More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0584 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0584  peptide chain release factor 2  100 
 
 
366 aa  754    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0251  peptide chain release factor 2  89.01 
 
 
372 aa  653    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00360033  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  84.43 
 
 
369 aa  655    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0259  peptide chain release factor 2  81.92 
 
 
366 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1790  peptide chain release factor 2  80.82 
 
 
365 aa  598  1e-170  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.801319  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1448  peptide chain release factor 2  80.55 
 
 
365 aa  597  1e-170  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1628  peptide chain release factor 2  80.27 
 
 
365 aa  596  1e-169  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  74.38 
 
 
364 aa  578  1e-164  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0500  peptide chain release factor 2  70.56 
 
 
364 aa  544  1e-154  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  64.92 
 
 
365 aa  496  1e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  54.55 
 
 
375 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  53.61 
 
 
379 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  51.91 
 
 
417 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  54.03 
 
 
367 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  52.79 
 
 
357 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  53.43 
 
 
459 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  54.03 
 
 
367 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  54.03 
 
 
367 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  52.77 
 
 
391 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  53.06 
 
 
391 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  52.77 
 
 
391 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  52.77 
 
 
406 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  52.77 
 
 
391 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  53.01 
 
 
349 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  52.79 
 
 
359 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  49.86 
 
 
371 aa  365  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  51.94 
 
 
375 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  52.84 
 
 
357 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  53.33 
 
 
375 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  48.62 
 
 
367 aa  367  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  48.9 
 
 
367 aa  366  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  51.46 
 
 
349 aa  363  3e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  53.64 
 
 
375 aa  362  4e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  50.43 
 
 
364 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  49.73 
 
 
367 aa  362  6e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  50.28 
 
 
367 aa  361  9e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  50.29 
 
 
349 aa  361  1e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  50 
 
 
367 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  53.03 
 
 
376 aa  360  3e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  53.25 
 
 
330 aa  359  4e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  50.57 
 
 
372 aa  359  5e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  50.42 
 
 
365 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  50.42 
 
 
365 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  50.42 
 
 
365 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  49.28 
 
 
354 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  50.42 
 
 
365 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  52.99 
 
 
365 aa  355  7.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  52.1 
 
 
376 aa  355  7.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  50.14 
 
 
365 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  48.04 
 
 
377 aa  355  8.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  54.18 
 
 
326 aa  354  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  52.34 
 
 
344 aa  353  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  48.6 
 
 
372 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  52.33 
 
 
354 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  51.21 
 
 
364 aa  352  5e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  53.43 
 
 
367 aa  352  7e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  49.15 
 
 
364 aa  352  8e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  47.34 
 
 
375 aa  351  1e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  52.99 
 
 
365 aa  351  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  51.52 
 
 
369 aa  351  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  48.18 
 
 
366 aa  350  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  53.55 
 
 
322 aa  350  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  48.86 
 
 
365 aa  350  2e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  52.12 
 
 
376 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  49.86 
 
 
371 aa  349  4e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5845  peptide chain release factor 2  53.77 
 
 
321 aa  349  5e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  54.02 
 
 
317 aa  348  6e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  47.24 
 
 
366 aa  348  7e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  51.8 
 
 
365 aa  348  8e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  52.34 
 
 
331 aa  348  9e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  51.56 
 
 
364 aa  347  2e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  49.32 
 
 
383 aa  346  3e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  48.75 
 
 
367 aa  346  4e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  48.85 
 
 
362 aa  345  5e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  48.85 
 
 
364 aa  345  8.999999999999999e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  51.33 
 
 
367 aa  345  1e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1030  peptide chain release factor 2 protein  55.22 
 
 
300 aa  343  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  48.34 
 
 
380 aa  343  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  51.2 
 
 
365 aa  344  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  47.78 
 
 
380 aa  343  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  48.07 
 
 
380 aa  342  4e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2274  peptide chain release factor 2  53.09 
 
 
310 aa  342  5e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  46.52 
 
 
365 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  50.75 
 
 
375 aa  342  7e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  48.34 
 
 
380 aa  342  7e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3166  peptide chain release factor 2  53.11 
 
 
321 aa  342  8e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  51.2 
 
 
365 aa  342  8e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  51.79 
 
 
340 aa  341  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  49.04 
 
 
369 aa  341  1e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  48.62 
 
 
376 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  49.31 
 
 
365 aa  340  2.9999999999999998e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  52.05 
 
 
326 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  52.05 
 
 
326 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2844  peptide chain release factor 2  50.78 
 
 
325 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2982  peptide chain release factor 2  52.79 
 
 
321 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.186364  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2977  peptide chain release factor 2  50.88 
 
 
375 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1623  peptide chain release factor 2  50.88 
 
 
375 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622299  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  47.14 
 
 
368 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3208  peptide chain release factor 2  52.79 
 
 
321 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  49.4 
 
 
343 aa  339  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>