More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3845 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 375 aa  761    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  76.27 
 
 		 375 aa  593  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  78.13 
 
 		 375 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  67.55 
 
 		 376 aa  517  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  67.82 
 
 		 376 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  66.13 
 
 		 375 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  67.02 
 
 		 376 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  61.33 
 
 		 375 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1305  peptide chain release factor 2  66.94 
 
 		 376 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  61.6 
 
 		 376 aa  479  1e-134  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  64.83 
 
 		 344 aa  471  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3166  peptide chain release factor 2  68.22 
 
 		 321 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0961  peptide chain release factor 2  67.47 
 
 		 342 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  hitchhiker  0.00626958 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2982  peptide chain release factor 2  67.6 
 
 		 321 aa  448  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.186364  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3208  peptide chain release factor 2  67.6 
 
 		 321 aa  448  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5845  peptide chain release factor 2  67.91 
 
 		 321 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  69.25 
 
 		 322 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  60.33 
 
 		 375 aa  442  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  66.15 
 
 		 322 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2575  peptide chain release factor 2  63.56 
 
 		 367 aa  441  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5077  peptide chain release factor 2  68.22 
 
 		 321 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30933  normal  0.0341665 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  58.78 
 
 		 376 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  62.93 
 
 		 321 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  58.7 
 
 		 402 aa  434  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2977  peptide chain release factor 2  59.24 
 
 		 375 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1856  peptide chain release factor 2  58.97 
 
 		 375 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1623  peptide chain release factor 2  59.24 
 
 		 375 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622299  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  64.63 
 
 		 323 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0868  peptide chain release factor 2  55.98 
 
 		 374 aa  410  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  53.87 
 
 		 379 aa  410  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  60.99 
 
 		 323 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2040  peptide chain release factor 2  61.22 
 
 		 322 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2533  peptide chain release factor 2  57.34 
 
 		 375 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1825  peptide chain release factor 2  61.8 
 
 		 322 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1715  peptide chain release factor 2  61.49 
 
 		 322 aa  395  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.833664  normal  0.278616 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  53.74 
 
 		 372 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3006  peptide chain release factor 2  61.49 
 
 		 322 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.743846  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4671  peptide chain release factor 2  62.11 
 
 		 322 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2445  peptide chain release factor 2  60.56 
 
 		 322 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.689282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  55.14 
 
 		 367 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1299  peptide chain release factor 2  62.15 
 
 		 321 aa  384  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0921443  normal  0.567483 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  54.23 
 
 		 364 aa  378  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2851  peptide chain release factor 2  59.01 
 
 		 322 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  51.25 
 
 		 371 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0705  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  49.15 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  51.01 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  51.9 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  52.62 
 
 		 365 aa  368  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  52.02 
 
 		 367 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  52.62 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  52.57 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  52.02 
 
 		 367 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  51.9 
 
 		 365 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  51.9 
 
 		 365 aa  368  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  51.13 
 
 		 365 aa  366  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  50.83 
 
 		 365 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  51.83 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  50.28 
 
 		 391 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  51.73 
 
 		 367 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  51.9 
 
 		 365 aa  368  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  51.7 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  50.42 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  51.6 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0500  peptide chain release factor 2  52.41 
 
 		 364 aa  368  1e-100  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  51.16 
 
 		 459 aa  364  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  50.95 
 
 		 391 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  50.95 
 
 		 391 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  50.95 
 
 		 391 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  52.49 
 
 		 382 aa  363  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  53.08 
 
 		 349 aa  363  2e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  52.57 
 
 		 367 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  52.29 
 
 		 367 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  50.28 
 
 		 365 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  52.94 
 
 		 349 aa  363  4e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  50.41 
 
 		 406 aa  362  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  50.28 
 
 		 365 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  53.19 
 
 		 332 aa  362  8e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  50.14 
 
 		 367 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0350  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 		 335 aa  361  1e-98  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0604  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  50.55 
 
 		 365 aa  361  1e-98  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  52.33 
 
 		 357 aa  361  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0725  peptide chain release factor 2  51.38 
 
 		 332 aa  360  2e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159955  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  48.88 
 
 		 367 aa  360  2e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  55.42 
 
 		 317 aa  360  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 359 aa  359  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  51.03 
 
 		 357 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  52.11 
 
 		 367 aa  359  5e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  51.45 
 
 		 349 aa  358  8e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  48.57 
 
 		 365 aa  358  9e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  50.83 
 
 		 366 aa  358  9e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  49.43 
 
 		 365 aa  357  9.999999999999999e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3371  peptide chain release factor 2  51.61 
 
 		 378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  50.87 
 
 		 349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  56.11 
 
 		 326 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 366 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 417 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  51.87 
 
 		 349 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  51.45 
 
 		 354 aa  354  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  51.76 
 
 		 361 aa  353  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3429  peptide chain release factor 2  52.48 
 
 		 329 aa  352  4e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>