa  363  4e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  49.58 
 
 		 371 aa  362  4e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  48.63 
 
 		 375 aa  361  9e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  49.28 
 
 		 378 aa  360  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  52.45 
 
 		 341 aa  360  3e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  49.28 
 
 		 369 aa  359  4e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  51.62 
 
 		 367 aa  358  7e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  49.26 
 
 		 365 aa  357  9.999999999999999e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  49.72 
 
 		 368 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  52.37 
 
 		 349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  48.7 
 
 		 364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  52.94 
 
 		 325 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  48.88 
 
 		 376 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  52.66 
 
 		 349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  52.08 
 
 		 337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  54.01 
 
 		 332 aa  356  2.9999999999999997e-97  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2575  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 		 367 aa  356  3.9999999999999996e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  47.38 
 
 		 375 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  52.76 
 
 		 326 aa  355  5.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 344 aa  353  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  47.18 
 
 		 375 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  48.35 
 
 		 376 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  47.16 
 
 		 378 aa  353  4e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0961  peptide chain release factor 2  51.68 
 
 		 342 aa  352  4e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  hitchhiker  0.00626958 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 329 aa  352  5e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2271  peptide chain release factor 2  57.24 
 
 		 310 aa  352  5e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 367 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  45.45 
 
 		 372 aa  351  8.999999999999999e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 367 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  46.01 
 
 		 375 aa  351  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  49.85 
 
 		 367 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1825  peptide chain release factor 2  54.05 
 
 		 322 aa  351  1e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  47.43 
 
 		 377 aa  351  1e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  58.74 
 
 		 312 aa  351  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  51.21 
 
 		 340 aa  350  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  47.49 
 
 		 367 aa  350  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  48.35 
 
 		 365 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  46.88 
 
 		 372 aa  350  3e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1216  peptide chain release factor 2  53.99 
 
 		 347 aa  350  3e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000777998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  48.35 
 
 		 365 aa  350  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  48.35 
 
 		 365 aa  350  3e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  48.35 
 
 		 365 aa  350  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  49.7 
 
 		 362 aa  349  4e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  47.99 
 
 		 368 aa  349  4e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  49.56 
 
 		 459 aa  349  5e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  46.41 
 
 		 364 aa  349  5e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  54.46 
 
 		 323 aa  349  5e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  48.08 
 
 		 365 aa  348  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  50.29 
 
 		 349 aa  348  1e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  47.8 
 
 		 365 aa  348  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>