More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_20340 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_20340  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 371 aa  752    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07580  peptide chain release factor 2  79.67 
 
 		 373 aa  606  9.999999999999999e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.932102  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  77.05 
 
 		 371 aa  584  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1034  peptide chain release factor 2  76.58 
 
 		 370 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  74.32 
 
 		 370 aa  570  1e-161  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  75.55 
 
 		 374 aa  569  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0863  peptide chain release factor 2  74.79 
 
 		 369 aa  570  1e-161  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2666  peptide chain release factor 2  75.14 
 
 		 371 aa  569  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2401  peptide chain release factor 2  75.68 
 
 		 371 aa  570  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0455309 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25200  peptide chain release factor 2  73.5 
 
 		 372 aa  556  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0337024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  67.76 
 
 		 378 aa  527  1e-148  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  65.4 
 
 		 367 aa  505  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0942  peptide chain release factor 2  65.04 
 
 		 374 aa  500  1e-140  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0440008  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  64.48 
 
 		 373 aa  496  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  63.78 
 
 		 373 aa  495  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  65.65 
 
 		 369 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  64.92 
 
 		 371 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  64.92 
 
 		 371 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  65.46 
 
 		 368 aa  490  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  64.64 
 
 		 371 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  63.49 
 
 		 368 aa  487  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  62.91 
 
 		 367 aa  481  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4451  peptide chain release factor 2  62.74 
 
 		 372 aa  477  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1233  peptide chain release factor 2  65.47 
 
 		 370 aa  474  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  62.71 
 
 		 378 aa  472  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  62.06 
 
 		 372 aa  471  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  62.67 
 
 		 368 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3456  peptide chain release factor 2  61.88 
 
 		 371 aa  466  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1264  peptide chain release factor 2  65.84 
 
 		 375 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111402  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  59.67 
 
 		 378 aa  457  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  59.36 
 
 		 375 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3025  peptide chain release factor 2  60.22 
 
 		 371 aa  454  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  59.44 
 
 		 369 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1865  peptide chain release factor 2  62.3 
 
 		 376 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00679931  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  59.39 
 
 		 372 aa  442  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13122  peptide chain release factor 2  62.15 
 
 		 378 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.44652 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  59.12 
 
 		 366 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5798  peptide chain release factor 2  56.91 
 
 		 386 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  48.74 
 
 		 383 aa  344  1e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  47.04 
 
 		 372 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  46.37 
 
 		 367 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  45.83 
 
 		 368 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  48.23 
 
 		 366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  43.85 
 
 		 366 aa  326  4.0000000000000003e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  44.38 
 
 		 373 aa  324  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  46.29 
 
 		 356 aa  323  3e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  44.89 
 
 		 362 aa  323  3e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  45.67 
 
 		 357 aa  322  5e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  46.01 
 
 		 366 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  45.68 
 
 		 377 aa  321  9.999999999999999e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  44.32 
 
 		 364 aa  319  5e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  45.13 
 
 		 367 aa  318  6e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  45.38 
 
 		 362 aa  316  5e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  46.45 
 
 		 356 aa  316  5e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  44.9 
 
 		 365 aa  315  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  44.9 
 
 		 375 aa  315  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  44.44 
 
 		 357 aa  315  6e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  46.47 
 
 		 356 aa  315  9.999999999999999e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  45 
 
 		 361 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  45.92 
 
 		 372 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  43.59 
 
 		 371 aa  311  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  44.63 
 
 		 374 aa  311  1e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  46.72 
 
 		 372 aa  311  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  42.86 
 
 		 380 aa  310  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  46.89 
 
 		 330 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  43.02 
 
 		 367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  46.95 
 
 		 330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  43.02 
 
 		 369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  42.58 
 
 		 380 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  42.86 
 
 		 380 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  42.58 
 
 		 380 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  45.17 
 
 		 332 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  44.57 
 
 		 367 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  45.95 
 
 		 369 aa  305  1.0000000000000001e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  44.16 
 
 		 372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  44.57 
 
 		 360 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  43.48 
 
 		 375 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  47.37 
 
 		 369 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  48.32 
 
 		 375 aa  302  6.000000000000001e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  49.69 
 
 		 330 aa  302  6.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  46.88 
 
 		 327 aa  301  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  44.21 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  40 
 
 		 367 aa  301  2e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  42.6 
 
 		 334 aa  301  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  46.08 
 
 		 331 aa  300  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1904  peptide chain release factor 2  45.99 
 
 		 337 aa  299  7e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.430397  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  44.14 
 
 		 329 aa  298  1e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  45.28 
 
 		 361 aa  298  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  46.25 
 
 		 326 aa  297  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  46.25 
 
 		 326 aa  297  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  45.71 
 
 		 340 aa  297  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  46.15 
 
 		 378 aa  297  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  40 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  46.25 
 
 		 326 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  41.26 
 
 		 367 aa  296  6e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  41.8 
 
 		 367 aa  295  8e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05470  peptide chain release factor 2  40.06 
 
 		 364 aa  294  1e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  44.26 
 
 		 364 aa  295  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01981  peptide chain release factor 2  43.24 
 
 		 354 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0513147  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  45.94 
 
 		 326 aa  293  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>