More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_02001 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0182  peptide chain release factor 2  98.31 
 
 		 354 aa  715    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01981  peptide chain release factor 2  98.02 
 
 		 354 aa  714    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0513147  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02001  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 354 aa  725    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02091  peptide chain release factor 2  84.75 
 
 		 354 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  71.47 
 
 		 356 aa  542  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  71.31 
 
 		 356 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  70.77 
 
 		 356 aa  534  1e-151  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02561  peptide chain release factor 2  77.52 
 
 		 313 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.686331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1548  peptide chain release factor 2  75.48 
 
 		 313 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475132  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  64.62 
 
 		 361 aa  474  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27381  peptide chain release factor 2  71.61 
 
 		 319 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  62.87 
 
 		 375 aa  438  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  62.39 
 
 		 360 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  62.87 
 
 		 365 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0404  peptide chain release factor 2  67.92 
 
 		 304 aa  427  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.660682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2784  peptide chain release factor 2  67.86 
 
 		 292 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2120  peptide chain release factor 2  68.36 
 
 		 288 aa  392  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  44.97 
 
 		 383 aa  325  6e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  46.09 
 
 		 366 aa  324  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  45.48 
 
 		 357 aa  325  1e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  46.06 
 
 		 366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  44.19 
 
 		 373 aa  319  3.9999999999999996e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21873  predicted protein  48.29 
 
 		 406 aa  317  3e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  47.38 
 
 		 329 aa  316  4e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  46.63 
 
 		 372 aa  315  6e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  45.27 
 
 		 367 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  47.55 
 
 		 332 aa  309  5.9999999999999995e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  44.31 
 
 		 370 aa  309  5.9999999999999995e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  45.63 
 
 		 362 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  46.65 
 
 		 377 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  46.53 
 
 		 372 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15725  predicted protein  51.62 
 
 		 278 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0450714 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  45.7 
 
 		 362 aa  305  8.000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  44.67 
 
 		 368 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0942  peptide chain release factor 2  45.88 
 
 		 374 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0440008  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  43.57 
 
 		 366 aa  303  2.0000000000000002e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  44.71 
 
 		 373 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  46.18 
 
 		 367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  44.71 
 
 		 378 aa  303  3.0000000000000004e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  45.88 
 
 		 367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  46.11 
 
 		 357 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  45.4 
 
 		 364 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  46.9 
 
 		 378 aa  302  5.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  45 
 
 		 378 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  44.71 
 
 		 374 aa  302  5.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  45.19 
 
 		 372 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  44.71 
 
 		 373 aa  302  6.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  43.06 
 
 		 365 aa  302  6.000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  45.82 
 
 		 367 aa  301  8.000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  49.24 
 
 		 330 aa  301  9e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07580  peptide chain release factor 2  44.71 
 
 		 373 aa  301  9e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.932102  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  46.29 
 
 		 375 aa  301  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  43.73 
 
 		 371 aa  301  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  43.06 
 
 		 369 aa  300  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  45.59 
 
 		 367 aa  300  3e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  44.51 
 
 		 367 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1233  peptide chain release factor 2  45.29 
 
 		 370 aa  299  4e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  46.06 
 
 		 356 aa  299  5e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  44.31 
 
 		 367 aa  298  9e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  44.8 
 
 		 371 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  44.8 
 
 		 371 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  44.71 
 
 		 367 aa  297  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  45.13 
 
 		 364 aa  296  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  44.12 
 
 		 368 aa  296  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  44.58 
 
 		 331 aa  295  6e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  44.51 
 
 		 371 aa  295  6e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  43.88 
 
 		 369 aa  295  7e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  43.66 
 
 		 371 aa  294  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  44.61 
 
 		 366 aa  295  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  44.12 
 
 		 368 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  45.07 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  44.41 
 
 		 378 aa  294  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  42.45 
 
 		 367 aa  293  3e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1034  peptide chain release factor 2  42.94 
 
 		 370 aa  292  7e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  45 
 
 		 369 aa  291  8e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20340  peptide chain release factor 2  42.65 
 
 		 371 aa  291  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4451  peptide chain release factor 2  44.22 
 
 		 372 aa  291  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2666  peptide chain release factor 2  44.41 
 
 		 371 aa  290  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2401  peptide chain release factor 2  43.82 
 
 		 371 aa  290  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0455309 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  44.65 
 
 		 332 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  41.76 
 
 		 371 aa  289  6e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  44.83 
 
 		 369 aa  288  1e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  47.02 
 
 		 330 aa  288  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  46.99 
 
 		 371 aa  288  1e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  43.24 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  42.24 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  41.95 
 
 		 372 aa  285  5.999999999999999e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  44.51 
 
 		 362 aa  285  7e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  42.44 
 
 		 372 aa  285  7e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  50.37 
 
 		 369 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2538  peptide chain release factor 2  42.77 
 
 		 363 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  45.97 
 
 		 372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  43.36 
 
 		 361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  40.97 
 
 		 380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1899  peptide chain release factor 2  44.57 
 
 		 367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0199155  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  44.71 
 
 		 368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0238  peptide chain release factor 2  43.66 
 
 		 363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000385966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  44.1 
 
 		 332 aa  283  4.0000000000000003e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  47.81 
 
 		 317 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1409  peptide chain release factor 2  48.73 
 
 		 330 aa  282  6.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0056831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>