More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5845 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  96.26 
 
 		 375 aa  634    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5845  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 321 aa  654    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3166  peptide chain release factor 2  88.47 
 
 		 321 aa  592  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2982  peptide chain release factor 2  87.85 
 
 		 321 aa  587  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.186364  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3208  peptide chain release factor 2  87.85 
 
 		 321 aa  587  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5077  peptide chain release factor 2  88.79 
 
 		 321 aa  570  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30933  normal  0.0341665 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  74.84 
 
 		 376 aa  508  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  74.45 
 
 		 344 aa  506  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  73.6 
 
 		 376 aa  499  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  74.61 
 
 		 322 aa  489  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  74.53 
 
 		 376 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  71.03 
 
 		 375 aa  481  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  73.21 
 
 		 322 aa  478  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1305  peptide chain release factor 2  75.96 
 
 		 376 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  69.47 
 
 		 321 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0961  peptide chain release factor 2  74.29 
 
 		 342 aa  473  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  hitchhiker  0.00626958 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  71.65 
 
 		 376 aa  461  1e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4671  peptide chain release factor 2  68.01 
 
 		 322 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  68.85 
 
 		 375 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  65.33 
 
 		 323 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2040  peptide chain release factor 2  66.25 
 
 		 322 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  67.91 
 
 		 375 aa  442  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  66.36 
 
 		 375 aa  444  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1715  peptide chain release factor 2  66.46 
 
 		 322 aa  437  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.833664  normal  0.278616 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1825  peptide chain release factor 2  65.22 
 
 		 322 aa  437  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  66.15 
 
 		 376 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3006  peptide chain release factor 2  66.46 
 
 		 322 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.743846  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2445  peptide chain release factor 2  65.53 
 
 		 322 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.689282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  65.48 
 
 		 323 aa  426  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2851  peptide chain release factor 2  64.29 
 
 		 322 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1623  peptide chain release factor 2  63.92 
 
 		 375 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622299  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2575  peptide chain release factor 2  63.43 
 
 		 367 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2977  peptide chain release factor 2  63.92 
 
 		 375 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1856  peptide chain release factor 2  62.66 
 
 		 375 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  62.34 
 
 		 402 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  62.18 
 
 		 375 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2533  peptide chain release factor 2  61.08 
 
 		 375 aa  371  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0868  peptide chain release factor 2  57.91 
 
 		 374 aa  371  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1299  peptide chain release factor 2  60.19 
 
 		 321 aa  370  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0921443  normal  0.567483 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  56.86 
 
 		 372 aa  360  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4122  peptide chain release factor 2  55.96 
 
 		 304 aa  358  7e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4227  peptide chain release factor 2  55.96 
 
 		 304 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358427  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  55.45 
 
 		 379 aa  353  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2271  peptide chain release factor 2  55.74 
 
 		 310 aa  352  4e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  55.7 
 
 		 332 aa  350  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  53.27 
 
 		 317 aa  351  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3371  peptide chain release factor 2  55.7 
 
 		 378 aa  350  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  56.86 
 
 		 326 aa  350  3e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  55.23 
 
 		 364 aa  350  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  54.79 
 
 		 371 aa  349  5e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1100  peptide chain release factor 2  56.29 
 
 		 304 aa  348  5e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  55.05 
 
 		 382 aa  347  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  54.43 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  54.43 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  54.43 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  54.43 
 
 		 365 aa  346  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  54.43 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  54.05 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  61.51 
 
 		 375 aa  345  7e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  53.77 
 
 		 325 aa  345  7e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  55.41 
 
 		 349 aa  345  7e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  54.75 
 
 		 364 aa  344  1e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  54.1 
 
 		 365 aa  343  2e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  53.11 
 
 		 365 aa  343  2.9999999999999997e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2274  peptide chain release factor 2  53.72 
 
 		 310 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  54.43 
 
 		 349 aa  342  2.9999999999999997e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  52.13 
 
 		 369 aa  342  5.999999999999999e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  53.77 
 
 		 365 aa  342  7e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  53.77 
 
 		 365 aa  341  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  52.43 
 
 		 367 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  52.43 
 
 		 367 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  52.43 
 
 		 367 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  52.44 
 
 		 357 aa  340  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  52.43 
 
 		 349 aa  340  2e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  55.1 
 
 		 367 aa  340  2e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  54.76 
 
 		 367 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  56.75 
 
 		 366 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1310  peptide chain release factor 2  53.75 
 
 		 329 aa  339  4e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.496606  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  53.23 
 
 		 380 aa  339  4e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0793  peptide chain release factor 2  54.75 
 
 		 331 aa  339  4e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  53.44 
 
 		 365 aa  339  4e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1500  hypothetical protein  56.16 
 
 		 293 aa  338  5e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  55.59 
 
 		 364 aa  338  5.9999999999999996e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  52.75 
 
 		 367 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1069  peptide chain release factor 2  53.4 
 
 		 347 aa  338  7e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0923  peptide chain release factor 2  53.44 
 
 		 310 aa  338  7e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  53.44 
 
 		 365 aa  338  8e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  52.9 
 
 		 380 aa  338  8e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  53.47 
 
 		 340 aa  338  8e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  52.43 
 
 		 406 aa  338  9e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  53.44 
 
 		 365 aa  337  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  52.1 
 
 		 391 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  52.1 
 
 		 391 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  52.1 
 
 		 391 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  51.46 
 
 		 417 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  52.9 
 
 		 380 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  52.1 
 
 		 391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  52.9 
 
 		 380 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  53.11 
 
 		 365 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  51.79 
 
 		 357 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>