More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1289 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 369 aa  759    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05470  peptide chain release factor 2  57.85 
 
 		 364 aa  442  1e-123  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1999  peptide chain release factor 2  56.71 
 
 		 364 aa  415  9.999999999999999e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.285694  hitchhiker  0.0000104835 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09020  peptide chain release factor 2  55.77 
 
 		 369 aa  417  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.140459  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  48.75 
 
 		 371 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  48.89 
 
 		 372 aa  354  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  49.44 
 
 		 367 aa  349  3e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  51.18 
 
 		 364 aa  346  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  49.72 
 
 		 383 aa  344  2e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  48.27 
 
 		 378 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  47.63 
 
 		 378 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  46.91 
 
 		 375 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  47.59 
 
 		 372 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  48.14 
 
 		 366 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  49.15 
 
 		 367 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  49.25 
 
 		 367 aa  335  1e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  47.04 
 
 		 367 aa  334  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  46.76 
 
 		 368 aa  332  7.000000000000001e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  50.91 
 
 		 340 aa  330  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  50.46 
 
 		 332 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  46.81 
 
 		 372 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  49.01 
 
 		 366 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  46.33 
 
 		 380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  46.37 
 
 		 366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1233  peptide chain release factor 2  48.34 
 
 		 370 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  48.68 
 
 		 369 aa  326  3e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  47.75 
 
 		 372 aa  326  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  46.05 
 
 		 380 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  46.05 
 
 		 380 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  45.76 
 
 		 380 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  49.38 
 
 		 341 aa  325  6e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  46.24 
 
 		 369 aa  323  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2666  peptide chain release factor 2  46.76 
 
 		 371 aa  323  4e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  46.72 
 
 		 369 aa  323  4e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3456  peptide chain release factor 2  46.43 
 
 		 371 aa  322  7e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  47.32 
 
 		 367 aa  322  9.000000000000001e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  46.09 
 
 		 371 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  46.09 
 
 		 371 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  46.43 
 
 		 371 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0942  peptide chain release factor 2  48.8 
 
 		 374 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0440008  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1034  peptide chain release factor 2  45.92 
 
 		 370 aa  320  3e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  48.31 
 
 		 368 aa  320  3e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  45.81 
 
 		 371 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  47.06 
 
 		 373 aa  318  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  48.58 
 
 		 378 aa  317  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  47.06 
 
 		 373 aa  318  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  52.05 
 
 		 317 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2401  peptide chain release factor 2  46.2 
 
 		 371 aa  317  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0455309 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  46.53 
 
 		 361 aa  316  5e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07580  peptide chain release factor 2  44.51 
 
 		 373 aa  315  8e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.932102  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4451  peptide chain release factor 2  44.97 
 
 		 372 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  46.31 
 
 		 377 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  44.48 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  46.36 
 
 		 357 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3025  peptide chain release factor 2  44.41 
 
 		 371 aa  313  3.9999999999999997e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  45.71 
 
 		 368 aa  311  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  44.16 
 
 		 373 aa  310  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  45.32 
 
 		 367 aa  310  2e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  46.29 
 
 		 364 aa  310  2e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  46.87 
 
 		 374 aa  311  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  44.2 
 
 		 370 aa  310  2e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  47.02 
 
 		 327 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  48.6 
 
 		 326 aa  309  5e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  44.35 
 
 		 372 aa  308  9e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  45.87 
 
 		 376 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  47.02 
 
 		 326 aa  306  3e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  47.02 
 
 		 326 aa  306  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  45.13 
 
 		 374 aa  306  3e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  43.59 
 
 		 367 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  43.02 
 
 		 366 aa  306  4.0000000000000004e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  47.58 
 
 		 375 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  47.02 
 
 		 326 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  47.04 
 
 		 376 aa  305  7e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  43.79 
 
 		 367 aa  305  7e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  46.44 
 
 		 365 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  46.44 
 
 		 365 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  46.44 
 
 		 365 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20340  peptide chain release factor 2  45.95 
 
 		 371 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  47.68 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  44.74 
 
 		 367 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  48.63 
 
 		 343 aa  303  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  46.44 
 
 		 365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  46.33 
 
 		 369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  45.18 
 
 		 378 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  46.67 
 
 		 332 aa  303  3.0000000000000004e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  46.15 
 
 		 365 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  44.03 
 
 		 379 aa  302  7.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  42.18 
 
 		 362 aa  302  8.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  43.68 
 
 		 369 aa  302  8.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  45.77 
 
 		 326 aa  301  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0863  peptide chain release factor 2  45.35 
 
 		 369 aa  301  1e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  46.34 
 
 		 375 aa  300  2e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25200  peptide chain release factor 2  44.02 
 
 		 372 aa  300  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0337024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5798  peptide chain release factor 2  48.75 
 
 		 386 aa  299  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  44.89 
 
 		 367 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  44.89 
 
 		 367 aa  299  4e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  44.89 
 
 		 367 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  47.48 
 
 		 369 aa  299  6e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  41.62 
 
 		 364 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2808  LigA  46.36 
 
 		 372 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.999954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>