More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0437 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 364 aa  749    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  74.1 
 
 		 369 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0584  peptide chain release factor 2  74.38 
 
 		 366 aa  561  1.0000000000000001e-159  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  71.98 
 
 		 365 aa  550  1e-155  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0251  peptide chain release factor 2  72.18 
 
 		 372 aa  543  1e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00360033  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0259  peptide chain release factor 2  72.45 
 
 		 366 aa  531  1e-150  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1628  peptide chain release factor 2  71.35 
 
 		 365 aa  530  1e-149  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1790  peptide chain release factor 2  71.35 
 
 		 365 aa  530  1e-149  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.801319  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1448  peptide chain release factor 2  71.63 
 
 		 365 aa  530  1e-149  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0500  peptide chain release factor 2  65.56 
 
 		 364 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  55.82 
 
 		 379 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  55.18 
 
 		 367 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  55.18 
 
 		 367 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  54.22 
 
 		 459 aa  378  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  53.47 
 
 		 375 aa  379  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  55.18 
 
 		 367 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  53.92 
 
 		 391 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  53.92 
 
 		 391 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  53.94 
 
 		 406 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  53.92 
 
 		 391 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  53.92 
 
 		 391 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  52.57 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  53.94 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  53.94 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  53.94 
 
 		 349 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  51.96 
 
 		 375 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  55.18 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  48.48 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  50 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  52.21 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  49.3 
 
 		 375 aa  365  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  48.76 
 
 		 367 aa  366  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  53.26 
 
 		 364 aa  364  1e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  48.32 
 
 		 371 aa  362  4e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  55.52 
 
 		 326 aa  361  9e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  49.15 
 
 		 375 aa  361  9e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  50.69 
 
 		 367 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  51.66 
 
 		 376 aa  360  2e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  51.96 
 
 		 354 aa  359  4e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  51.04 
 
 		 376 aa  358  6e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  53.09 
 
 		 330 aa  358  8e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  52.76 
 
 		 359 aa  358  8e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  49.86 
 
 		 369 aa  358  9e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  50.28 
 
 		 367 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  50.28 
 
 		 367 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  50.9 
 
 		 349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  49.44 
 
 		 365 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  49.44 
 
 		 365 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  49.44 
 
 		 365 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  49.44 
 
 		 365 aa  355  5e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  50.9 
 
 		 349 aa  355  8.999999999999999e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  49.15 
 
 		 365 aa  354  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  48.08 
 
 		 366 aa  354  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  51.71 
 
 		 344 aa  354  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  54.05 
 
 		 354 aa  354  1e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  49.44 
 
 		 364 aa  353  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1216  peptide chain release factor 2  50.89 
 
 		 347 aa  352  5.9999999999999994e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000777998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  53.53 
 
 		 317 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  48.61 
 
 		 383 aa  351  1e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  50.47 
 
 		 325 aa  350  2e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  51.06 
 
 		 376 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  51.36 
 
 		 380 aa  349  3e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 364 aa  350  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  51.36 
 
 		 380 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  50.75 
 
 		 365 aa  349  4e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  48.73 
 
 		 366 aa  349  4e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  51.36 
 
 		 380 aa  348  6e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 372 aa  348  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  53.55 
 
 		 322 aa  348  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  51.06 
 
 		 380 aa  348  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  48.7 
 
 		 369 aa  347  2e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  51.16 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  52.68 
 
 		 326 aa  346  3e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  52.68 
 
 		 326 aa  346  3e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  49.25 
 
 		 357 aa  346  3e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  51.66 
 
 		 364 aa  346  3e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  52.37 
 
 		 327 aa  346  3e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  52.79 
 
 		 321 aa  346  4e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  51.52 
 
 		 376 aa  346  4e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  50.15 
 
 		 365 aa  346  4e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  47.63 
 
 		 365 aa  346  5e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2844  peptide chain release factor 2  51.4 
 
 		 325 aa  345  7e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  48.74 
 
 		 376 aa  345  8e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  49.86 
 
 		 371 aa  345  8.999999999999999e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 365 aa  345  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  52.37 
 
 		 326 aa  344  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  47.92 
 
 		 377 aa  344  1e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  50.75 
 
 		 340 aa  344  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0961  peptide chain release factor 2  51.09 
 
 		 342 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  hitchhiker  0.00626958 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  52.05 
 
 		 326 aa  343  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  51.22 
 
 		 369 aa  342  4e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  49.53 
 
 		 334 aa  342  4e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  48.15 
 
 		 374 aa  342  5e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  58.33 
 
 		 323 aa  341  1e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  52.79 
 
 		 323 aa  341  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  51.71 
 
 		 331 aa  341  1e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  47.9 
 
 		 378 aa  341  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2274  peptide chain release factor 2  54.72 
 
 		 310 aa  340  2e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 365 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  46.01 
 
 		 372 aa  340  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>