More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1686 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 323 aa  660    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  66.13 
 
 		 322 aa  441  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3208  peptide chain release factor 2  65.16 
 
 		 321 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5845  peptide chain release factor 2  65.48 
 
 		 321 aa  435  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2575  peptide chain release factor 2  65.18 
 
 		 367 aa  437  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2040  peptide chain release factor 2  65.16 
 
 		 322 aa  437  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2982  peptide chain release factor 2  65.16 
 
 		 321 aa  436  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.186364  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  63.26 
 
 		 323 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  64.63 
 
 		 375 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3166  peptide chain release factor 2  64.84 
 
 		 321 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  66.56 
 
 		 322 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  62.38 
 
 		 376 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5077  peptide chain release factor 2  65.48 
 
 		 321 aa  424  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30933  normal  0.0341665 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4671  peptide chain release factor 2  66.67 
 
 		 322 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  65.27 
 
 		 375 aa  425  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  62.42 
 
 		 344 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  62.38 
 
 		 376 aa  422  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1715  peptide chain release factor 2  63.9 
 
 		 322 aa  418  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.833664  normal  0.278616 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  61.41 
 
 		 375 aa  415  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1825  peptide chain release factor 2  63.11 
 
 		 322 aa  414  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  64.98 
 
 		 375 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3006  peptide chain release factor 2  65.5 
 
 		 322 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.743846  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  63.67 
 
 		 376 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  64.63 
 
 		 375 aa  409  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2445  peptide chain release factor 2  64.86 
 
 		 322 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.689282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  64.19 
 
 		 376 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1305  peptide chain release factor 2  63.34 
 
 		 376 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0961  peptide chain release factor 2  62.7 
 
 		 342 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  hitchhiker  0.00626958 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  59.68 
 
 		 321 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2851  peptide chain release factor 2  63.9 
 
 		 322 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  61.41 
 
 		 376 aa  402  1e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  59.56 
 
 		 375 aa  403  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  60.06 
 
 		 402 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2977  peptide chain release factor 2  59.01 
 
 		 375 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1856  peptide chain release factor 2  59.13 
 
 		 375 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1623  peptide chain release factor 2  59.01 
 
 		 375 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622299  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  57.61 
 
 		 367 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0868  peptide chain release factor 2  55.73 
 
 		 374 aa  375  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1299  peptide chain release factor 2  60.12 
 
 		 321 aa  377  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0921443  normal  0.567483 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  58.2 
 
 		 379 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  57.38 
 
 		 349 aa  372  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  57.38 
 
 		 349 aa  371  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  57.28 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  57.28 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  57.28 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  57.38 
 
 		 391 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  59.22 
 
 		 326 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  57.7 
 
 		 391 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  56.35 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  57.38 
 
 		 391 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  57.05 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  57.38 
 
 		 391 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  56.35 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2274  peptide chain release factor 2  57.23 
 
 		 310 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  57.05 
 
 		 459 aa  364  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  58.63 
 
 		 364 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  58.63 
 
 		 364 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  58.69 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  55.7 
 
 		 317 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  55.7 
 
 		 372 aa  363  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  56.31 
 
 		 354 aa  363  2e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  56.07 
 
 		 365 aa  360  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  56.07 
 
 		 365 aa  360  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0705  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  50.96 
 
 		 366 aa  360  1e-98  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  53.82 
 
 		 373 aa  360  1e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  56.07 
 
 		 365 aa  360  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  56.07 
 
 		 365 aa  360  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0725  peptide chain release factor 2  54.37 
 
 		 332 aa  360  2e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159955  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2533  peptide chain release factor 2  57.68 
 
 		 375 aa  360  2e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  55.74 
 
 		 365 aa  360  2e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  55.41 
 
 		 382 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  56.96 
 
 		 349 aa  360  3e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  55.74 
 
 		 365 aa  359  4e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  55.34 
 
 		 417 aa  358  5e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  55.08 
 
 		 365 aa  358  6e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3371  peptide chain release factor 2  54.75 
 
 		 378 aa  358  7e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  54.43 
 
 		 359 aa  358  9e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  58.01 
 
 		 367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  54.75 
 
 		 332 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2271  peptide chain release factor 2  55.05 
 
 		 310 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  57.69 
 
 		 367 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0350  peptide chain release factor 2  50.32 
 
 		 335 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  54.43 
 
 		 325 aa  356  3.9999999999999996e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0604  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  54.84 
 
 		 365 aa  355  3.9999999999999996e-97  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1030  peptide chain release factor 2 protein  59.58 
 
 		 300 aa  355  5e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  60.36 
 
 		 357 aa  355  7.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2844  peptide chain release factor 2  54.05 
 
 		 325 aa  353  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3429  peptide chain release factor 2  54.07 
 
 		 329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883546 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  53.77 
 
 		 365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0923  peptide chain release factor 2  54.4 
 
 		 310 aa  352  5e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1153  peptide chain release factor 2  65.46 
 
 		 248 aa  352  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449488  normal  0.0907567 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  53.77 
 
 		 365 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  53.07 
 
 		 357 aa  351  7e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1310  peptide chain release factor 2  53.77 
 
 		 329 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.496606  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2722  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  65.06 
 
 		 248 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3112  peptide chain release factor 2  65.06 
 
 		 248 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826864  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1479  peptide chain release factor 2, programmed  65.06 
 
 		 248 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  60.36 
 
 		 357 aa  351  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  56.63 
 
 		 354 aa  350  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2206  peptide chain release factor 2, programmed  65.06 
 
 		 248 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>