More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_21873 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_21873  predicted protein  100 
 
 		 406 aa  841    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  50.29 
 
 		 356 aa  325  9e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 360 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  49.86 
 
 		 356 aa  323  2e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  48.4 
 
 		 375 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  48.4 
 
 		 365 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  49.29 
 
 		 361 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01981  peptide chain release factor 2  48.57 
 
 		 354 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0513147  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02001  peptide chain release factor 2  48.29 
 
 		 354 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0182  peptide chain release factor 2  49 
 
 		 354 aa  315  7e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0404  peptide chain release factor 2  53.97 
 
 		 304 aa  314  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.660682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  48.12 
 
 		 356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2784  peptide chain release factor 2  54.68 
 
 		 292 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02561  peptide chain release factor 2  49.68 
 
 		 313 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.686331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02091  peptide chain release factor 2  48 
 
 		 354 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27381  peptide chain release factor 2  52.6 
 
 		 319 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1548  peptide chain release factor 2  49.36 
 
 		 313 aa  293  5e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475132  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  43.81 
 
 		 383 aa  289  7e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  42.63 
 
 		 377 aa  285  8e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  42.78 
 
 		 368 aa  282  9e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  41.06 
 
 		 372 aa  279  7e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  41.32 
 
 		 367 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2120  peptide chain release factor 2  54.32 
 
 		 288 aa  277  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  39.04 
 
 		 365 aa  275  7e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  41.79 
 
 		 362 aa  273  3e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  39.52 
 
 		 369 aa  273  5.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  41.5 
 
 		 364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  40.66 
 
 		 357 aa  269  8e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  39.09 
 
 		 380 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  39.09 
 
 		 380 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15725  predicted protein  48.41 
 
 		 278 aa  266  4e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0450714 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  41.24 
 
 		 367 aa  266  5e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  39.24 
 
 		 380 aa  266  7e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  39.3 
 
 		 367 aa  265  1e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  41.62 
 
 		 331 aa  265  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  38.58 
 
 		 380 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  40.24 
 
 		 373 aa  264  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  40.37 
 
 		 367 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  42.51 
 
 		 332 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  40.27 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  38.54 
 
 		 371 aa  259  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  42.57 
 
 		 330 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  40.6 
 
 		 364 aa  257  3e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  42.98 
 
 		 329 aa  253  3e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1409  peptide chain release factor 2  48.5 
 
 		 330 aa  254  3e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0056831  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  36.6 
 
 		 367 aa  254  3e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  40.21 
 
 		 375 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  41.67 
 
 		 331 aa  253  5.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  41.21 
 
 		 371 aa  252  9.000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  41.82 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  39.88 
 
 		 341 aa  251  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  41.57 
 
 		 326 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  41.57 
 
 		 326 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  39.03 
 
 		 356 aa  251  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  37.74 
 
 		 372 aa  251  2e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  38.76 
 
 		 337 aa  251  2e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  38.08 
 
 		 362 aa  250  3e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  45.36 
 
 		 327 aa  250  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  40.56 
 
 		 372 aa  250  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  46.64 
 
 		 369 aa  249  5e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  40.52 
 
 		 332 aa  249  9e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  41.27 
 
 		 326 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  37.5 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  39.36 
 
 		 378 aa  248  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  37.61 
 
 		 367 aa  248  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  38.62 
 
 		 367 aa  248  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  42.13 
 
 		 366 aa  247  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  38.93 
 
 		 369 aa  247  3e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  40.87 
 
 		 364 aa  246  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  39.62 
 
 		 372 aa  246  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  40.92 
 
 		 326 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  39.3 
 
 		 361 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  38.9 
 
 		 378 aa  246  6e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  39.07 
 
 		 372 aa  246  6e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  39.47 
 
 		 371 aa  246  8e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  36.91 
 
 		 366 aa  245  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  48.4 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  44.83 
 
 		 317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  39.82 
 
 		 369 aa  243  6e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  45 
 
 		 330 aa  243  6e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20340  peptide chain release factor 2  38.68 
 
 		 371 aa  243  6e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07580  peptide chain release factor 2  38.58 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.932102  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  38.35 
 
 		 357 aa  241  1e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  40.79 
 
 		 334 aa  240  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0942  peptide chain release factor 2  38.63 
 
 		 374 aa  239  5e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0440008  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  40.06 
 
 		 371 aa  238  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  40.18 
 
 		 371 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  40.18 
 
 		 371 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0705  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  37.1 
 
 		 366 aa  236  4e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  40.36 
 
 		 340 aa  236  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  38.13 
 
 		 367 aa  236  6e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  45.04 
 
 		 330 aa  236  6e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  38.61 
 
 		 378 aa  236  6e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  39.88 
 
 		 371 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  38.9 
 
 		 375 aa  235  1.0000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  40 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1034  peptide chain release factor 2  36.51 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  37.19 
 
 		 364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  41.16 
 
 		 372 aa  233  6e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  39.84 
 
 		 368 aa  232  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>