More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4239 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 341 aa  705    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  53.21 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  53.41 
 
 		 383 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  53.21 
 
 		 380 aa  364  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  52.91 
 
 		 380 aa  363  3e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  52.91 
 
 		 380 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  52.29 
 
 		 380 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  52.6 
 
 		 326 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  52.6 
 
 		 326 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  52.17 
 
 		 327 aa  360  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  52.29 
 
 		 326 aa  360  3e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  52.6 
 
 		 367 aa  358  6e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  51.99 
 
 		 326 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  50.75 
 
 		 372 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  52.45 
 
 		 369 aa  350  2e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  51.84 
 
 		 367 aa  348  1e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 		 329 aa  346  3e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  51.84 
 
 		 367 aa  346  4e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  52.62 
 
 		 326 aa  345  5e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  52 
 
 		 330 aa  345  5e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  49.24 
 
 		 362 aa  345  5e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  51.69 
 
 		 372 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  49.24 
 
 		 364 aa  344  1e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  54.46 
 
 		 375 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  48.95 
 
 		 357 aa  341  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  50 
 
 		 368 aa  340  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  50.46 
 
 		 369 aa  339  4e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  51.69 
 
 		 364 aa  339  5e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  50.91 
 
 		 378 aa  339  5e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  50.46 
 
 		 331 aa  338  7e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  52.8 
 
 		 376 aa  338  9.999999999999999e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  49.69 
 
 		 332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  52.17 
 
 		 376 aa  335  5e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  49.54 
 
 		 375 aa  335  5e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  53.11 
 
 		 375 aa  335  5e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  53.11 
 
 		 364 aa  333  3e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  51.84 
 
 		 366 aa  333  3e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  50.92 
 
 		 372 aa  333  3e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  54.61 
 
 		 317 aa  331  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  50.46 
 
 		 372 aa  331  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  52 
 
 		 369 aa  330  2e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  52.8 
 
 		 375 aa  330  2e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 372 aa  330  3e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  47.08 
 
 		 373 aa  328  6e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  51.84 
 
 		 361 aa  328  6e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  49.69 
 
 		 377 aa  328  9e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  50.47 
 
 		 367 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  49.54 
 
 		 366 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  49.69 
 
 		 330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  50.61 
 
 		 331 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  49.38 
 
 		 369 aa  325  6e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 		 364 aa  325  7e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  49.24 
 
 		 375 aa  325  7e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  48.91 
 
 		 332 aa  325  7e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1623  peptide chain release factor 2  53.44 
 
 		 375 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622299  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2977  peptide chain release factor 2  53.44 
 
 		 375 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3456  peptide chain release factor 2  48.61 
 
 		 371 aa  325  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  49.69 
 
 		 344 aa  324  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  50.93 
 
 		 375 aa  324  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  49.38 
 
 		 376 aa  323  3e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  47.85 
 
 		 372 aa  323  3e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  49.23 
 
 		 368 aa  322  6e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  48.16 
 
 		 378 aa  322  8e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  48.75 
 
 		 369 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1856  peptide chain release factor 2  52.81 
 
 		 375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  48.76 
 
 		 369 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  50.77 
 
 		 371 aa  319  3e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 368 aa  320  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  50.96 
 
 		 322 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 		 330 aa  318  6e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  47.98 
 
 		 362 aa  318  7.999999999999999e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  48.04 
 
 		 371 aa  318  1e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  49.22 
 
 		 366 aa  318  1e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  46.32 
 
 		 332 aa  318  1e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  47.84 
 
 		 368 aa  317  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  45.68 
 
 		 367 aa  317  2e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  50.31 
 
 		 376 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  48.45 
 
 		 375 aa  317  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2982  peptide chain release factor 2  52.81 
 
 		 321 aa  316  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.186364  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  53.9 
 
 		 365 aa  317  3e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3208  peptide chain release factor 2  52.81 
 
 		 321 aa  316  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  48.31 
 
 		 371 aa  316  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  50.45 
 
 		 325 aa  316  3e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3166  peptide chain release factor 2  53.14 
 
 		 321 aa  316  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  48.31 
 
 		 371 aa  316  3e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  60 
 
 		 322 aa  315  7e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  52.8 
 
 		 321 aa  315  7e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0961  peptide chain release factor 2  49.69 
 
 		 342 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  hitchhiker  0.00626958 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  48 
 
 		 371 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  51.37 
 
 		 349 aa  314  9.999999999999999e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  48.47 
 
 		 367 aa  314  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  47.15 
 
 		 372 aa  314  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5845  peptide chain release factor 2  52.13 
 
 		 321 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  47.84 
 
 		 374 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  48 
 
 		 367 aa  313  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  51.06 
 
 		 349 aa  312  4.999999999999999e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4451  peptide chain release factor 2  47.84 
 
 		 372 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  48.6 
 
 		 371 aa  311  9e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  50 
 
 		 376 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5077  peptide chain release factor 2  53.14 
 
 		 321 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30933  normal  0.0341665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>