More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_2808 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2808  LigA  100 
 
 
372 aa  748    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.999954  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2901  peptide chain release factor 2  99.03 
 
 
309 aa  621  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2716  peptide chain release factor 2  97.73 
 
 
309 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629522  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2708  peptide chain release factor 2  85.76 
 
 
309 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.215879  normal  0.913417 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  55.34 
 
 
372 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  54.04 
 
 
371 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  55.94 
 
 
364 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  53.35 
 
 
372 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  57.96 
 
 
317 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  54.09 
 
 
375 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  54.13 
 
 
378 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  54.97 
 
 
376 aa  368  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  51.97 
 
 
379 aa  363  4e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  49.31 
 
 
371 aa  362  8e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  51.42 
 
 
376 aa  361  1e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  53.18 
 
 
361 aa  357  9.999999999999999e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  48.2 
 
 
369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  50.27 
 
 
374 aa  354  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  53.75 
 
 
340 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  53.25 
 
 
326 aa  351  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  51.7 
 
 
376 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  48.6 
 
 
367 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  48.04 
 
 
367 aa  350  3e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  53.07 
 
 
344 aa  349  5e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  50 
 
 
365 aa  347  1e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  50 
 
 
375 aa  348  1e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  57.19 
 
 
322 aa  348  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  51.85 
 
 
329 aa  347  2e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4671  peptide chain release factor 2  57.84 
 
 
322 aa  345  5e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  46.54 
 
 
369 aa  346  5e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  49.44 
 
 
365 aa  343  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  49.44 
 
 
365 aa  344  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  49.44 
 
 
365 aa  343  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  49.44 
 
 
365 aa  343  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  51.13 
 
 
366 aa  342  4e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  50.97 
 
 
364 aa  342  4e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  50.72 
 
 
377 aa  342  7e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  47.47 
 
 
371 aa  341  1e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  49.71 
 
 
354 aa  341  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  50.7 
 
 
364 aa  341  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  46.78 
 
 
373 aa  340  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  54.55 
 
 
325 aa  340  2e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  46.39 
 
 
364 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3166  peptide chain release factor 2  55.23 
 
 
321 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  49.16 
 
 
365 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  50.85 
 
 
376 aa  338  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  45.15 
 
 
365 aa  338  7e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2982  peptide chain release factor 2  54.58 
 
 
321 aa  338  9e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.186364  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3208  peptide chain release factor 2  54.58 
 
 
321 aa  338  9e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5845  peptide chain release factor 2  54.58 
 
 
321 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  49.15 
 
 
367 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  49.15 
 
 
367 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  46.81 
 
 
366 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  48.86 
 
 
369 aa  337  9.999999999999999e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  45.76 
 
 
380 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  50.85 
 
 
375 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  48.86 
 
 
368 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0961  peptide chain release factor 2  53.37 
 
 
342 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  hitchhiker  0.00626958 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  45.48 
 
 
380 aa  336  5e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  45.76 
 
 
380 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  48.32 
 
 
365 aa  335  7e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0500  peptide chain release factor 2  45.94 
 
 
364 aa  335  7e-91  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1305  peptide chain release factor 2  50.57 
 
 
376 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  48.86 
 
 
367 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  48.86 
 
 
459 aa  334  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5077  peptide chain release factor 2  55.23 
 
 
321 aa  334  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30933  normal  0.0341665 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  50.29 
 
 
349 aa  335  1e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  50 
 
 
365 aa  334  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 
331 aa  335  1e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  48.32 
 
 
365 aa  334  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  47.91 
 
 
365 aa  333  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  45.48 
 
 
380 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  46.07 
 
 
367 aa  333  2e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  48.04 
 
 
365 aa  333  3e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  49.01 
 
 
383 aa  333  3e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  48.32 
 
 
365 aa  333  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  46.49 
 
 
367 aa  332  5e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  47.03 
 
 
375 aa  332  6e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  50 
 
 
349 aa  332  7.000000000000001e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  47.73 
 
 
376 aa  332  9e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0251  peptide chain release factor 2  47.25 
 
 
372 aa  330  3e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00360033  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  46.63 
 
 
367 aa  329  4e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  49.28 
 
 
375 aa  329  4e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  45.89 
 
 
362 aa  329  4e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0584  peptide chain release factor 2  47.61 
 
 
366 aa  329  5.0000000000000004e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  47.49 
 
 
365 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  48.01 
 
 
369 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  50.99 
 
 
367 aa  329  6e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  50.71 
 
 
367 aa  328  8e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2773  peptide chain release factor 2  49.56 
 
 
355 aa  328  8e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  50.63 
 
 
332 aa  328  9e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  52.27 
 
 
330 aa  328  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  47.49 
 
 
375 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  49.17 
 
 
375 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  45.61 
 
 
364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  56.17 
 
 
322 aa  326  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2977  peptide chain release factor 2  48.61 
 
 
375 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  49.3 
 
 
367 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  46.45 
 
 
357 aa  326  5e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1715  peptide chain release factor 2  53.92 
 
 
322 aa  325  6e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.833664  normal  0.278616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>