More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0467 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  100 
 
 
377 aa  755    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  57.92 
 
 
366 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  59.17 
 
 
367 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  60.11 
 
 
383 aa  442  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  57.78 
 
 
367 aa  428  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  56.23 
 
 
372 aa  430  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  56.63 
 
 
368 aa  431  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  58.64 
 
 
332 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  56.11 
 
 
380 aa  422  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  56.11 
 
 
380 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  55.83 
 
 
380 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  54.42 
 
 
373 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  55.83 
 
 
380 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  56.51 
 
 
357 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  60.61 
 
 
330 aa  413  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  53.57 
 
 
364 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  53.74 
 
 
362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  58.1 
 
 
330 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  51.79 
 
 
371 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  57.59 
 
 
327 aa  395  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  57.28 
 
 
326 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  57.28 
 
 
326 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  62.39 
 
 
330 aa  393  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  49.31 
 
 
369 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  56.97 
 
 
326 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  56.66 
 
 
326 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  52.73 
 
 
367 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  54.38 
 
 
334 aa  383  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  51.27 
 
 
366 aa  380  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  49.86 
 
 
367 aa  381  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  50.28 
 
 
367 aa  381  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  56 
 
 
331 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  51.85 
 
 
331 aa  373  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  54.35 
 
 
364 aa  374  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  50.7 
 
 
371 aa  369  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  51.69 
 
 
371 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  52.56 
 
 
366 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  48.48 
 
 
367 aa  369  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  51.42 
 
 
372 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  51.14 
 
 
374 aa  365  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  53.11 
 
 
369 aa  368  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  46.11 
 
 
365 aa  363  2e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  52.08 
 
 
378 aa  363  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  51.63 
 
 
375 aa  360  2e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2216  peptide chain release factor 2 (bRF-2)  55.69 
 
 
344 aa  360  2e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00549966  hitchhiker  0.00000471368 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1938  hypothetical protein  50.14 
 
 
370 aa  359  6e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374727  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  52.94 
 
 
332 aa  355  5.999999999999999e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  49.86 
 
 
379 aa  355  5.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  47.86 
 
 
372 aa  354  2e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1409  peptide chain release factor 2  53.37 
 
 
330 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0056831  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  49.33 
 
 
368 aa  351  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  48.59 
 
 
362 aa  350  2e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  47.9 
 
 
375 aa  349  5e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1805  peptide chain release factor 2  50.14 
 
 
358 aa  348  6e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.361195  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  46.67 
 
 
365 aa  347  2e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  48.95 
 
 
337 aa  346  4e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  46.98 
 
 
371 aa  345  5e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0257  peptide chain release factor 2  51.08 
 
 
333 aa  345  7e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000258105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 
364 aa  345  8e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  47.46 
 
 
365 aa  345  1e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  47.92 
 
 
364 aa  344  1e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  46.94 
 
 
365 aa  344  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  46.67 
 
 
365 aa  344  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  47.88 
 
 
372 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  46.93 
 
 
369 aa  344  2e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  46.94 
 
 
365 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  45.48 
 
 
367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  46.94 
 
 
365 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  46.94 
 
 
365 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  48.57 
 
 
365 aa  343  4e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0584  peptide chain release factor 2  48.04 
 
 
366 aa  342  5e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  50.42 
 
 
366 aa  342  5.999999999999999e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  46.67 
 
 
365 aa  342  7e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  45.83 
 
 
365 aa  342  9e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  46.39 
 
 
365 aa  341  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  52.79 
 
 
317 aa  341  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  51.39 
 
 
372 aa  341  1e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  52.29 
 
 
369 aa  341  2e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  50.76 
 
 
340 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  48.09 
 
 
361 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  48.9 
 
 
378 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  46.67 
 
 
365 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  47.78 
 
 
376 aa  339  5e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  48.75 
 
 
372 aa  339  5e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  48.89 
 
 
376 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  54.07 
 
 
312 aa  338  7e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  47.43 
 
 
369 aa  338  9e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  49.26 
 
 
362 aa  338  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  45.58 
 
 
372 aa  337  9.999999999999999e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  46.38 
 
 
378 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  50.85 
 
 
372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  46.83 
 
 
371 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  49.05 
 
 
371 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  49.23 
 
 
332 aa  337  2.9999999999999997e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  49.05 
 
 
371 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  48.24 
 
 
368 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0404  peptide chain release factor 2  56.14 
 
 
304 aa  335  7e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.660682  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  57.3 
 
 
322 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  47.96 
 
 
367 aa  333  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  48.78 
 
 
371 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>