More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0404 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0404  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 304 aa  619  1e-176  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.660682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2784  peptide chain release factor 2  79.44 
 
 		 292 aa  485  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  76.43 
 
 		 361 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  76.09 
 
 		 360 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  72.01 
 
 		 356 aa  445  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  72.6 
 
 		 356 aa  444  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  71.92 
 
 		 356 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2120  peptide chain release factor 2  75.62 
 
 		 288 aa  443  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1548  peptide chain release factor 2  70.31 
 
 		 313 aa  438  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475132  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  75.35 
 
 		 365 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  75.35 
 
 		 375 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02561  peptide chain release factor 2  70.31 
 
 		 313 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.686331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01981  peptide chain release factor 2  68.26 
 
 		 354 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0513147  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02001  peptide chain release factor 2  67.92 
 
 		 354 aa  427  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27381  peptide chain release factor 2  71.92 
 
 		 319 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0182  peptide chain release factor 2  67.24 
 
 		 354 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02091  peptide chain release factor 2  68.6 
 
 		 354 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  56.14 
 
 		 377 aa  335  5e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  55.44 
 
 		 367 aa  330  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15725  predicted protein  57.2 
 
 		 278 aa  330  2e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0450714 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  55.59 
 
 		 383 aa  329  3e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  55.59 
 
 		 372 aa  329  4e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  55.99 
 
 		 366 aa  328  6e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  55.44 
 
 		 367 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  55.02 
 
 		 330 aa  324  9e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  56.83 
 
 		 367 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  52.82 
 
 		 362 aa  320  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  52.82 
 
 		 364 aa  320  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  56.46 
 
 		 367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  52.72 
 
 		 327 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  53.4 
 
 		 380 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  53.06 
 
 		 380 aa  318  6e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  53.06 
 
 		 380 aa  318  7e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  53.06 
 
 		 326 aa  317  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  53.06 
 
 		 326 aa  317  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  52.63 
 
 		 332 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  52.72 
 
 		 380 aa  317  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  54.04 
 
 		 329 aa  318  1e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  53.06 
 
 		 326 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  52.72 
 
 		 326 aa  316  3e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  55.24 
 
 		 332 aa  316  4e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  54.39 
 
 		 367 aa  315  5e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  53.68 
 
 		 330 aa  315  7e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  52.26 
 
 		 369 aa  314  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  52.26 
 
 		 331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21873  predicted protein  53.97 
 
 		 406 aa  313  1.9999999999999998e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  54.58 
 
 		 366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  53.08 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  53.68 
 
 		 378 aa  310  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  50.68 
 
 		 362 aa  309  4e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  54.68 
 
 		 331 aa  308  5e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  53.87 
 
 		 369 aa  308  5e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1409  peptide chain release factor 2  58.5 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0056831  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 357 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 365 aa  305  5.0000000000000004e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  58.91 
 
 		 371 aa  305  7e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  51.58 
 
 		 372 aa  305  7e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  50.35 
 
 		 373 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  51.74 
 
 		 371 aa  302  5.000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  50.35 
 
 		 367 aa  301  7.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  53.21 
 
 		 369 aa  300  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  51.58 
 
 		 375 aa  300  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  49.66 
 
 		 356 aa  300  2e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  53.31 
 
 		 364 aa  299  4e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  48.98 
 
 		 357 aa  299  4e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  49.13 
 
 		 317 aa  299  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  49.49 
 
 		 372 aa  298  6e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  51.33 
 
 		 371 aa  297  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  50.34 
 
 		 372 aa  298  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  50.18 
 
 		 378 aa  296  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  49.83 
 
 		 371 aa  297  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4162  peptide chain release factor 2  50.34 
 
 		 317 aa  295  7e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.155408 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  50.71 
 
 		 369 aa  295  9e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  53.05 
 
 		 375 aa  294  1e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  51.28 
 
 		 366 aa  294  1e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  49.65 
 
 		 322 aa  294  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  48.42 
 
 		 378 aa  293  3e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  48.6 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  54.33 
 
 		 337 aa  293  3e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  50.52 
 
 		 373 aa  292  5e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  48.78 
 
 		 323 aa  292  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  50.7 
 
 		 323 aa  292  6e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  49.48 
 
 		 326 aa  291  8e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  51.93 
 
 		 364 aa  291  8e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0942  peptide chain release factor 2  48.62 
 
 		 374 aa  290  1e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0440008  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  49.48 
 
 		 373 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20340  peptide chain release factor 2  47.72 
 
 		 371 aa  291  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  51.4 
 
 		 372 aa  290  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  47.97 
 
 		 367 aa  290  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  48.64 
 
 		 312 aa  289  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  47.7 
 
 		 321 aa  289  4e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  49.47 
 
 		 369 aa  289  4e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  47.4 
 
 		 344 aa  288  6e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3345  peptide chain release factor 2  49.32 
 
 		 317 aa  287  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.219994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  50.53 
 
 		 366 aa  287  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4671  peptide chain release factor 2  49.83 
 
 		 322 aa  288  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1715  peptide chain release factor 2  48.6 
 
 		 322 aa  287  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.833664  normal  0.278616 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  50.39 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  49.31 
 
 		 368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  50.19 
 
 		 341 aa  286  4e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>