More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2784 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2784  peptide chain release factor 2  100 
 
 
292 aa  598  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  83.22 
 
 
361 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0404  peptide chain release factor 2  79.44 
 
 
304 aa  485  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.660682  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2120  peptide chain release factor 2  81.6 
 
 
288 aa  474  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  80.43 
 
 
360 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  79.79 
 
 
375 aa  447  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  79.79 
 
 
365 aa  447  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  75.63 
 
 
356 aa  444  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  75.44 
 
 
356 aa  442  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  75.8 
 
 
356 aa  441  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02561  peptide chain release factor 2  74.02 
 
 
313 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.686331  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1548  peptide chain release factor 2  73.67 
 
 
313 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475132  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27381  peptide chain release factor 2  75.8 
 
 
319 aa  431  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01981  peptide chain release factor 2  68.21 
 
 
354 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0513147  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02001  peptide chain release factor 2  67.86 
 
 
354 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0182  peptide chain release factor 2  67.86 
 
 
354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02091  peptide chain release factor 2  67.86 
 
 
354 aa  394  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15725  predicted protein  56.46 
 
 
278 aa  324  1e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0450714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  55.87 
 
 
367 aa  324  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  54.84 
 
 
367 aa  324  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  54.64 
 
 
366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  54.04 
 
 
330 aa  319  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  52.84 
 
 
372 aa  319  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  54.12 
 
 
367 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  51.6 
 
 
365 aa  317  2e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  53.02 
 
 
383 aa  317  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  52.16 
 
 
362 aa  316  3e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  52.16 
 
 
364 aa  315  4e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  53.05 
 
 
380 aa  315  7e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  52.69 
 
 
380 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  52.69 
 
 
380 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  54.29 
 
 
368 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  53.21 
 
 
329 aa  314  9.999999999999999e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  52.69 
 
 
326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  52.69 
 
 
326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  51.97 
 
 
327 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  51.28 
 
 
373 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  54.24 
 
 
367 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  52.69 
 
 
326 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  52.33 
 
 
380 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  53.87 
 
 
367 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  51.6 
 
 
332 aa  308  5e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  54.64 
 
 
332 aa  308  8e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  51.61 
 
 
326 aa  308  9e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  53.52 
 
 
366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  50.18 
 
 
357 aa  306  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  50.88 
 
 
377 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  52.3 
 
 
362 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  49.82 
 
 
369 aa  305  6e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  49.82 
 
 
331 aa  304  9.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21873  predicted protein  54.68 
 
 
406 aa  304  1.0000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  52.45 
 
 
331 aa  302  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  52.75 
 
 
356 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  52.01 
 
 
357 aa  301  7.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  50.71 
 
 
371 aa  301  8.000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  52.75 
 
 
364 aa  301  8.000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  52.01 
 
 
366 aa  301  9e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  51.66 
 
 
369 aa  301  1e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  50 
 
 
323 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  53.38 
 
 
372 aa  300  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  52.03 
 
 
326 aa  300  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  49.82 
 
 
367 aa  300  2e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  51.47 
 
 
372 aa  299  4e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  52.01 
 
 
330 aa  298  5e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  53.02 
 
 
378 aa  298  5e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  52.14 
 
 
369 aa  298  8e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1715  peptide chain release factor 2  49.65 
 
 
322 aa  296  2e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.833664  normal  0.278616 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  51.57 
 
 
373 aa  297  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  54.15 
 
 
366 aa  297  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  52.31 
 
 
375 aa  296  3e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  51.57 
 
 
371 aa  295  5e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  51.23 
 
 
367 aa  295  6e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  51.57 
 
 
373 aa  295  6e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  48.29 
 
 
323 aa  295  9e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  51.8 
 
 
369 aa  295  9e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  53.48 
 
 
371 aa  294  1e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0942  peptide chain release factor 2  52.31 
 
 
374 aa  294  1e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0440008  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  50.87 
 
 
368 aa  293  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  52 
 
 
337 aa  293  2e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  49.82 
 
 
378 aa  293  3e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3006  peptide chain release factor 2  51.42 
 
 
322 aa  292  4e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.743846  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  51.6 
 
 
378 aa  292  5e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1409  peptide chain release factor 2  55.86 
 
 
330 aa  291  7e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0056831  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1825  peptide chain release factor 2  47.7 
 
 
322 aa  291  9e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2040  peptide chain release factor 2  48.57 
 
 
322 aa  290  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2851  peptide chain release factor 2  50.71 
 
 
322 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205155  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2445  peptide chain release factor 2  50.71 
 
 
322 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.689282  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20340  peptide chain release factor 2  49.47 
 
 
371 aa  290  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  50.53 
 
 
372 aa  290  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  50.71 
 
 
376 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1034  peptide chain release factor 2  49.82 
 
 
370 aa  289  3e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  47.87 
 
 
322 aa  289  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0023  peptide chain release factor 2  53.24 
 
 
312 aa  288  6e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000581574  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  50.53 
 
 
375 aa  288  7e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1899  peptide chain release factor 2  51.85 
 
 
367 aa  287  2e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0199155  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  48.62 
 
 
371 aa  286  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4162  peptide chain release factor 2  47.89 
 
 
317 aa  286  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.155408 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  48.57 
 
 
372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4671  peptide chain release factor 2  49.29 
 
 
322 aa  285  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3345  peptide chain release factor 2  48.59 
 
 
317 aa  285  5e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.219994  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>