More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1899 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1899  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 367 aa  762    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0199155  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09203  putative peptide chain release factor  70.7 
 
 		 316 aa  479  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.165955  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0282  hypothetical protein  58.92 
 
 		 357 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2553  peptide chain release factor 2  79.52 
 
 		 254 aa  428  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333677  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3994  peptide chain release factor 2  56.94 
 
 		 357 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0498322  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5751  hypothetical protein  55.24 
 
 		 358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1048  hypothetical protein  56.1 
 
 		 332 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5492  peptide chain release factor 2  54.8 
 
 		 362 aa  395  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0496262 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2832  peptide chain release factor 2  52.96 
 
 		 358 aa  395  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.909356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  46.7 
 
 		 371 aa  352  8e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  48.31 
 
 		 372 aa  344  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2784  peptide chain release factor 2  48.84 
 
 		 363 aa  344  1e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.785261  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2031  peptide chain release factor 2  46.47 
 
 		 363 aa  339  4e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0138456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  47.61 
 
 		 371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0238  peptide chain release factor 2  47.41 
 
 		 363 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000385966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  48.08 
 
 		 364 aa  334  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2538  peptide chain release factor 2  48.82 
 
 		 363 aa  334  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  45.95 
 
 		 365 aa  328  1.0000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0209  peptide chain release factor 2  46.22 
 
 		 381 aa  326  4.0000000000000003e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  46.76 
 
 		 361 aa  325  8.000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  45.35 
 
 		 367 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  45.25 
 
 		 366 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  44.03 
 
 		 459 aa  323  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  43.75 
 
 		 367 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  43.75 
 
 		 367 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  44.51 
 
 		 374 aa  318  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0023  peptide chain release factor 2  48.88 
 
 		 312 aa  317  2e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000581574  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  44.6 
 
 		 373 aa  317  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  43.47 
 
 		 367 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  45.38 
 
 		 367 aa  316  4e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  45.66 
 
 		 417 aa  316  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  42.82 
 
 		 372 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  46.24 
 
 		 349 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  43.92 
 
 		 383 aa  313  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  46.75 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  44.44 
 
 		 359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  48.93 
 
 		 340 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  41.97 
 
 		 366 aa  313  1.9999999999999998e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  48.3 
 
 		 357 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  43.45 
 
 		 356 aa  312  4.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  43.93 
 
 		 369 aa  312  5.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  47.46 
 
 		 365 aa  311  7.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  44.83 
 
 		 371 aa  311  9e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  44.51 
 
 		 391 aa  311  9e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  47.46 
 
 		 375 aa  311  9e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  47.02 
 
 		 357 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  44.74 
 
 		 391 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  43.45 
 
 		 357 aa  311  1e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  43.64 
 
 		 379 aa  311  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  42.94 
 
 		 380 aa  310  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  45.99 
 
 		 367 aa  310  2e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  44.74 
 
 		 391 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  42.49 
 
 		 372 aa  311  2e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  44.74 
 
 		 391 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  44.44 
 
 		 406 aa  309  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  43.34 
 
 		 365 aa  309  5.9999999999999995e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  43.15 
 
 		 362 aa  308  6.999999999999999e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  42.94 
 
 		 380 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  45.94 
 
 		 326 aa  308  8e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  45.11 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  44.01 
 
 		 343 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  42.94 
 
 		 380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  46.44 
 
 		 375 aa  308  1.0000000000000001e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  46.02 
 
 		 367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  46.47 
 
 		 349 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  42.66 
 
 		 380 aa  306  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  45.59 
 
 		 367 aa  306  3e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  45.74 
 
 		 367 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2844  peptide chain release factor 2  47.02 
 
 		 325 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  42.47 
 
 		 371 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  46.8 
 
 		 349 aa  306  5.0000000000000004e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  45.35 
 
 		 361 aa  305  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  45.31 
 
 		 331 aa  305  9.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  43.14 
 
 		 365 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  43.14 
 
 		 365 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  44.28 
 
 		 357 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  43.14 
 
 		 365 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  43.14 
 
 		 365 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  43.82 
 
 		 365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  43.45 
 
 		 364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  47.4 
 
 		 317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  44.81 
 
 		 364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1562  peptide chain release factor 2  54 
 
 		 280 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271557  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  43.63 
 
 		 376 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  44.51 
 
 		 376 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2575  peptide chain release factor 2  45.45 
 
 		 367 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  43.34 
 
 		 365 aa  302  5.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1069  peptide chain release factor 2  45.27 
 
 		 347 aa  302  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  44.89 
 
 		 356 aa  302  6.000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  43.34 
 
 		 365 aa  302  6.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  43.66 
 
 		 375 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  45.57 
 
 		 329 aa  301  8.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  44.92 
 
 		 367 aa  301  9e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  42.74 
 
 		 365 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2758  peptide chain release factor 2  43.75 
 
 		 367 aa  301  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  42.86 
 
 		 365 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2248  hypothetical protein  43.75 
 
 		 367 aa  301  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  43.79 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  45.09 
 
 		 332 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  54.65 
 
 		 323 aa  300  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>